|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000199:1181055..1182214- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_008616-T1 ID=ATCC10864_008616-T1|Name=ATCC10864_008616-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1160bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000199:1181055..1182214- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGAAGCTTACCCTCATCCTCACCCTCCTGGCCACCCTAGTGGCCTCCAT
CCCCGCCGATGGCTCAAGCTTCACAGACATCTGTAAGCCAACACCCCAGC
AACCCAACCAAAAAAAACATAGCCTGGCACCACTTACTGAACTTACCAGA
CAACCCACTGTGCCACAAGAACTCCGACTGCGGAACCGGATGCTGCTACA
ACGGTCTCTGTCTCGCCTACTGTCTCCACAATGAGGATGATGTTCACACG
GACCTAGTCCGCAGTCTTGTCGATGGTAGTTACCTCACTCACTTTACGCA
TAGTATGAAACCTACTAACTAAAACCCATCCAGAATCCCTCCTCCGCACA
GAAGAGAATTTAGATATTACCGCCCCCGTCTGCCACACAAACAGGGACTG
CGGAACTGGATGTTGCTACCACGGCCTTTGTCTCGCGTATTGTCCTAATG
ATATGGCGAAGCGGGGTGATGGGGGTGCTAGTTGGGGTGAGCTTTCCTTA
TTCTTTGGTATATTATAGGTGGGTTAGATTGGATGTATAGGCTAATCATG
ATCTTATTGGAATAGAGTCCCCAGGCAGGCCTCCGAAGTGCAGCCGGCGG
ACTTGCAAGGGTGGGTGCTGTCGTAAGGGTCTTTGTGTGTATTGCTATAT
GGATAAGCGAGATGATCTTGAAGATCCCATCGATGCTTTTGGTTATGCTG
TTGATGTTGATGTTGATGCTGACGCTGGTTTCGATGTCAATGTCGATGCC
GACATCTTCGATGATAGCGACGACGCAGCACAAGAACCAGCATCGGAGAT
GATGCACAAGAGTGAGTCCCGACCTTACCTCCTCTCTTCGAATTACTTCT
CATGAAAAGACCAGGATACTCCATGCCCGACACCGACCTGCTTCCCACCT
CAACAGACATAATCCACACCGGAGGCATGTGCAGCAAGAGAACGTGCAAG
GGATGCTGCTGGCAGAATATCTGTATGGCCAAGTGTCCTCGCGGTGAGCG
GGATGAAGCTGTAGATGATGGTGAAGGATCCGAAGAGACTTCTCTCGATC
TTGTAGACTGGAACCTCCCGCAGGTTGTCTGCAGCCGTGCAGCCCCATGT
AAAGTTGGATGCTGCTGGCATGGATTGTGTTGGGGTTTGTGTCGGTGGGA
AGATAATTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000199:1181055..1182214- >ATCC10864_008616-T1 ID=ATCC10864_008616-T1|Name=ATCC10864_008616-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=4620bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000199:1181055..1182214- (Aspergillus niger ATCC 10864)
GATACTCCATGCCCGACACCGACCTGCTTCCCACCTCAACAGACATAATC
CACACCGGAGGCATGTGCAGCAAGAGAACGTGCAAGGGATGCTGCTGGCA
GAATATCTGTATGGCCAAGTGTCCTCGCGGTGAGCGGGATGAAGCTGTAG
ATGATGGTGAAGGATCCGAAGAGACTTCTCTCGATCTTGTAGACTGGAAC
CTCCCGCAGGTTGTCTGCAGCCGTGCAGCCCCATGTAAAGTTGGATGCTG
CTGGCATGGATTGTGTTGGGGTTTGTGTCGGTGGGAAGATAATTAGAGTC
CCCAGGCAGGCCTCCGAAGTGCAGCCGGCGGACTTGCAAGGGTGGGTGCT
GTCGTAAGGGTCTTTGTGTGTATTGCTATATGGATAAGCGAGATGATCTT
