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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An04:533499..535606+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_003119-T1 ID=CBS51388_003119-T1|Name=CBS51388_003119-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=2108bp|location=Sequence derived from alignment at An04:533499..535606+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCCGACAGCTTGAAGATGGGAAACCTTTCCCTCAACGAGTCTCAGCA
CGCTCCTGCCCCTGCCCCCTCCACGGGTCGCGCCGCTTACATCCCTCCCC
ATCTTCGCGGACGCCAGATGGGTGGAAACATGGACGGTGCTGCCGCCGCT
GCCCCTCCCCCCGGTCCCGCCGCTGGCCCTGGCAACTCCTGGGGTGGTCC
TAGGTATGTGATATTCAATTACCGCGTGTCCCATTTCACGTTGTGTGTAG
TGACTAACTGGCATGATTCTGCAGAGGCGGCCCTCGTGGTGGCCAGTGGG
CCAACGCCAACGCTCCTGATTTCAGCCCTCGCGGTCCCAATGGTAACACT
AGCTGGAGCCCTCACGAAGCTCGCCGGCCCTTTAATCCAAATGCTTACGG
ACACCCAGGTCACGGAGGTTCTTATGGAAGTGGAGGTGGTTCTGCCCGAG
GCTCTGGAGATGGCCAGTGGCGTGACGGCAAGCACATTCCCGGTCCTGCC
AATCCCCGTCTCGAACGCGAACTGTTCGGTCTTCCCAACGATCCCACCAA
GCAAAACACTGGCATCAACTTTGCCAACTACGACGACATCCCCGTGGAGG
CCTCTGGTCACGATGTCCCGGAGCCGGTCAACGCCTTCACCAACCCGCCC
CTGGATGACCACCTGATCGAGAACATCAAGCTCGCCCACTACCAGACTCC
CACTCCCGTCCAGAAGTATTCCATCCCCATCGTCATGAACGGCCGCGACT
TGATGGCCTGCGCCCAGACTGGTTCCGGAAAGACTGGTGGTTTCCTCTTC
CCTATTTTGTCTCAGGCTTATCAGAACGGTCCTTCCGCTGCTCCTGCCCA
GGCCGGCGGCCAATTTGGCTACGGACGTCAACGCAAGGCGTACCCGACCT
CCCTCATTCTCGCCCCCACCCGTGAGCTTGTTTCCCAGATTTTCGATGAG
GCCCGCAAGTTCGCCTACCGCTCTTGGGTCCGCCCTTGTGTTGTGTACGG
TGGTGCCGATATCGGCTCCCAGCTCCGCCAGATCGAGCGCGGATGTGATC
TTCTGGTTGCTACTCCTGGTCGTCTTGTCGATCTTATCGAGCGTGGCCGC
ATCTCTCTGGTCAACATCAAGTACCTGATTCTCGATGAGGCCGATCGTAT
GTTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATTCGCCGCATTGTGGAAGGCGAGG
ATATGCCCCACGTGAACGACCGCCAGACGCTGATGTTTTCGGCCACCTTC
CCCCGTGACATCCAGATGCTGGCTCGCGACTTCTTGAAGGACTACGTCTT
CCTGTCCGTCGGCCGTGTCGGTTCTACCTCTGAGAACATCACCCAGAAGG
TTGAATACGTTGAGGACCACGACAAGCGCTCCGTCCTCTTGGATATCCTC
CACACGCACGGCACTAGCGGTCTGACCCTCATCTTCGTCGAAACCAAGCG
TATGGCCGACTCCCTGTCCGACTTCCTTCTCAACCAGCGTTTCCCCGCCA
CCGCTATTCACGGTGATCGTACCCAGCGTGAGCGTGAGCGTGCTTTGGAA
ATGTTCCGCTCTGGCCGTTGCCCTATCCTTGTTGCCACTGCTGTTGCTGC
TCGTGGTCTCGATATCCCCAATGTTACCCACGTCATCAACTACGACTTGC
CTACCGACATCGATGACTATGTTCACCGTATCGGTCGTACTGGTCGTGCC
GGTAACACTGGTATCGCCACTGCTTTCTTCAACCGTGGTAACCGGGGTGT
TGTCCGCGACCTGATTGATCTCCTGAAGGAGGCTCATCAGGAGGTCCCCT
CCTTCCTCGAGAGCATTGCTCGTGAGGGCAGCGGCTATGGTGGTCGTGGC
GGCCGTGGTGGCCGTGGTCGTGGCGCCAACGCTACCCGTGACATGCGTCG
CATGGGCGGTGGTATGGGCGGTCCTCCCTCCTTTGGTGGCAGCAGCTACG
GTGCACCTGGCGGCAGCTATGGTGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCTAT
GGCGCTCCTCCCTCCTATGGAGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCAG
