|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000184:125906..127603- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_007360-T1 ID=ATCC10864_007360-T1|Name=ATCC10864_007360-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1698bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000184:125906..127603- (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGCTGACATGCCCATTGGTATGTTTATGCGTGTTCCCCCTCCTCTTCC
TTACCTTCATCTTCCCTTACCCCCTCCCCGAGTTCTCCTTGTCGGTGCCT
GTCCCTCCCGTGCTTCCCAGCTAACCAACCACGCCCCCCAGTGCTCGACG
GAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGGTCTGTCATCAC
CTCCCATCCCATTGCGTACTCTTACTTACCTCCTCTTCTTCCCCATGGAT
AGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTG
CGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGG
AGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTGTAC
GTCATTTACATTCGCGTGCCTTCGTTCTCCCCCCACCCCCGATCGCTCCA
TTGTCTCCCCGGAGGTGTGGCAGACGTGTTAACGTTGGGCCCGACTTGGT
ATACAGATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCT
ATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCA
AGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAA
ATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGC
TATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTAAGTCTTGCACGCTTC
ATATCCTCTCTCTTATCCCGCAGCTCTGATCGCCCGCTCTTTCGCAATCC
ACAGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCA
CATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGC
TTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTC
CGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCA
GATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGA
AGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGAT
GGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCT
CTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGC
TCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTAC
AAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTC
CCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAG
GCAACCCGGAGAGGTTGAACGTACGTGTTCTCATTCACTGGCGGACCATA
CCCCCCCCCCCCCCCCAGAAGAAATCAACAGCTAATTCCATGATACAGAA
GTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCC
TGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTAAGCTTCTTCACTTCTTCCCTC
CTTCCCCTGTACACCCGTTTTCCAGTTCGAAAATCACACCATAGCTAACA
TAATTACCTAGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAG
TGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000184:125906..127603- >ATCC10864_007360-T1 ID=ATCC10864_007360-T1|Name=ATCC10864_007360-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=8169bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000184:125906..127603- (Aspergillus niger ATCC 10864) ATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACA GGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGC GCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCC GTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGAC GGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCA CATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCG CCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAA ACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGA GTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACA CCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCC CCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTAT CGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCT CCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCC GGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACG GGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGA AGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAG ATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCAT GAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCT ACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATAC GCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCA TATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATG TGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCC TTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGAT GGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAG CAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAG ATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGG TCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGG TCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCC ACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGT CACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACC GTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTAT GTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGT CCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCA GCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGAT GTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGC CGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAG GAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAG CAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAT GGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACT ACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTC TTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGA GGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAG CTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTC GATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTG TCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATG CTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTC GGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGG ACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTG GCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCC GCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGG TCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTA TCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGAT GTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCG CGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCA AGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTC TCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCG CGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCC AGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTC AACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGC TATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGT TGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAAC CCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACAT GCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTA CGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAAC CGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGT ATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCC GAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGA GCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTG CTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAA CTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATT GATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAAC AGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTG CGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGC CGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGA CGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACC ACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATC GCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGA AACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCG AGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTAC ACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGC CCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTA TCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGC TCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCC CGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACAC GGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTG AAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAA GATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCA TGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGC TACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATA CGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCC ATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCAT GTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACC CTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGA TGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAA GCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTA GATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATG GTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTG GTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATC CACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATG TCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAAC CGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTA TGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCG TCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGC AGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGA TGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCG CCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGA GGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAA GCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACA TGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAAC TACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCT CTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTG AGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAA GCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCT CGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATT GTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTAT GCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGT CGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAG GACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCT GGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCC CGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTG GTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATT ATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGA TGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTC GCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATC AAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCT CTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTC GCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTC CAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTT CAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGG CTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGG TTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAA CCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACA TGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCT ACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAA CCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTG TATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCC CGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGG AGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCT GCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGA ACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCAT TGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAA CAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGT GCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTG CCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTG ACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCAC CACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCAT CGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCG AAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTC GAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTA CACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAG CCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGT ATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCG CTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACC CCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACA CGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGT GAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGA AGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCC ATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGG CTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTAT ACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCC CATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCA TGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTAC CCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAG ATGGCTGACATGCCCATTG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
InterPro | IPR004000 |
PFAM | PF00022 |
InterPro | IPR043129 |
InterPro | IPR020902 |
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09262MEK |
Product | actin nucleation center |
Product | Arp2/3 complex subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
MCQH01000184 | supercontig | MCQH01000184:125906..127603 - |
|