GAAGATCCCATCGATGCTTTTGGTTATGCTGTTGATGTTGATGTTGATGC
TGACGCTGGTTTCGATGTCAATGTCGATGCCGACATCTTCGATGATAGCG
ACGACGCAGCACAAGAACCAGCATCGGAGATGATGCACAAGAAATCCCTC
CTCCGCACAGAAGAGAATTTAGATATTACCGCCCCCGTCTGCCACACAAA
CAGGGACTGCGGAACTGGATGTTGCTACCACGGCCTTTGTCTCGCGTATT
GTCCTAATGATATGGCGAAGCGGGGTGATGGGGGTGCTAGTTGGGGTGAG
CTTTCCTTATTCTTTGACAACCCACTGTGCCACAAGAACTCCGACTGCGG
AACCGGATGCTGCTACAACGGTCTCTGTCTCGCCTACTGTCTCCACAATG
AGGATGATGTTCACACGGACCTAGTCCGCAGTCTTGTCGATGATGAAGCT
TACCCTCATCCTCACCCTCCTGGCCACCCTAGTGGCCTCCATCCCCGCCG
ATGGCTCAAGCTTCACAGACATCTGATACTCCATGCCCGACACCGACCTG
CTTCCCACCTCAACAGACATAATCCACACCGGAGGCATGTGCAGCAAGAG
AACGTGCAAGGGATGCTGCTGGCAGAATATCTGTATGGCCAAGTGTCCTC
GCGGTGAGCGGGATGAAGCTGTAGATGATGGTGAAGGATCCGAAGAGACT
TCTCTCGATCTTGTAGACTGGAACCTCCCGCAGGTTGTCTGCAGCCGTGC
AGCCCCATGTAAAGTTGGATGCTGCTGGCATGGATTGTGTTGGGGTTTGT
GTCGGTGGGAAGATAATTAGAGTCCCCAGGCAGGCCTCCGAAGTGCAGCC
GGCGGACTTGCAAGGGTGGGTGCTGTCGTAAGGGTCTTTGTGTGTATTGC
TATATGGATAAGCGAGATGATCTTGAAGATCCCATCGATGCTTTTGGTTA
TGCTGTTGATGTTGATGTTGATGCTGACGCTGGTTTCGATGTCAATGTCG
ATGCCGACATCTTCGATGATAGCGACGACGCAGCACAAGAACCAGCATCG
GAGATGATGCACAAGAAATCCCTCCTCCGCACAGAAGAGAATTTAGATAT
TACCGCCCCCGTCTGCCACACAAACAGGGACTGCGGAACTGGATGTTGCT
ACCACGGCCTTTGTCTCGCGTATTGTCCTAATGATATGGCGAAGCGGGGT
GATGGGGGTGCTAGTTGGGGTGAGCTTTCCTTATTCTTTGACAACCCACT
GTGCCACAAGAACTCCGACTGCGGAACCGGATGCTGCTACAACGGTCTCT
GTCTCGCCTACTGTCTCCACAATGAGGATGATGTTCACACGGACCTAGTC
CGCAGTCTTGTCGATGATGAAGCTTACCCTCATCCTCACCCTCCTGGCCA
CCCTAGTGGCCTCCATCCCCGCCGATGGCTCAAGCTTCACAGACATCTGA
TACTCCATGCCCGACACCGACCTGCTTCCCACCTCAACAGACATAATCCA
CACCGGAGGCATGTGCAGCAAGAGAACGTGCAAGGGATGCTGCTGGCAGA
ATATCTGTATGGCCAAGTGTCCTCGCGGTGAGCGGGATGAAGCTGTAGAT
GATGGTGAAGGATCCGAAGAGACTTCTCTCGATCTTGTAGACTGGAACCT
CCCGCAGGTTGTCTGCAGCCGTGCAGCCCCATGTAAAGTTGGATGCTGCT
GGCATGGATTGTGTTGGGGTTTGTGTCGGTGGGAAGATAATTAGAGTCCC
CAGGCAGGCCTCCGAAGTGCAGCCGGCGGACTTGCAAGGGTGGGTGCTGT
CGTAAGGGTCTTTGTGTGTATTGCTATATGGATAAGCGAGATGATCTTGA
AGATCCCATCGATGCTTTTGGTTATGCTGTTGATGTTGATGTTGATGCTG
ACGCTGGTTTCGATGTCAATGTCGATGCCGACATCTTCGATGATAGCGAC
GACGCAGCACAAGAACCAGCATCGGAGATGATGCACAAGAAATCCCTCCT
CCGCACAGAAGAGAATTTAGATATTACCGCCCCCGTCTGCCACACAAACA
GGGACTGCGGAACTGGATGTTGCTACCACGGCCTTTGTCTCGCGTATTGT
CCTAATGATATGGCGAAGCGGGGTGATGGGGGTGCTAGTTGGGGTGAGCT
TTCCTTATTCTTTGACAACCCACTGTGCCACAAGAACTCCGACTGCGGAA
