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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An08:736604..738354- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_005191-T1 ID=CBS51388_005191-T1|Name=CBS51388_005191-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1751bp|location=Sequence derived from alignment at An08:736604..738354- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGG
TAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCGTATGTCTTCCCT
AGATATGTGACGCAGGCTATGACTGGGCTCATCCCCACTAACTGATTCCA
GTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGA
TGATTCCTGGTGTCGGGTATGATACCACCTGTCAACCTCCAAGCCATTGA
GCCCCTCCAACTGACGGCAACAGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACG
CAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGG
TGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACC
GCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTT
GGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTG
TCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACGTGAGTGTCCCCAAATCCGAAG
CAACCTTCATGATTGATAACTGATAACGGAGATAGGGTTGCCCTTGCTGT
TGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCT
TCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAAC
TCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTAC
TCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGC
TCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCAC
AACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTT
CGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGG
CAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGC
ATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTC
CGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGA
CACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAAC
TACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATAT
CTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTC
TTTTTGCTGCGTAAGGCCCCCTGATCTCTATAGAAAACAGACAACCTCAA
ACCGGTGGGCACTCAACTAACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGC
CCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACT
ACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTAC
TCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGG
TCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACG
CTGAAATTGGTGAATTTGCCGTAAGTGCCTTCCCATATCATCGAAGTAAA
CGACTCTCCCTCTAACAAAAACTAGTACGACTACGTGGAAATCACCCGCG
ATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGC
ACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTG
A back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An08:736604..738354- >CBS51388_005191-T1 ID=CBS51388_005191-T1|Name=CBS51388_005191-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=8640bp|location=Sequence derived from alignment at An08:736604..738354- (Aspergillus niger CBS 513.88) TACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGA GAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACG AAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGG TTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTG GCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGT AGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCG TATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTG AATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCAT GCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATC CAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGT GGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGC TGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCC ACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACC GTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAG CGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCT CCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAG TGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCAT CACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAG TTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTT CGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCT CGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTC TCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCT GTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTT TTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGA AGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATT CTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATC GCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGT CGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGG TGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACG TGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGAC GTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGT GGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTC ATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCT GGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCA TCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAA GAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGG TTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGC ATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTG CTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACT TCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCA TACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAA CTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCT GGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTG CGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGG TGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCG TCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGC TCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGC CGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACG ACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAAC CTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACG CAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGG TGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACC GCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTT GGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTG TCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTA TCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGG AATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCC CTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCAC CCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCA AGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAG GCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAG GCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCC ATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGT CATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGA TCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGC TGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTA GCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGG AACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGG TACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGA TGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCG CACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTG GTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCA TGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGG TGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTG CTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCG TGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGC AACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGA TATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTG GTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCA TTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCA ATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGT ACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCT TCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGG AATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTAC GGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGT CGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAG ATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTC ATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCAT GACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGAC TACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAA CCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCA TGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTG ATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGT CGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCA GTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTG GTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCG GCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTC CACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAA GCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCA CACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTC AATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGT TGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGG ATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTC ATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTG GGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCA CGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCA GTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGC TGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAA TATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTC TGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGA CCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCA GCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCT GCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTG TTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAAT GGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACAT CTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCA CCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCC AACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCC ACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTAC ATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTC GTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTC TTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCT GAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAAC GCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATT ATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTA CAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCT CCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGA CATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGT CATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCT CTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAAC CTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACT GGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTC TCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTC ATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAA GTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCA TTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTC TACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTC AATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACT CGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAAT TTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGT CCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTC TGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGA TTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACA ATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGC TACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGA GAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACG AAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGG TTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTG GCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGT AGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCG TATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTG AATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCAT GCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATC CAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGT GGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGC TGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCC ACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACC GTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAG CGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCT CCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAG TGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCAT CACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAG TTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTT CGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCT CGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
GO:0005887 | integral component of plasma membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0008519 | ammonium transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0015696 | ammonium transport |
GO:0072488 | ammonium transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR018047 |
DBxref | InterPro:IPR024041 |
DBxref | InterPro:IPR001905 |
DBxref | InterPro:IPR029020 |
DBxref | InterPro:IPR002229 |
DBxref | PFAM:PF00909 |
Product | ammonium transporter Amt1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
An08 | supercontig | An08:736604..738354 - |
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