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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000216:11253..12617+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_009610-T1 ID=ATCC10864_009610-T1|Name=ATCC10864_009610-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1365bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000216:11253..12617+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGGCGTCTCGTCCTACCGTCACCATCGCCGGCGCTGATGGCAAGCCCAC
GGGGGCTACCTACCCCCTCCCGGCTGTTTTCGCCTCCCCCATCCGTCTTG
ATGTTGTCCAGTATGTTTCAGCCTTTTTACGACAAAAAATCGATCTCGCA
GAGAGGAATCATGAGAAGCGGAGGATATTTGATGGCTGACGGATTTCGAA
TTACAGGCAGGTGCACACCGGTATGGCCAAGAACAAGAGACAGCCTTACG
CCGTGAGCGAGAAGGCTGGTGAACAGACCTCTGCTGAGTCCTGGGGTACC
GGTATGTGCACAAATTCGAAGGAACGCCAAGAAATTCGCAGGGGAATTGG
GATGGCTGATGGATGTGAATAACTTCAGGTCGCGCTGTCGCTCGTATCCC
CCGTGTCTCCGGTGGTGGTACTCACCGTGCCGGTCAGGCCGCTTTCGGTA
ACCAGTGCCGTTCCGGTCGTATGTTCGCCCCTACCAAGGTCTGGCGCAAG
TGGCACCAGAAGGTCAACGTTGGCCAGAGGTATGATAATAATCCCGACCG
ACGAGGTAACACGATTGAGCCAGGAGAAGGTGAACTAATGGCTGCTTTTT
AGACGTTTCGCTACTGCCTCTGCCCTCGCTGCTTCTTCCGTTCCTTCTCT
TCTGTTCGCTCGCGGTCACCGCGTTGCCAACGTTCCTGAGGTCCCTCTGG
TCGTTGACTCCAAGACCTTCGAGAACTCCGCTGTTACCAAGACCAAGGCC
GCCGTTGCCCTCCTCCAGGCCGTCGGTGCCGGTGCCGACCTTGTCAAGGT
CCAGAAGTCCCGCAAGATGCGTGCCGGTAAGGGTAAGCTGAGGAACCGCC
GCTTCCGCCAGCGCCGCGGTCCTCTGGTTGTCTACAACCCCGAGGTTGAT
GGCAAGGAGCTCGTCCGTGCCTTCCGCAACATCCCCGGTGTTGAGACCTC
CTCCGTCTTCTCCCTCAACCTCCTCCAGCTCGCCCCCGGTGGTCACCTCG
GTCGCTTCATCGTCTGGTCCTCTGCTGCCTTCGAGGCCCTCGACAAGGTC
TACGGCACCACCACCACCGCCTCCGCCCTCAAGAAGGACTACCTCCTCCC
CCAGAACGTTGTTGCCAACGCCGACCTGGCCCGTCTCATCAACTCTTCTG
AGATCCAGTCCGTCCTCCGCGCCCCCAAGGGTGAGGCTCGCACCAAGCGT
ACCAACATCCAGAAGAAGAACCCTCTCCGCAACAAGCAGGTCATGCTCCG
TCTCAACCCTTACGCTGCTGCTTTCTCCAAGGAGAAGCTCGGCCAGCAGA
AGGTTGAGGCCGCTAAGCCCGAGCGCGCTTCCAAGGACTTCCTCAACACC
CTCTACGAGGCGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000216:11253..12617+ >ATCC10864_009610-T1 ID=ATCC10864_009610-T1|Name=ATCC10864_009610-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=4476bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000216:11253..12617+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGGCGTCTCGTCCTACCGTCACCATCGCCGGCGCTGATGGCAAGCCCAC
GGGGGCTACCTACCCCCTCCCGGCTGTTTTCGCCTCCCCCATCCGTCTTG
ATGTTGTCCAGCAGGTGCACACCGGTATGGCCAAGAACAAGAGACAGCCT
TACGCCGTGAGCGAGAAGGCTGGTGAACAGACCTCTGCTGAGTCCTGGGG
TACCGGTCGCGCTGTCGCTCGTATCCCCCGTGTCTCCGGTGGTGGTACTC
ACCGTGCCGGTCAGGCCGCTTTCGGTAACCAGTGCCGTTCCGGTCGTATG
