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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851924.1:198375..200125+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_307340-T1 ID=M747DRAFT_307340-T1|Name=M747DRAFT_307340-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=1751bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851924.1:198375..200125+ (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGG
TAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCGTATGTCTTCCCT
AGATATGTGACGCAGGCTATGACTGGGCTCATCCCCACTAACTGATTCCA
GTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGA
TGATTCCTGGTGTCGGGTATGATACCACCTGTCAACCTCCAAGCCATTGA
GCCCCTCCAACTGACGGCAACAGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACG
CAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGG
TGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACC
GCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTT
GGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTG
TCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGTGAGTGTCCCCAAATCCGAAG
CAACCTTCATGATTGATAACTGATAACGGAGATAGGGTTGCCCTTGCTGT
TGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCT
TCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAAC
TCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTAC
TCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGC
TCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCAC
AACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTT
CGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGG
CAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGC
ATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTC
CGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGA
CACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAAC
TACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATAT
CTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTC
TTTTTGCTGCGTAAGGCCCCCTGATCTCTATAGAAAACAGACAACCTCAA
ACCGGTGGGCACTCAACTAACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGC
CCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACT
ACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTAC
TCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGG
TCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACG
CTGAAATTGGTGAATTTGCCGTAAGTGCCTTCCCATATCATCGAAGTAAA
CGACTCTCCCTCTAACAAAAACTAGTACGACTACGTGGAAATCACCCGCG
ATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGC
ACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTG
A back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851924.1:198375..200125+ >M747DRAFT_307340-T1 ID=M747DRAFT_307340-T1|Name=M747DRAFT_307340-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=8928bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851924.1:198375..200125+ (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGG TAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCG CTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTC GGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAAT ATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCT GGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGAC CTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAG CTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTG CTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATG CTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCC AATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTG GACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCT GCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCA CGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCG TCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGC GCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTC CGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGT GGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATC ACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGT TGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTC GTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTC GTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCACAACCTCAAACCGGTGG GCACTCAACTAACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGCCCACCTGG ATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAG CTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTT CGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACC TGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATT GGTGAATTTGCCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGG CACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTC CCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGAATGTCGGAATAC CCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGAC AGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCA CCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGCTTCTTCTAC TCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAAT AATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGC TGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTT GGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCC TGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGGTTG CCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATG GTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTG GACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCG CAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATAC TCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTA CCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGG TTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGG GCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGT CACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCG GTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCT GGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGC TGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACG CCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTG 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AGACAAAGGCTTGAATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGAC AATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAG CTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGA TGATTCCTGGTGTCGGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCA GCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATT CCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAA CGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCT CCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCA GGGAATGTTCGCTGCTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGG AACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACC ATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGT GTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTG CCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGC GGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGT CGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCG GCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACG AACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAG ACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAG GTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCC 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TGCTATTACGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCA TGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGAT CCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGG TGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGG CTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACC CACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTAC CGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGA GCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCC TCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAA GTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCA TCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGA GTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCT TCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTC TCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCACAACCTCAAACCGGT GGGCACTCAACTAACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGCCCACCT GGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCC AGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTC TTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCA CCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAA TTGGTGAATTTGCCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGT GGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCC TCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGAATGTCGGAAT ACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTG ACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTCTGGAGATATCGCTTGGGTTAT CACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGCTTCTTCT ACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCA ATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTC GCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATT TTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTC CCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGGT TGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCA TGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGC TGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTT CGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCAT ACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAAC TACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTG GGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGC GGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGT GTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGT CGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCT CTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCC GCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGA CGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACC TGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCACAACCTCAAACCGGTGGGCACTCAACT AACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTAC GGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACC AGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGC ATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCC CGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTG CCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCC GAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAA CGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0015696 | ammonium transport |
GO:0072488 | ammonium transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0008519 | ammonium transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR018047 |
DBxref | InterPro:IPR024041 |
DBxref | InterPro:IPR029020 |
DBxref | InterPro:IPR001905 |
DBxref | InterPro:IPR002229 |
DBxref | PFAM:PF00909 |
Product | ammonium transporter Amt1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851924.1 | supercontig | KZ851924.1:198375..200125 + |
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