|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000184:125906..127603- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_007360-T1 ID=ATCC10864_007360-T1|Name=ATCC10864_007360-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1698bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000184:125906..127603- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGGCTGACATGCCCATTGGTATGTTTATGCGTGTTCCCCCTCCTCTTCC
TTACCTTCATCTTCCCTTACCCCCTCCCCGAGTTCTCCTTGTCGGTGCCT
GTCCCTCCCGTGCTTCCCAGCTAACCAACCACGCCCCCCAGTGCTCGACG
GAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGGTCTGTCATCAC
CTCCCATCCCATTGCGTACTCTTACTTACCTCCTCTTCTTCCCCATGGAT
AGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTG
CGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGG
AGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTGTAC
GTCATTTACATTCGCGTGCCTTCGTTCTCCCCCCACCCCCGATCGCTCCA
TTGTCTCCCCGGAGGTGTGGCAGACGTGTTAACGTTGGGCCCGACTTGGT
ATACAGATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCT
ATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCA
AGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAA
ATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGC
TATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTAAGTCTTGCACGCTTC
ATATCCTCTCTCTTATCCCGCAGCTCTGATCGCCCGCTCTTTCGCAATCC
ACAGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCA
CATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGC
TTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTC
CGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCA
GATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGA
AGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGAT
GGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCT
CTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGC
TCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTAC
AAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTC
CCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAG
GCAACCCGGAGAGGTTGAACGTACGTGTTCTCATTCACTGGCGGACCATA
CCCCCCCCCCCCCCCCAGAAGAAATCAACAGCTAATTCCATGATACAGAA
GTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCC
TGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTAAGCTTCTTCACTTCTTCCCTC
CTTCCCCTGTACACCCGTTTTCCAGTTCGAAAATCACACCATAGCTAACA
TAATTACCTAGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAG
TGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000184:125906..127603- >ATCC10864_007360-T1 ID=ATCC10864_007360-T1|Name=ATCC10864_007360-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=8169bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000184:125906..127603- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACA
GGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGC
GCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCC
GTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGAC
GGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCA
CATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCG
CCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAA
ACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGA
GTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACA
CCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCC
CCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTAT
CGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCT
CCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCC
GGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACG
GGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGA
AGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAG
ATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCAT
GAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCT
ACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATAC
GCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCA
TATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATG
TGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCC
TTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGAT
GGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAG
CAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAG
ATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGG
TCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGG
TCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCC
ACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGT
CACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACC
GTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTAT
GTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGT
CCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCA
GCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGAT
GTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGC
CGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAG
GAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAG
CAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAT
GGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACT
ACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTC
TTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGA
GGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAG
CTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTC
GATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTG
TCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATG
CTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTC
GGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGG
ACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTG
GCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCC
GCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGG
TCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTA
TCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGAT
GTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCG
CGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCA
AGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTC
TCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCG
CGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCC
AGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTC
AACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGC
TATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGT
TGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAAC
CCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACAT
GCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTA
CGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAAC
CGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGT
ATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCC
GAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGA
GCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTG
CTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAA
CTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATT
GATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAAC
AGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTG
CGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGC
CGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGA
CGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACC
ACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATC
GCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGA
AACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCG
AGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTAC
ACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGC
CCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTA
TCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGC
TCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCC
CGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACAC
GGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTG
AAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAA
GATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCA
TGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGC
TACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATA
CGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCC
ATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCAT
GTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACC
CTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGA
TGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAA
GCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTA
GATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATG
GTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTG
GTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATC
CACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATG
TCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAAC
CGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTA
TGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCG
TCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGC
AGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGA
TGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCG
CCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGA
GGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAA
GCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACA
TGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAAC
TACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCT
CTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTG
AGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAA
GCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCT
CGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATT
GTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTAT
GCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGT
CGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAG
GACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCT
GGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCC
CGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTG
GTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATT
ATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGA
TGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTC
GCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATC
AAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCT
CTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTC
GCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTC
CAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTT
CAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGG
CTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGG
TTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAA
CCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACA
TGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCT
ACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAA
CCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTG
TATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCC
CGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGG
AGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCT
GCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGA
ACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCAT
TGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAA
CAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGT
GCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTG
CCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTG
ACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCAC
CACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCAT
CGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCG
AAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTC
GAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTA
CACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAG
CCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGT
ATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCCGATGTCGATGTGCG
CTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACC
CCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACA
CGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGT
GAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGA
AGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCC
ATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGG
CTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTAT
ACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCC
CATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCA
TGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTAC
CCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAG
ATGGCTGACATGCCCATTG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| InterPro | IPR004000 |
| PFAM | PF00022 |
| InterPro | IPR043129 |
| InterPro | IPR020902 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG09262MEK |
| Product | actin nucleation center |
| Product | Arp2/3 complex subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| MCQH01000184 | supercontig | MCQH01000184:125906..127603 - |
|