TTCGCCCCTACCAAGGTCTGGCGCAAGTGGCACCAGAAGGTCAACGTTGG
CCAGAGACGTTTCGCTACTGCCTCTGCCCTCGCTGCTTCTTCCGTTCCTT
CTCTTCTGTTCGCTCGCGGTCACCGCGTTGCCAACGTTCCTGAGGTCCCT
CTGGTCGTTGACTCCAAGACCTTCGAGAACTCCGCTGTTACCAAGACCAA
GGCCGCCGTTGCCCTCCTCCAGGCCGTCGGTGCCGGTGCCGACCTTGTCA
AGGTCCAGAAGTCCCGCAAGATGCGTGCCGGTAAGGGTAAGCTGAGGAAC
CGCCGCTTCCGCCAGCGCCGCGGTCCTCTGGTTGTCTACAACCCCGAGGT
TGATGGCAAGGAGCTCGTCCGTGCCTTCCGCAACATCCCCGGTGTTGAGA
CCTCCTCCGTCTTCTCCCTCAACCTCCTCCAGCTCGCCCCCGGTGGTCAC
CTCGGTCGCTTCATCGTCTGGTCCTCTGCTGCCTTCGAGGCCCTCGACAA
GGTCTACGGCACCACCACCACCGCCTCCGCCCTCAAGAAGGACTACCTCC
TCCCCCAGAACGTTGTTGCCAACGCCGACCTGGCCCGTCTCATCAACTCT
TCTGAGATCCAGTCCGTCCTCCGCGCCCCCAAGGGTGAGGCTCGCACCAA
GCGTACCAACATCCAGAAGAAGAACCCTCTCCGCAACAAGCAGGTCATGC
TCCGTCTCAACCCTTACGCTGCTGCTTTCTCCAAGGAGAAGCTCGGCCAG
CAGAAGGTTGAGGCCGCTAAGCCCGAGCGCGCTTCCAAGGACTTCCTCAA
CACCCTCTACGAGGCGTAAATGGCGTCTCGTCCTACCGTCACCATCGCCG
GCGCTGATGGCAAGCCCACGGGGGCTACCTACCCCCTCCCGGCTGTTTTC
GCCTCCCCCATCCGTCTTGATGTTGTCCAGCAGGTGCACACCGGTATGGC
CAAGAACAAGAGACAGCCTTACGCCGTGAGCGAGAAGGCTGGTGAACAGA
CCTCTGCTGAGTCCTGGGGTACCGGTCGCGCTGTCGCTCGTATCCCCCGT
GTCTCCGGTGGTGGTACTCACCGTGCCGGTCAGGCCGCTTTCGGTAACCA
GTGCCGTTCCGGTCGTATGTTCGCCCCTACCAAGGTCTGGCGCAAGTGGC
ACCAGAAGGTCAACGTTGGCCAGAGACGTTTCGCTACTGCCTCTGCCCTC
GCTGCTTCTTCCGTTCCTTCTCTTCTGTTCGCTCGCGGTCACCGCGTTGC
CAACGTTCCTGAGGTCCCTCTGGTCGTTGACTCCAAGACCTTCGAGAACT
CCGCTGTTACCAAGACCAAGGCCGCCGTTGCCCTCCTCCAGGCCGTCGGT
GCCGGTGCCGACCTTGTCAAGGTCCAGAAGTCCCGCAAGATGCGTGCCGG
TAAGGGTAAGCTGAGGAACCGCCGCTTCCGCCAGCGCCGCGGTCCTCTGG
TTGTCTACAACCCCGAGGTTGATGGCAAGGAGCTCGTCCGTGCCTTCCGC
AACATCCCCGGTGTTGAGACCTCCTCCGTCTTCTCCCTCAACCTCCTCCA
GCTCGCCCCCGGTGGTCACCTCGGTCGCTTCATCGTCTGGTCCTCTGCTG
CCTTCGAGGCCCTCGACAAGGTCTACGGCACCACCACCACCGCCTCCGCC
CTCAAGAAGGACTACCTCCTCCCCCAGAACGTTGTTGCCAACGCCGACCT
GGCCCGTCTCATCAACTCTTCTGAGATCCAGTCCGTCCTCCGCGCCCCCA
AGGGTGAGGCTCGCACCAAGCGTACCAACATCCAGAAGAAGAACCCTCTC
CGCAACAAGCAGGTCATGCTCCGTCTCAACCCTTACGCTGCTGCTTTCTC
CAAGGAGAAGCTCGGCCAGCAGAAGGTTGAGGCCGCTAAGCCCGAGCGCG
CTTCCAAGGACTTCCTCAACACCCTCTACGAGGCGTAAATGGCGTCTCGT
CCTACCGTCACCATCGCCGGCGCTGATGGCAAGCCCACGGGGGCTACCTA
CCCCCTCCCGGCTGTTTTCGCCTCCCCCATCCGTCTTGATGTTGTCCAGC
AGGTGCACACCGGTATGGCCAAGAACAAGAGACAGCCTTACGCCGTGAGC
GAGAAGGCTGGTGAACAGACCTCTGCTGAGTCCTGGGGTACCGGTCGCGC
TGTCGCTCGTATCCCCCGTGTCTCCGGTGGTGGTACTCACCGTGCCGGTC
AGGCCGCTTTCGGTAACCAGTGCCGTTCCGGTCGTATGTTCGCCCCTACC
AAGGTCTGGCGCAAGTGGCACCAGAAGGTCAACGTTGGCCAGAGACGTTT
CGCTACTGCCTCTGCCCTCGCTGCTTCTTCCGTTCCTTCTCTTCTGTTCG
CTCGCGGTCACCGCGTTGCCAACGTTCCTGAGGTCCCTCTGGTCGTTGAC
