You are here

M747DRAFT_307661-T1, M747DRAFT_307661-T1 (mRNA) Aspergillus niger ATCC 13496

Overview
NameM747DRAFT_307661-T1
Unique NameM747DRAFT_307661-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger ATCC 13496
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at KZ851926.1:332899..334133+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>M747DRAFT_307661-T1 ID=M747DRAFT_307661-T1|Name=M747DRAFT_307661-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=1235bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851926.1:332899..334133+ (Aspergillus niger ATCC 13496)
ATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCAT TGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCC CTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGT GCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGGTACGATCTTCTTCATTCAGTCT CCCCGGATTTCCCGTGTCAATCAAACATCAACTGACTCTCATCCGATATA GCCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACTCCTT TTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGGTATGTCCTCGGCTCC ATCCGCCAAGATGACCGTCCGAATAACCTCAAAACTGACTGATTTGATAT TAACAGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCG CTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCT GGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGC TTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTA GCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCT GCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGG CTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCG CTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCC CCCAGCGGTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGC TGGTCCCAGCGGAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCG TCTCTTACACCCCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGC CCTCTGATCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTC CAGCGCCACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCA GCTCTTCCGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTC TCCGCTGCTGGCACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGT CTTCACTGGCGCCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGG CCTCCGTCTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at KZ851926.1:332899..334133+

>M747DRAFT_307661-T1 ID=M747DRAFT_307661-T1|Name=M747DRAFT_307661-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=3267bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851926.1:332899..334133+ (Aspergillus niger ATCC 13496)
ATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCAT
TGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCC
CTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGT
GCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGCCTACCACCGTCACCATCTCTGG
CACCCCCTACACCTACTCCACTCCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACT
GTGACAAGTGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGT
GCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGG
CTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCG
GTGCTTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCT
CCTAGCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGC
CGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCT
CTGGCTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCT
GGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTC
CTCCCCCAGCGGTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTT
CCGCTGGTCCCAGCGGAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCG
GTCGTCTCTTACACCCCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTC
TCGCCCTCTGATCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTT
CCTCCAGCGCCACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCC
TCCAGCTCTTCCGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGG
TGTCTCCGCTGCTGGCACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCC
CTGTCTTCACTGGCGCCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGA
TTGGCCTCCGTCTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAAATGCGTGTCGC
TTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCATTGCTACCGAGT
ACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCCCTAAGGCCACC
TCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGTGCCCAGACTAC
CCCGGCTGCTGCTCAGCCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACA
CCTACTCCACTCCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGC
TCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCGCTGCTGT
CGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTG
GCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGCTTCTCCT
AGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTAGCGGTGC
TGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCTGCTGTCG
GTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGC
CCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCC
CAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCG
GTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCC
AGCGGAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTA
CACCCCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGA
TCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCC
ACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTC
CGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTG
CTGGCACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACT
GGCGCCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGT
CTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAAATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTG
TCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCATTGCTACCGAGTACAAGACCGTC
TATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCCCTAAGGCCACCTCTCTGGCCAC
TGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGTGCCCAGACTACCCCGGCTGCTG
CTCAGCCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACT
CCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGCTCCGCTACCGC
CGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTG
CCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCC
AGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGCTTCTCCTAGCGAGGGTGC
CAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTAGCGGTGCTGCCGCTGGCT
CCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCC
TCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCCCCTCCCCCAG
TGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTG
CCACTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGCTGCCGCT
GGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCGGAGCCGG
TGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTACACCCCGGTCC
CCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGATCCCCAGCAGC
AAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCCACCCCCGCTGC
CTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGCTCTAGCT
CCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGGCACTGGC
TCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACTGGCGCCGCTAC
CCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGTCTTCGCTCTCG
TCGCCTTCCTTCTGTAA
back to top
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
M747DRAFT_307661M747DRAFT_307661Aspergillus niger ATCC 13496gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
M747DRAFT_307661-T1.exon1M747DRAFT_307661-T1.exon1Aspergillus niger ATCC 13496exon
M747DRAFT_307661-T1.exon2M747DRAFT_307661-T1.exon2Aspergillus niger ATCC 13496exon
M747DRAFT_307661-T1.exon3M747DRAFT_307661-T1.exon3Aspergillus niger ATCC 13496exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
M747DRAFT_307661-T1.cdsM747DRAFT_307661-T1.cdsAspergillus niger ATCC 13496CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
M747DRAFT_307661-T1M747DRAFT_307661-T1-proteinAspergillus niger ATCC 13496polypeptide


Properties
Property NameValue
NoteSECRETED:SignalP(1-18)
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger ATCC 13496 whole genome analysis2021-10-31
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
KZ851926.1supercontigKZ851926.1:332899..334133 +