CTACGGTGGTGGTTACGGCAACCCGTCCGGCCCTACTGGACCTTCTTCCT
GGTGGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An04:533499..535606+ >CBS51388_003119-T1 ID=CBS51388_003119-T1|Name=CBS51388_003119-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=4074bp|location=Sequence derived from alignment at An04:533499..535606+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCCGACAGCTTGAAGATGGGAAACCTTTCCCTCAACGAGTCTCAGCA
CGCTCCTGCCCCTGCCCCCTCCACGGGTCGCGCCGCTTACATCCCTCCCC
ATCTTCGCGGACGCCAGATGGGTGGAAACATGGACGGTGCTGCCGCCGCT
GCCCCTCCCCCCGGTCCCGCCGCTGGCCCTGGCAACTCCTGGGGTGGTCC
TAGAGGCGGCCCTCGTGGTGGCCAGTGGGCCAACGCCAACGCTCCTGATT
TCAGCCCTCGCGGTCCCAATGGTAACACTAGCTGGAGCCCTCACGAAGCT
CGCCGGCCCTTTAATCCAAATGCTTACGGACACCCAGGTCACGGAGGTTC
TTATGGAAGTGGAGGTGGTTCTGCCCGAGGCTCTGGAGATGGCCAGTGGC
GTGACGGCAAGCACATTCCCGGTCCTGCCAATCCCCGTCTCGAACGCGAA
CTGTTCGGTCTTCCCAACGATCCCACCAAGCAAAACACTGGCATCAACTT
TGCCAACTACGACGACATCCCCGTGGAGGCCTCTGGTCACGATGTCCCGG
AGCCGGTCAACGCCTTCACCAACCCGCCCCTGGATGACCACCTGATCGAG
AACATCAAGCTCGCCCACTACCAGACTCCCACTCCCGTCCAGAAGTATTC
CATCCCCATCGTCATGAACGGCCGCGACTTGATGGCCTGCGCCCAGACTG
GTTCCGGAAAGACTGGTGGTTTCCTCTTCCCTATTTTGTCTCAGGCTTAT
CAGAACGGTCCTTCCGCTGCTCCTGCCCAGGCCGGCGGCCAATTTGGCTA
CGGACGTCAACGCAAGGCGTACCCGACCTCCCTCATTCTCGCCCCCACCC
GTGAGCTTGTTTCCCAGATTTTCGATGAGGCCCGCAAGTTCGCCTACCGC
TCTTGGGTCCGCCCTTGTGTTGTGTACGGTGGTGCCGATATCGGCTCCCA
GCTCCGCCAGATCGAGCGCGGATGTGATCTTCTGGTTGCTACTCCTGGTC
GTCTTGTCGATCTTATCGAGCGTGGCCGCATCTCTCTGGTCAACATCAAG
TACCTGATTCTCGATGAGGCCGATCGTATGTTGGACATGGGTTTCGAGCC
CCAGATTCGCCGCATTGTGGAAGGCGAGGATATGCCCCACGTGAACGACC
GCCAGACGCTGATGTTTTCGGCCACCTTCCCCCGTGACATCCAGATGCTG
GCTCGCGACTTCTTGAAGGACTACGTCTTCCTGTCCGTCGGCCGTGTCGG
TTCTACCTCTGAGAACATCACCCAGAAGGTTGAATACGTTGAGGACCACG
ACAAGCGCTCCGTCCTCTTGGATATCCTCCACACGCACGGCACTAGCGGT
CTGACCCTCATCTTCGTCGAAACCAAGCGTATGGCCGACTCCCTGTCCGA
CTTCCTTCTCAACCAGCGTTTCCCCGCCACCGCTATTCACGGTGATCGTA
CCCAGCGTGAGCGTGAGCGTGCTTTGGAAATGTTCCGCTCTGGCCGTTGC
CCTATCCTTGTTGCCACTGCTGTTGCTGCTCGTGGTCTCGATATCCCCAA
TGTTACCCACGTCATCAACTACGACTTGCCTACCGACATCGATGACTATG
TTCACCGTATCGGTCGTACTGGTCGTGCCGGTAACACTGGTATCGCCACT
GCTTTCTTCAACCGTGGTAACCGGGGTGTTGTCCGCGACCTGATTGATCT
CCTGAAGGAGGCTCATCAGGAGGTCCCCTCCTTCCTCGAGAGCATTGCTC
GTGAGGGCAGCGGCTATGGTGGTCGTGGCGGCCGTGGTGGCCGTGGTCGT
GGCGCCAACGCTACCCGTGACATGCGTCGCATGGGCGGTGGTATGGGCGG
TCCTCCCTCCTTTGGTGGCAGCAGCTACGGTGCACCTGGCGGCAGCTATG
GTGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCTATGGCGCTCCTCCCTCCTATGGA
GGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCAGCTACGGTGGTGGTTACGGCAA
CCCGTCCGGCCCTACTGGACCTTCTTCCTGGTGGTAAATGGCCGACAGCT
TGAAGATGGGAAACCTTTCCCTCAACGAGTCTCAGCACGCTCCTGCCCCT