TCCAAGACCTTCGAGAACTCCGCTGTTACCAAGACCAAGGCCGCCGTTGC
CCTCCTCCAGGCCGTCGGTGCCGGTGCCGACCTTGTCAAGGTCCAGAAGT
CCCGCAAGATGCGTGCCGGTAAGGGTAAGCTGAGGAACCGCCGCTTCCGC
CAGCGCCGCGGTCCTCTGGTTGTCTACAACCCCGAGGTTGATGGCAAGGA
GCTCGTCCGTGCCTTCCGCAACATCCCCGGTGTTGAGACCTCCTCCGTCT
TCTCCCTCAACCTCCTCCAGCTCGCCCCCGGTGGTCACCTCGGTCGCTTC
ATCGTCTGGTCCTCTGCTGCCTTCGAGGCCCTCGACAAGGTCTACGGCAC
CACCACCACCGCCTCCGCCCTCAAGAAGGACTACCTCCTCCCCCAGAACG
TTGTTGCCAACGCCGACCTGGCCCGTCTCATCAACTCTTCTGAGATCCAG
TCCGTCCTCCGCGCCCCCAAGGGTGAGGCTCGCACCAAGCGTACCAACAT
CCAGAAGAAGAACCCTCTCCGCAACAAGCAGGTCATGCTCCGTCTCAACC
CTTACGCTGCTGCTTTCTCCAAGGAGAAGCTCGGCCAGCAGAAGGTTGAG
GCCGCTAAGCCCGAGCGCGCTTCCAAGGACTTCCTCAACACCCTCTACGA
GGCGTAAATGGCGTCTCGTCCTACCGTCACCATCGCCGGCGCTGATGGCA
AGCCCACGGGGGCTACCTACCCCCTCCCGGCTGTTTTCGCCTCCCCCATC
CGTCTTGATGTTGTCCAGCAGGTGCACACCGGTATGGCCAAGAACAAGAG
ACAGCCTTACGCCGTGAGCGAGAAGGCTGGTGAACAGACCTCTGCTGAGT
CCTGGGGTACCGGTCGCGCTGTCGCTCGTATCCCCCGTGTCTCCGGTGGT
GGTACTCACCGTGCCGGTCAGGCCGCTTTCGGTAACCAGTGCCGTTCCGG
TCGTATGTTCGCCCCTACCAAGGTCTGGCGCAAGTGGCACCAGAAGGTCA
ACGTTGGCCAGAGACGTTTCGCTACTGCCTCTGCCCTCGCTGCTTCTTCC
GTTCCTTCTCTTCTGTTCGCTCGCGGTCACCGCGTTGCCAACGTTCCTGA
GGTCCCTCTGGTCGTTGACTCCAAGACCTTCGAGAACTCCGCTGTTACCA
AGACCAAGGCCGCCGTTGCCCTCCTCCAGGCCGTCGGTGCCGGTGCCGAC
CTTGTCAAGGTCCAGAAGTCCCGCAAGATGCGTGCCGGTAAGGGTAAGCT
GAGGAACCGCCGCTTCCGCCAGCGCCGCGGTCCTCTGGTTGTCTACAACC
CCGAGGTTGATGGCAAGGAGCTCGTCCGTGCCTTCCGCAACATCCCCGGT
GTTGAGACCTCCTCCGTCTTCTCCCTCAACCTCCTCCAGCTCGCCCCCGG
TGGTCACCTCGGTCGCTTCATCGTCTGGTCCTCTGCTGCCTTCGAGGCCC
TCGACAAGGTCTACGGCACCACCACCACCGCCTCCGCCCTCAAGAAGGAC
TACCTCCTCCCCCAGAACGTTGTTGCCAACGCCGACCTGGCCCGTCTCAT
CAACTCTTCTGAGATCCAGTCCGTCCTCCGCGCCCCCAAGGGTGAGGCTC
GCACCAAGCGTACCAACATCCAGAAGAAGAACCCTCTCCGCAACAAGCAG
GTCATGCTCCGTCTCAACCCTTACGCTGCTGCTTTCTCCAAGGAGAAGCT
CGGCCAGCAGAAGGTTGAGGCCGCTAAGCCCGAGCGCGCTTCCAAGGACT
TCCTCAACACCCTCTACGAGGCGTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005840 | ribosome |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0003735 | structural constituent of ribosome |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0006412 | translation |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| InterPro | IPR013000 |
| PFAM | PF14374 |
| InterPro | IPR025755 |
| InterPro | IPR023574 |
| PFAM | PF00573 |
| InterPro | IPR002136 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG0926354S |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| MCQH01000216 | supercontig | MCQH01000216:11253..12617 + |
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