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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851931.1:19890..23126- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_298009-T1 ID=M747DRAFT_298009-T1|Name=M747DRAFT_298009-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=3237bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851931.1:19890..23126- (Aspergillus niger ATCC 13496) GTTGGTGCCCCACCACAGACATCATTGCCCCCCCACCTTCCCTTTCTCAC
CCTCTCGTTGCTGGTCGCTGCTTCCCATCCCACTCCGCCCGCCTGGCTGG
CTCGCTTTTCCTCGCCCATTCCCCCTTCCTTGTCATCCTTTCTTCTCCTT
CTCTCTTCTCTCTCTCCTGCTCCTTCTTCTTCTTCTCTCTCAGTCATCTT
TTCCCCTCTTCATCTCGTGGTGGTCTTCCCATTTGTGTTGATTGTTTGTT
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CACTCTCGCGGTATGCAACTCTTGCTCCCATTCTCTTTGCTTCTATTCCA
CTCCCATCCGATTCCGGTGTGACGGAGAGCTTCTCTAGAGCTCCGGCACC
GGAAGGCCATCCCTGGTATCACGGGGACTCCGCGGAGCACAGTCTCCCAC
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GTCAACTTTGAAGCTAATCCTCCTCTAGGTTGATGCCACCTTCAAGGCCA
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CCGTGACCGCTTCGTTCTCTCGTAAGCTTCAACTGGCAATCTTTGTGTCC
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CTCCAATATGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGATGA
CCTGAAGTCCTTCAGAGTATGTATCCGCTGAGGGTTTCTGCGAGAGCCAT
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CGTCACTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAA
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GCGAGGCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCATTGCT
ATCTACGACGACAACGGAATCTCCATCGGTAAGCTTCATTCATCACCCCT
TTTTCCTCATTATCACAGCCATACTAACGAGGGCTTGTTTTGCAGACGGT
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CGGCTGGCACACCGAGTACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCA
TTGAGGCTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTC
ATTCGTCTGACTACTACCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGG
CGGTGTCCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGC
AGCTCTTCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTC
TACGACCTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGA
GTGGAACCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACG
CTGAGCTCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAG
AGCCTGCCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCT
CTCCGAGGCTGTCCTCGAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGT
CCGGCTCTGCCGACTTGACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCC
GTTGACTTCCAGCCCCCCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTA
CCTCCGCTACGGTGTCCGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTC
TTGCCGCCTACGGCACCGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTC
GTCTCCTACGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCG
CACCATCTACGTTGCCACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTC
CTACTCACCAGCCCATTGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAAC
TGCATGGTTTGGCGCCCTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTA
CTCTGCTCTGACCTCCAAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTC
AGAACCTGCCCCAGCTCGAGGCTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGT
GCCTACGTTGCCCTCGAGGCCCCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCAC
CGGTTCCGAGGTCAGCATCTGTATCGAGGCTGCCACCTACCTCAAGGAGA
AGCACGGCATCGCTGCCCGCGTTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTC
GATGCCCAGGACAAGGCCTACAAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCC
CGTCCTCTCCGTCGAGGCTCTCACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTC
ACGAGCAGTTCGGTCTCAACCGCTTCGGTGCCTCTGGCCCCTACAAGGAT
GTCTACAAGGTAAGCTACAAAATATGTCCACCTCTTTCAATAGCCGCATA
TGCTAATTCACTTCACTGCAGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAG
CAAGCGCGCTGTCGCCACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCT
CCCCCATCAACCGTGCTTTCCAGCAGATTCTGTAAACGTCTTGCGGTAGC
ATCGTGATGGTTTGTACTGATTCATGTTTATGAGTATCTGGGACGATGTT
GATCCCTGTGGGCAATGATACCCCCGGGAGAAGTCCTATTTTAACGACTT
TTTCTTTGAAGATAAAAATATATGCAATCTGTTTCATTCAATCTCTTGGT
CTATAATCGTTCTAGTTTTCTTTGGGTAGATTTAGAGGGGAATTGGTCTA
TGACGAGAGAATACTATCACCAGTTTTGGCTTTCAAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851931.1:19890..23126- >M747DRAFT_298009-T1 ID=M747DRAFT_298009-T1|Name=M747DRAFT_298009-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=12330bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851931.1:19890..23126- (Aspergillus niger ATCC 13496) AAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTCGCCACCAT TGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCGTGCTTTCC AGCAGATTCTGTAAACGGTGACACCAAGTGCGCCTTCACTGAGGATGTTA TGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACCGAGTACGTCAAGGACGGT GACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGT CACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGTCTGACTACTACCATCGGTTTCGGTT CCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGAC GACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTT CGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGG GTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCT GAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCT TGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTG CCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTCCTCGAGAAGATCCACGAT GTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGACTTGACTGGCTCCAACAA CACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGCCCCCCGAGTACAACATCG GTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTCCGTGAGCACGCCATG GCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCACCGTCATCCCCGCTGG TGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTGT CGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCCACCCACGACTCCATC GGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCATTGAGACTCTGGCTCA CTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCCCTGCTGACGGCAACG AGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCCAAGCACACCCCCAGC ATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCAGCTCGAGGCTTCCACCAT CGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGCCCTCGAGGCCCCCGACGCTG CCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGGTCAGCATCTGTATCGAGGCT GCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACGGCATCGCTGCCCGCGTTGTCTCCGT TCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCCCAGGACAAGGCCTACAAGCTCCAGG TCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCTCTCCGTCGAGGCTCTCACCACCATG GGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGCAGTTCGGTCTCAACCGCTTCGGTGC CTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTACAAGCAACTCGACAGCATCACCCCCG GTCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCACCACTGGTCCC CTGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTGCCGAGCGTCA CTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAACTACA CATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCATGGAGGGTATTGCCAGCGAG GCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCATTGCTATCTA CGACGACAACGGAATCTCCATCGCAACGGCCACGGCTGCATGCTCCAATA TGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGATGACCTGAAGT CCTTCAGAGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCGGTCACCCCGGTGCC CCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTCAACAAGTTCATGAG CTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGACCGCTTCGTTCTCT CATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACCATCCGCACTC TCGCGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTCGCC ACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCGTGC TTTCCAGCAGATTCTGTAAACGGTGACACCAAGTGCGCCTTCACTGAGGA TGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACCGAGTACGTCAAGG ACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTATCAAGAAGTGCCAG GCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGTCTGACTACTACCATCGGTTT CGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAACCCCCTGAAGG CTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGACCCCAAGCAG ACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACAAGCACGCCGC 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GGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAACCCCCT GAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGACCCCA AGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACAAGCAC GCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTCCAGAA GTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCGCCGTCTCT CCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCTACAAGCCC ACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTCCTCGAGAA GATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGACTTGACTG GCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGCCCCCCGAG TACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTCCGTGA GCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCACCGTCA TCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCGGTGCT GTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCCACCCA CGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCATTGAGA CTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCCCTGCT GACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCCAAGCA CACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCAGCTCGAGG CTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGCCCTCGAGGCC CCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGGTCAGCATCTG 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TCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACCGAG TACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTATCAA GAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGTCTGACTACTA CCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAAC CCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGA CCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACA AGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTC CAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCGCCG TCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCTACA AGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTCCTC GAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGACTT GACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGCCCC CCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTC CGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCAC CGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCG GTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCC ACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCAT TGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCC CTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003824 | catalytic activity |
GO:0004802 | transketolase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR029061 |
DBxref | InterPro:IPR020826 |
DBxref | InterPro:IPR009014 |
DBxref | InterPro:IPR005474 |
DBxref | InterPro:IPR033248 |
DBxref | InterPro:IPR005478 |
DBxref | InterPro:IPR005475 |
DBxref | PFAM:PF02779 |
DBxref | PFAM:PF00456 |
DBxref | PFAM:PF02780 |
Product | transketolase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851931.1 | supercontig | KZ851931.1:19890..23126 - |
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