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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000199:1082164..1084426+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_008581-T1 ID=ATCC10864_008581-T1|Name=ATCC10864_008581-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=2263bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000199:1082164..1084426+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGGTCTGTAT
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TGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCAC
ATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCT
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CCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGA
CCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCG
TCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTC
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GCGTGTTTACTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000199:1082164..1084426+ >ATCC10864_008581-T1 ID=ATCC10864_008581-T1|Name=ATCC10864_008581-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=11646bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000199:1082164..1084426+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATTTCCCG CGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGA TATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCT CAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGC TGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCA ACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCC GCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGATGACTG GAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACC AGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAG CTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTA CCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGG CCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCAC ACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0022900 | electron transport chain |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0050660 | flavin adenine dinucleotide binding |
GO:0016627 | oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors |
GO:0016491 | oxidoreductase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
InterPro | IPR027477 |
InterPro | IPR014006 |
InterPro | IPR003952 |
PFAM | PF02910 |
InterPro | IPR003953 |
InterPro | IPR037099 |
PFAM | PF00890 |
InterPro | IPR015939 |
InterPro | IPR036188 |
InterPro | IPR011281 |
Properties
Property Name | Value |
Product | succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
MCQH01000199 | supercontig | MCQH01000199:1082164..1084426 + |
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