CCGGATGCTGCTACAACGGTCTCTGTCTCGCCTACTGTCTCCACAATGAG
GATGATGTTCACACGGACCTAGTCCGCAGTCTTGTCGATGATGAAGCTTA
CCCTCATCCTCACCCTCCTGGCCACCCTAGTGGCCTCCATCCCCGCCGAT
GGCTCAAGCTTCACAGACATCTGATACTCCATGCCCGACACCGACCTGCT
TCCCACCTCAACAGACATAATCCACACCGGAGGCATGTGCAGCAAGAGAA
CGTGCAAGGGATGCTGCTGGCAGAATATCTGTATGGCCAAGTGTCCTCGC
GGTGAGCGGGATGAAGCTGTAGATGATGGTGAAGGATCCGAAGAGACTTC
TCTCGATCTTGTAGACTGGAACCTCCCGCAGGTTGTCTGCAGCCGTGCAG
CCCCATGTAAAGTTGGATGCTGCTGGCATGGATTGTGTTGGGGTTTGTGT
CGGTGGGAAGATAATTAGAGTCCCCAGGCAGGCCTCCGAAGTGCAGCCGG
CGGACTTGCAAGGGTGGGTGCTGTCGTAAGGGTCTTTGTGTGTATTGCTA
TATGGATAAGCGAGATGATCTTGAAGATCCCATCGATGCTTTTGGTTATG
CTGTTGATGTTGATGTTGATGCTGACGCTGGTTTCGATGTCAATGTCGAT
GCCGACATCTTCGATGATAGCGACGACGCAGCACAAGAACCAGCATCGGA
GATGATGCACAAGAAATCCCTCCTCCGCACAGAAGAGAATTTAGATATTA
CCGCCCCCGTCTGCCACACAAACAGGGACTGCGGAACTGGATGTTGCTAC
CACGGCCTTTGTCTCGCGTATTGTCCTAATGATATGGCGAAGCGGGGTGA
TGGGGGTGCTAGTTGGGGTGAGCTTTCCTTATTCTTTGACAACCCACTGT
GCCACAAGAACTCCGACTGCGGAACCGGATGCTGCTACAACGGTCTCTGT
CTCGCCTACTGTCTCCACAATGAGGATGATGTTCACACGGACCTAGTCCG
CAGTCTTGTCGATGATGAAGCTTACCCTCATCCTCACCCTCCTGGCCACC
CTAGTGGCCTCCATCCCCGCCGATGGCTCAAGCTTCACAGACATCTGATA
CTCCATGCCCGACACCGACCTGCTTCCCACCTCAACAGACATAATCCACA
CCGGAGGCATGTGCAGCAAGAGAACGTGCAAGGGATGCTGCTGGCAGAAT
ATCTGTATGGCCAAGTGTCCTCGCGGTGAGCGGGATGAAGCTGTAGATGA
TGGTGAAGGATCCGAAGAGACTTCTCTCGATCTTGTAGACTGGAACCTCC
CGCAGGTTGTCTGCAGCCGTGCAGCCCCATGTAAAGTTGGATGCTGCTGG
CATGGATTGTGTTGGGGTTTGTGTCGGTGGGAAGATAATTAGAGTCCCCA
GGCAGGCCTCCGAAGTGCAGCCGGCGGACTTGCAAGGGTGGGTGCTGTCG
TAAGGGTCTTTGTGTGTATTGCTATATGGATAAGCGAGATGATCTTGAAG
ATCCCATCGATGCTTTTGGTTATGCTGTTGATGTTGATGTTGATGCTGAC
GCTGGTTTCGATGTCAATGTCGATGCCGACATCTTCGATGATAGCGACGA
CGCAGCACAAGAACCAGCATCGGAGATGATGCACAAGAAATCCCTCCTCC
GCACAGAAGAGAATTTAGATATTACCGCCCCCGTCTGCCACACAAACAGG
GACTGCGGAACTGGATGTTGCTACCACGGCCTTTGTCTCGCGTATTGTCC
TAATGATATGGCGAAGCGGGGTGATGGGGGTGCTAGTTGGGGTGAGCTTT
CCTTATTCTTTGACAACCCACTGTGCCACAAGAACTCCGACTGCGGAACC
GGATGCTGCTACAACGGTCTCTGTCTCGCCTACTGTCTCCACAATGAGGA
TGATGTTCACACGGACCTAGTCCGCAGTCTTGTCGATGATGAAGCTTACC
CTCATCCTCACCCTCCTGGCCACCCTAGTGGCCTCCATCCCCGCCGATGG
CTCAAGCTTCACAGACATCT back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-21) |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| MCQH01000199 | supercontig | MCQH01000199:1181055..1182214 - |
|
