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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000246:674417..676180+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_010966-T1 ID=ATCC10864_010966-T1|Name=ATCC10864_010966-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1764bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000246:674417..676180+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGCCGGCGGTAAGGTAGGCGTTAGATCCCGCTGTCATCAAGAATTATT
GTCCACTAGCTAGCTGTTGACTAACGTCGAGTTACTAGCGACCCGACGTG
CACCCTGTGATAGACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGA
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AAAGATCGAGCATCTGACACGGAATAGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGT
GGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCATCACGTTCATCAGGTATGCTGAG
AGTTCTTCAAAATAAACAAATAATTGGCTCTTACTCACGACCTCTACAGT
CCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGAGGA
ATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTTATC
TCATCGGTTATGTGGTATGTGTGGTTTCCGTGTTGTGCAAGAATATGACT
TGAGCTTACCGAACTTGCCATGTAGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGC
TGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACGTTT
TTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGTT
GATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGACTA
CAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATC
GCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGGACC
ACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTATGTC
AATTCCACCTGTCTTTTCATCCACATGACTGATATTGATACCCCTGGTAG
GTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCAT
GGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCG
AGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAA
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GTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATCGTGTTTCCCG
TTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACC
ACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAG
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TCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAAC
AACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGC
CTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGA
AAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTTTGCGTTCGGC
ATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTGACTGCTATCC
TCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGA
TGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGCGACTTTGGGC
TACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCC
CGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCGTCTC
AATTGGAGTTGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000246:674417..676180+ >ATCC10864_010966-T1 ID=ATCC10864_010966-T1|Name=ATCC10864_010966-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=8730bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000246:674417..676180+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTGGAGAA GGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAGGAATT TCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCATCACG TTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGC GGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCA CAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGCTG AGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACGTTTTT CGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGTTGA TCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGACTACA GGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATCGC AATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGGACCAC TTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTGTTCTGG GTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCATGGTTTTCAA CCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCGAGCGTCTTC GCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAACCTGATGGA GCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCGGTTGATCAT GCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATCGTGTTTCCCGTTGCGACCT ATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACCACCGTCACC GATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAGTGGCCTCGC ATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCGTCTTCGCCT TGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAACAACAACGTC TTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGCCTTCTTCAT CCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGAAAACACACT GGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTTTGCGTTCGGCATGGTGGGT ATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTGACTGCTATCCTCGGTACGC TGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGATGGGTGCTC TGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGCGACTTTGGGCTACGGATGG GGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCCCGTGCCAAT GCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCGTCTCAATTGGAGT TGTGAATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTG GAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAG GAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCA TCACGTTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTA TATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTC AGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTC CGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACG TTTTTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGC GTTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGA CTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGA ATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGG ACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTGT TCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCATGGTT TTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCGAGCG TCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAACCTG ATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCGGTTG ATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATCGTGTTTCCCGTTGC GACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACCACCG TCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAGTGGC CTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCGTCTT CGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAACAACA ACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGCCTTC TTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGAAAAC ACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTTTGCGTTCGGCATGG TGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTGACTGCTATCCTCGG TACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGATGGG TGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGCGACTTTGGGCTACG GATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCCCGTG CCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCGTCTCAATT GGAGTTGTGAATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAG ACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAAC CCGAGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAG TACCATCACGTTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCG TGGTATATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACT CTCTCAGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTCCTCTCTTTTT CTCTCCGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCA ACACGTTTTTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATA TCTGCGTTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTG TTTGACTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGC GTGGAATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTG CTAGGACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTG 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CGGACCCGTGCTAGGACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGG GTTGGCACTGGGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCT GCTCTGGTCATGGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCG CCGCAAGACCGAGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACA GCTGCTATGAACCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACC CTCGGCAAGCGGTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGAT CGTGTTTCCCGTTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACT TGCTCTTCACCACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGC ACGGAAATCAGTGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAG TGGCCAGATCGTCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGA AGTTGCGCAACAACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACC ATGATCTTTGCCTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTC TGCGCAGGAGAAAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCT TTGCGTTCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATT GACTGCTATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTAC CCGGTCGCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACG CGACTTTGGGCTACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTG GGCATGATCCCCGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAG AAAGTCGTCTCAATTGGAGTTGTGAATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
InterPro | IPR036259 |
InterPro | IPR011701 |
PFAM | PF07690 |
InterPro | IPR020846 |
Properties
Property Name | Value |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
MCQH01000246 | supercontig | MCQH01000246:674417..676180 + |
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