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mRNA from alignment at KZ851940.1:191728..194588+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_287099-T1 ID=M747DRAFT_287099-T1|Name=M747DRAFT_287099-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2861bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851940.1:191728..194588+ (Aspergillus niger ATCC 13496) CTTGCGAAGCTCTCGACACTCTTCAATTCATTCCCCCGTTCACGACACCT
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TAGAAGTTGTC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851940.1:191728..194588+ >M747DRAFT_287099-T1 ID=M747DRAFT_287099-T1|Name=M747DRAFT_287099-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=13356bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851940.1:191728..194588+ (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGGCCGAATCACCCCTCGATGTCCTCTTGAAGGGTAACTCCGGCAGAAC AACACGCGGCCTTCTGCGGATTATCATTCTAGCTACCATTGCCGCTGCTG CTGTGTCCAGTCGTCTGTTCAGTGTGATCCGATTCGAGAGTATTATCCAC GAGTTCGACCCCTGGTTCAACTTCCGCGCAACAAAATACCTGGTCTCCCA TGGCTTTGAGAGCTTCTGGGACTGGTTCGACGACCGAACATGGCACCCTC TGGGACGTGTCACTGGTGGCACGCTATACCCCGGTCTCATGGTGACCAGC GGTGTTATTTACCACGTCTTGCGGTTCCTCACTATCCCTGTCGACATCCG TAACATCTGTGTCTTGCTTGCCCCGGGTTTCTCCGGTTTGACCGCGCTGG CAATGTACTTCCTGACTCGCGAGATGGCGACATCCCCCTCCGCTGGTCTC CTCGCGGCTGCTTTCATGGGTATCGTCCCTGGATACATCTCTCGTTCCGT CGCAGGCAGCTACGATAACGAGGCCATCGCCATTTTCCTGCTGGTATTCA CCTTCTTCCTGTGGATCAAGGCTGTTAAGAATGGCTCCATCATGTGGGGT TCTCTGGCGGCCTTGTTCTACGGCTACATGGTGTCTGCCTGGGGTGGTTA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006486 | protein glycosylation |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004576 | oligosaccharyl transferase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09260TVA |
Note | CAZy:GT66 |
DBxref | InterPro:IPR003674 |
DBxref | PFAM:PF02516 |
Product | oligosaccharyl transferase stt3 subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851940.1 | supercontig | KZ851940.1:191728..194588 + |
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