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ATCC10864_010078-T1, ATCC10864_010078-T1 (mRNA) Aspergillus niger ATCC 10864

Overview
NameATCC10864_010078-T1
Unique NameATCC10864_010078-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger ATCC 10864
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at MCQH01000231:442373..443646-

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ATCC10864_010078-T1 ID=ATCC10864_010078-T1|Name=ATCC10864_010078-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1274bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000231:442373..443646- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCAT TGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCC CTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGT GCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGGTACGATCTTCTTCATTCAGTCT CCCCGGATTTCCCGTGTCAATCAAACATCAACTGACTCTCATCCGATATA GCCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACTCCTT TTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGGTATGTCCTCGGCTCC ATCCGCCAAGATGACCGTCCGAATAACCTCAAAACTGACTGATTTGATAT TAACAGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCG CTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCT GGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGC TTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTA GCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCT GCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGG CTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCG CTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCTGGTGCTTCCCCTAGC GGTGCCGCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGC TGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCG GAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTACACC CCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGATCCC CAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCCACCC CCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGC TCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGG CACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACTGGCG CCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGTCTTC GCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAA
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Coding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000231:442373..443646-

>ATCC10864_010078-T1 ID=ATCC10864_010078-T1|Name=ATCC10864_010078-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=3384bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000231:442373..443646- (Aspergillus niger ATCC 10864)
CTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCGCTGCTG
TCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCT
GGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGCTTCTCC
TAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTAGCGGTG
CTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCTGCTGTC
GGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGG
CCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCC
CCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCTGGTGCTTCCCCTAGCGGTGCC
GCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGCTGCCGC
TGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCGGAGCCG
GTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTACACCCCGGTC
CCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGATCCCCAGCAG
CAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCCACCCCCGCTG
CCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGCTCTAGC
TCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGGCACTGG
CTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACTGGCGCCGCTA
CCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGTCTTCGCTCTC
GTCGCCTTCCTTCTGTAACCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTA
CACCTACTCCACTCCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGT
GATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCA
TTGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGC
CCTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGG
TGCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCC
ACCTCCACCCCCAACGGTGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAG
TGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTG
CCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGCTTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGC
TCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTAGCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGG
ATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTG
AGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCC
GGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTC
CGGCTCTGGTGCTTCCCCTAGCGGTGCCGCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCT
CCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCC
GGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCGGAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCAC
CACCCCGGTCGTCTCTTACACCCCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACC
CCTCCTCTCGCCCTCTGATCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTT
GTTGCTTCCTCCAGCGCCACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAG
TTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCC
CCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGGCACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCC
TCCGCCCCTGTCTTCACTGGCGCCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGG
TGCCGGATTGGCCTCCGTCTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAACCTA
CCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACTCCTTTTGTC
ACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGATGCGTGTCGCTTCCGCTGCT
GTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCATTGCTACCGAGTACAAGACCGT
CTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCCCTAAGGCCACCTCTCTGGCCA
CTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGTGCCCAGACTACCCCGGCTGCT
GCTCAGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCG
CTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCT
GGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGC
TTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTA
GCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCT
GCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGG
CTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCG
CTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCTGGTGCTTCCCCTAGC
GGTGCCGCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGC
TGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCG
GAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTACACC
CCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGATCCC
CAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCCACCC
CCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGC
TCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGG
CACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACTGGCG
CCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGTCTTC
GCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAACCTACCACCGTCACCATCTCTGGCAC
CCCCTACACCTACTCCACTCCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTG
ACAAGTGATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCG
GTGCCATTGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACC
GTTTGCCCTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGG
CTCGGGTGCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAG
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Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_010078ATCC10864_010078Aspergillus niger ATCC 10864gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_010078-T1ATCC10864_010078-T1-proteinAspergillus niger ATCC 10864polypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_010078-T1.cdsATCC10864_010078-T1.cdsAspergillus niger ATCC 10864CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_010078-T1.exon3ATCC10864_010078-T1.exon3Aspergillus niger ATCC 10864exon
ATCC10864_010078-T1.exon2ATCC10864_010078-T1.exon2Aspergillus niger ATCC 10864exon
ATCC10864_010078-T1.exon1ATCC10864_010078-T1.exon1Aspergillus niger ATCC 10864exon


Properties
Property NameValue
NoteSECRETED:SignalP(1-18)
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger ATCC 10864 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
MCQH01000231supercontigMCQH01000231:442373..443646 -