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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851944.1:139504..142313+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_287782-T1 ID=M747DRAFT_287782-T1|Name=M747DRAFT_287782-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2810bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851944.1:139504..142313+ (Aspergillus niger ATCC 13496) CTTCTCTCTCCTCCTCACTCCTCCTTCCTCCAATTTTCTCATTTCTCCAT
CTGGTTGCCTCGCTCTTCCAGCTCCCTCCTCTTCTCTTCTCCCTCTTGTT
CCTCTTACCATCCTAAACCACTTCCAACTTCCTTTGTGTTCAGGTCGCAG
TCTTACGAAGCGGCTTGTCACTTCCTCACCTATCTATATCTCCCTTACTA
TCTAATAATATCCTCCTTTAATCCTTTCTCCTATTCCCAACTCTGTTGAC
AGGTATGTGTGCTGTCCGATAGTATATTGCTACCACGGCGGATACATTTC
CCCTCCCACGGATTCTTCCCACACAGCACCCGCTTTATGAAAACCTTCTT
GATCTCTTGACACTGACATCTTGCTCGATTCACAGAGTATTCAGCCAACA
TGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAAC
GACAACATCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAG
CAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATAGTAAGTGGCGG
CCTGTAGCCGTGCTCAATTGTTCTGGCTGACAATCTGCCACAGTGGTATG
CAGCCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCG
TTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTCG
TGAGCAAGATGTATGGTAAACCAGATCCCTTCTCTTGAATTGAGATACTG
ATACAATTATAGGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACC
AGGACGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTC
AACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGA
GTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGA
GAGTAAGTTCTGCTTCTGAGACACACCATGCTGCTCTCCGCTAACAGCAG
AACAGCGCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACC
ATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGAT
TGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACC
GCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAA
CTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTGC
CATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCC
GCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTC
GGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGTCAAGAACGGCACCAT
CACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCA
AGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTC
GAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGT
TCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACG
ACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCT
AAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAA
GCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTC
TCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATC
GGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGC
CAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTG
CCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGAC
TTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGG
TGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGG
GCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTG
AGTAAGTGAACCCTCATTTGTACCTGAAAAGTTGAACAGCTTTAACTGAC
TATGCACAGTCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCC
GATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAG
CACCAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCA
AGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTTC
GTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGA
CTACATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCA
TTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCTG
TACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAA
GGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAATTTTTTACTTGTC
TCCCTTAATACATTTACATCTCATGGATTAGTCATAAAATCCGTCATTGT
TGACGTCGGAGTTGTGATGGCCTGTTTTCTTTTCACCCATATTTCTTTCT
GCATCGGTTTGGTTCGCTTCATATCTCATCTATTTCAACTTACAATCTGT
AGTGGCACATGTGGCATGACTCGCTGTTAAAGGTTGATGAATATCACGCA
ACGATTAAAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851944.1:139504..142313+ >M747DRAFT_287782-T1 ID=M747DRAFT_287782-T1|Name=M747DRAFT_287782-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=9855bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851944.1:139504..142313+ (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAA CGACAACATCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCA GCAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATATGGTATGCAG CCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTC CACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGA GCAAGATGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGAC GTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACTT CGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGAGTGCC CCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGACGC GCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGG ACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACA CTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGT TCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAA CATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTG GTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACCAG GCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGT TGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCACCAAGC CCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTGAG GTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGC TGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGA CCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGGTC AAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCC CATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTG CTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCC GGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGT CATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGT TCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCT GGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAG CGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCC TGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGC CCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGATCCCCGG TATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGC 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TCCAAGCTCTACCGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGG TATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCT ACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATC GACCACCTGCTCCGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCT GCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGTCA AGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGC GCTAGCATGTTCAAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGC CAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGG CCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAG GAGGTCTACGACGACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGA GCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGG GTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGT GGCCAGGAGCTTCTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGA GGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCC TCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCT GACCACGGTCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCG TGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCG GTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAG GCCTTCGACAAGGGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAA GGAGAACAAGCTGATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACA ACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTC CCCAGCACCAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCAC CTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCT GCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTT GAGGACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCG TTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTG GTCTGTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTC CAGAAGGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAAATGCCTAC CTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACA TCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCC CTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATATGGTATGCAGCCCCGGGC TGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCT CCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATG TACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGACGTCTCCAA GGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTT CCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATC CGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGACGCGCACGTGA GATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGCTA 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CCCCGAGAGACGCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCA TCACCATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTC AAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCT CTACCGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCA ACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGT GTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCT GCTCCGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTG AGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGTCAAGAACGGC ACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCAT GTTCAAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCG ACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATC TTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTA CGACGACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCG TCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTC CGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGA GCTTCTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTG GTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCC TACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGG TCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCA AGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGT TTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGA CAAGGGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACA AGCTGATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCCGAT CTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCAC CAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGA AGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTTCGTT GACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTA CATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTG GTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCTGTAC AGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGG TGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAAATGCCTACCTCTGCTC CCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGC TTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCA CAACAAGACGAGATGCTTCGTATATGGTATGCAGCCCCGGGCTGTCCAGG GTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCC GGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATGTACTGGGG TACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGACGTCTCCAAGGCCATGG CCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTTCCCGTTCC 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CATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCA TCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGT CTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGA GGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTG ACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTC AAGTCCCGCAACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGC CAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCG AGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGT TGTGTTGCCGTCTGCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTC TTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCT TCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAG AGACTCCGCACTGGTCTGTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCT TCTCCCCGCCCTCCAGAAGGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCG TCTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003824 | catalytic activity |
| GO:0046912 | transferase activity, transferring acyl groups, acyl groups converted into alkyl on transfer |
| GO:0048037 | obsolete cofactor binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR036291 |
| DBxref | InterPro:IPR036969 |
| DBxref | InterPro:IPR017440 |
| DBxref | InterPro:IPR033847 |
| DBxref | InterPro:IPR017866 |
| DBxref | InterPro:IPR016142 |
| DBxref | InterPro:IPR016143 |
| DBxref | InterPro:IPR016102 |
| DBxref | InterPro:IPR005811 |
| DBxref | InterPro:IPR002020 |
| DBxref | InterPro:IPR003781 |
| DBxref | PFAM:PF00549 |
| DBxref | PFAM:PF02629 |
| DBxref | PFAM:PF00285 |
| Product | citrate synthase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| KZ851944.1 | supercontig | KZ851944.1:139504..142313 + |
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