GCCCCCTCCACGGGTCGCGCCGCTTACATCCCTCCCCATCTTCGCGGACG
CCAGATGGGTGGAAACATGGACGGTGCTGCCGCCGCTGCCCCTCCCCCCG
GTCCCGCCGCTGGCCCTGGCAACTCCTGGGGTGGTCCTAGAGGCGGCCCT
CGTGGTGGCCAGTGGGCCAACGCCAACGCTCCTGATTTCAGCCCTCGCGG
TCCCAATGGTAACACTAGCTGGAGCCCTCACGAAGCTCGCCGGCCCTTTA
ATCCAAATGCTTACGGACACCCAGGTCACGGAGGTTCTTATGGAAGTGGA
GGTGGTTCTGCCCGAGGCTCTGGAGATGGCCAGTGGCGTGACGGCAAGCA
CATTCCCGGTCCTGCCAATCCCCGTCTCGAACGCGAACTGTTCGGTCTTC
CCAACGATCCCACCAAGCAAAACACTGGCATCAACTTTGCCAACTACGAC
GACATCCCCGTGGAGGCCTCTGGTCACGATGTCCCGGAGCCGGTCAACGC
CTTCACCAACCCGCCCCTGGATGACCACCTGATCGAGAACATCAAGCTCG
CCCACTACCAGACTCCCACTCCCGTCCAGAAGTATTCCATCCCCATCGTC
ATGAACGGCCGCGACTTGATGGCCTGCGCCCAGACTGGTTCCGGAAAGAC
TGGTGGTTTCCTCTTCCCTATTTTGTCTCAGGCTTATCAGAACGGTCCTT
CCGCTGCTCCTGCCCAGGCCGGCGGCCAATTTGGCTACGGACGTCAACGC
AAGGCGTACCCGACCTCCCTCATTCTCGCCCCCACCCGTGAGCTTGTTTC
CCAGATTTTCGATGAGGCCCGCAAGTTCGCCTACCGCTCTTGGGTCCGCC
CTTGTGTTGTGTACGGTGGTGCCGATATCGGCTCCCAGCTCCGCCAGATC
GAGCGCGGATGTGATCTTCTGGTTGCTACTCCTGGTCGTCTTGTCGATCT
TATCGAGCGTGGCCGCATCTCTCTGGTCAACATCAAGTACCTGATTCTCG
ATGAGGCCGATCGTATGTTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATTCGCCGC
ATTGTGGAAGGCGAGGATATGCCCCACGTGAACGACCGCCAGACGCTGAT
GTTTTCGGCCACCTTCCCCCGTGACATCCAGATGCTGGCTCGCGACTTCT
TGAAGGACTACGTCTTCCTGTCCGTCGGCCGTGTCGGTTCTACCTCTGAG
AACATCACCCAGAAGGTTGAATACGTTGAGGACCACGACAAGCGCTCCGT
CCTCTTGGATATCCTCCACACGCACGGCACTAGCGGTCTGACCCTCATCT
TCGTCGAAACCAAGCGTATGGCCGACTCCCTGTCCGACTTCCTTCTCAAC
CAGCGTTTCCCCGCCACCGCTATTCACGGTGATCGTACCCAGCGTGAGCG
TGAGCGTGCTTTGGAAATGTTCCGCTCTGGCCGTTGCCCTATCCTTGTTG
CCACTGCTGTTGCTGCTCGTGGTCTCGATATCCCCAATGTTACCCACGTC
ATCAACTACGACTTGCCTACCGACATCGATGACTATGTTCACCGTATCGG
TCGTACTGGTCGTGCCGGTAACACTGGTATCGCCACTGCTTTCTTCAACC
GTGGTAACCGGGGTGTTGTCCGCGACCTGATTGATCTCCTGAAGGAGGCT
CATCAGGAGGTCCCCTCCTTCCTCGAGAGCATTGCTCGTGAGGGCAGCGG
CTATGGTGGTCGTGGCGGCCGTGGTGGCCGTGGTCGTGGCGCCAACGCTA
CCCGTGACATGCGTCGCATGGGCGGTGGTATGGGCGGTCCTCCCTCCTTT
GGTGGCAGCAGCTACGGTGCACCTGGCGGCAGCTATGGTGGCGGCGGCGG
CGGCAGCAGCAGCTATGGCGCTCCTCCCTCCTATGGAGGCGGTGGTGGCT
ATGGCGGCGGCGGCAGCTACGGTGGTGGTTACGGCAACCCGTCCGGCCCT
ACTGGACCTTCTTCCTGGTGGTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
| GO:0005524 | ATP binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR027417 |
| DBxref | InterPro:IPR014014 |
| DBxref | InterPro:IPR000629 |
| DBxref | InterPro:IPR011545 |
| DBxref | InterPro:IPR001650 |
| DBxref | InterPro:IPR014001 |
| DBxref | PFAM:PF00271 |
| DBxref | PFAM:PF00270 |
| Product | DEAD-box ATP-dependent RNA helicase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An04 | supercontig | An04:533499..535606 + |
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