|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000222:316087..317134+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_009912-T1 ID=ATCC10864_009912-T1|Name=ATCC10864_009912-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1048bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000222:316087..317134+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGGCCTTTGCTGGCCCAGCTCTGGC
AGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAGGTATGCTGGAACTCCGTCTGACATA
AATCGCCTTGCCCATACTGACATGAAAAAGCCTGGTGGTGAGCCTCAAGT
CGGGACCATTGTCGGCACCAACTACCCGGGTAAGAGATCTGCTCGACTAT
CCTACTGCTTATAATCGTCTCTAATAATTGGATAGTGGCTACTGGCACGG
CCCCTCCTCCCCCTCCCCCTCCCATCCAGTTTCCTACTGGTACTGAGCCT
CAACCCAAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCAC
CAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCC
CTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTATCAGGCCTACTACC
AGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCC
GATCAGGCCTACCACCAGCTCTGGCACGGCTCCAATCAGGCCTACCACCA
GCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCT
ATCAGGCCGGGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGG
TACAACGGTGATCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAA
TCCAGAACAGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAG
AACACCACGGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCC
GCCAGTCCAGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGA
GCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGT
CAGAGCACTGTCCCCGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTC
AGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCT
GGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGGT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000222:316087..317134+ >ATCC10864_009912-T1 ID=ATCC10864_009912-T1|Name=ATCC10864_009912-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=3504bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000222:316087..317134+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGGCCTTTGCTGGCCCAGCTCTGGC
AGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAGCCTGGTGGTGAGCCTCAAGTCGGGA
CCATTGTCGGCACCAACTACCCGGTGGCTACTGGCACGGCCCCTCCTCCC
CCTCCCCCTCCCATCCAGTTTCCTACTGGTACTGAGCCTCAACCCAAGCC
TACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCACCAGTATTGGAA
CGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCT
ACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTAC
GGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTA
CCACCAGCTCTGGCACGGCTCCAATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACG
GCTCCTATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCGGG
CACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGGTACAACGGTGA
TCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAATCCAGAACAGC
ACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAGAACACCACGGT
TCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCCGCCAGTCCAGA
ACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCC
GCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTAGCACTGTCCCTGGTGTGCC
TGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTG
TGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGGTATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTC
CTGGCCTTTGCTGGCCCAGCTCTGGCAGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGA
GCCTGGTGGTGAGCCTCAAGTCGGGACCATTGTCGGCACCAACTACCCGG
TGGCTACTGGCACGGCCCCTCCTCCCCCTCCCCCTCCCATCCAGTTTCCT
ACTGGTACTGAGCCTCAACCCAAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCC
TATTAAGCCAACCACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCA
GTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCT
ATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAG
CTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACCACCAGCTCTGGCACGGCTCCAA
TCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCTACCACCAGC
TCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCGGGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCC
CATCCCCACCAACGGTACAACGGTGATCCCACCTGCAACCGTTACTACTC
ATACGCCTGTACCAATCCAGAACAGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACC
CAGCCGCCATTCCAGAACACCACGGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCAC
TCAGTCCCCTCAGCCGCCAGTCCAGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCG
TTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTC
CCTGGTAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGT
TCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCG
GTATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGTTCCTGGCCTTTGCTGGCCCAGCTCTG
GCAGGAGTCATTGCCCGCGGTGGAGAGCCTGGTGGTGAGCCTCAAGTCGG
GACCATTGTCGGCACCAACTACCCGGTGGCTACTGGCACGGCCCCTCCTC
CCCCTCCCCCTCCCATCCAGTTTCCTACTGGTACTGAGCCTCAACCCAAG
CCTACCACCAGCCATGGGACCGCTCCTATTAAGCCAACCACCAGTATTGG
AACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGC
CTACTACCAGTCAAGGAACGGCTCCTATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGT
ACGGCTCCGATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCC
TACCACCAGCTCTGGCACGGCTCCAATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTA
CGGCTCCTATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCG
GGCACTACTGAAACCACTGTCGGCCCCATCCCCACCAACGGTACAACGGT
GATCCCACCTGCAACCGTTACTACTCATACGCCTGTACCAATCCAGAACA
GCACTGTTATCCCCACTCAGTCCACCCAGCCGCCATTCCAGAACACCACG
GTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCCACTCAGTCCCCTCAGCCGCCAGTCCA
GAACACCACGGTCCCTGTTGTTCCCGTTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCC
CCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTAGCACTGTCCCTGGTGTG
CCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGG
TGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGGTATGGTCAAGGGAGGTGTTGCGT
TCCTGGCCTTTGCTGGCCCAGCTCTGGCAGGAGTCATTGCCCGCGGTGGA
GAGCCTGGTGGTGAGCCTCAAGTCGGGACCATTGTCGGCACCAACTACCC
GGTGGCTACTGGCACGGCCCCTCCTCCCCCTCCCCCTCCCATCCAGTTTC
CTACTGGTACTGAGCCTCAACCCAAGCCTACCACCAGCCATGGGACCGCT
CCTATTAAGCCAACCACCAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTAC
CAGTATTGGAACGGCCCCTATCAGGCCTACTACCAGTCAAGGAACGGCTC
CTATCAGGCCTACTACCAGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACTACC
AGCTCTGGTACGGCTCCGATCAGGCCTACCACCAGCTCTGGCACGGCTCC
AATCAGGCCTACCACCAGCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCTACCACCA
GCTCCGGTACGGCTCCTATCAGGCCGGGCACTACTGAAACCACTGTCGGC
CCCATCCCCACCAACGGTACAACGGTGATCCCACCTGCAACCGTTACTAC
TCATACGCCTGTACCAATCCAGAACAGCACTGTTATCCCCACTCAGTCCA
CCCAGCCGCCATTCCAGAACACCACGGTTCCTGTTGTTCCTGTTGTCCCC
ACTCAGTCCCCTCAGCCGCCAGTCCAGAACACCACGGTCCCTGTTGTTCC
CGTTGTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCTGTTCCTGGTCAGAGCACTG
TCCCTGGTAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCCCGCT
GTTCCTGGTCAGAGCACTGTCCCTGGTGTGCCTGGTCAGAGCACTGTCCC
CGGT back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-17) |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| MCQH01000222 | supercontig | MCQH01000222:316087..317134 + |
|
