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The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An08:2517127..2520017- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_005772-T1 ID=CBS51388_005772-T1|Name=CBS51388_005772-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=2891bp|location=Sequence derived from alignment at An08:2517127..2520017- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGATTACCACAAGGCTTGCGCGCATGGGTGCGCTGGTAAGTCCACTCCA
GACACGTTGTCCCCCGTCTGGCGAAGAAGTCATGGCATTCTGTCCAGGAA
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CCTGCTCCTTAGGCCCCTAAGTCCCGCCTTGTAAGCGTTTACCCGCAATC
CAGTCCAAGCTCGCATCACCAGATTACAGCGGAAGTGCGATGATTCGATG
AACAGAAAGACTAATCATATGTGCAGATGCTCGGGGCTCGGGGTATGGCC
ACCGTCACCGACTCTCCCCTCGACAAGAAGGTCGAGATGTCCAACCTGGA
GAAGGTGAGTGAACTTTCCATTACGTCTCGGCTGGCTTCGGGTAGTGCGG
GCGCCAGATTAGGGAATATGATCCGCTAACAATAATTGTGCAGGGTAACT
ACATCAACTACAAGTATGATAGCACTCTTGATTCTCCGGAAAAATCGGCG
CGATCTCTCAATCGCGCCTTGTCAGGTCAATGAGCTGTTAGCTAACATGT
CTACCACTTCTATAGGAAGATGTCCGAGAACCTCGACATCGTTCGTCGTC
GTCTGAGCCGTCCTCTCACATACGCCGAGAAGGTTCTGTACTCTCACCTT
GACGACCCCCACGGACAGGAGATCGAGCGTGGCAGCTCCTACCTCAAGCT
GCGCCCCGACCGTGTCGCTTGCCAGGATGCCACTGCCCAGATGGCTATCC
TCCAGTTCATGTCCGCTGGCATGCCCTCCGTCGCTACTCCCACTACCGTC
CACTGTGACCACTTGATTGAGGCCCAGGTCGGTGGTGACAAGGATCTTGC
TCGTGCCAACGACATCAACAAGGAAGTCTACGACTTCCTTGCCTCTGCTA
CTGCCAAGTACAACATCGGTTTCTGGAAGCCCGGTTCCGGTATCATCCAC
CAGATCGTTCTGGAGAACTACGCTTTCCCCGGTGGTCTCATGATCGGTAC
CGACTCTCACACCCCTAACGCTGGTGGTCTCGCCACTGCTGCCATCGGTG
TTGGTGGTGCTGATGCCGTCGACGTTATGGCTGGTCTCCCTTGGGAGCTG
AAGGCCCCCAAGGTCATCGGTGTTAAGCTCACCGGTCAGATGTCCGGCTG
GACTACTCCTAAGGGTAAGTTGACTTCTTACGTGTCTTACAAGATTGGAC
GAGCGTTAACAGTGAAATCTAGATATCATCCTCAAGGTTGCTGGTCTCCT
CACCGTCAAGGGTGGTACTGGCGCTATCATCGAGTACCACGGACCTGGTG
TCAACTCCCTGTCCTGCACTGGTATGGCCACCATCTGTAATATGGGTGCT
GAGATTGGTGCCACCACCTCCATGTTCCCCTTCAACGACCGCATGTACGA
TTACCTGAAGGCCACCAAGCGTCAGCACATTGGTAACTTCTCCCGCGAGT
ACGCCAAGGAGCTCCGCGAGGATGAGGGTGCTGAGTACGACCAGCTGATT
GAGATCAACCTGTCCGAGCTCGAGCCCCATGTCAACGGTCCCTTCACTCC
TGACTTGGCCACCCCCATCTCCAAGTTCAAGGAGGCCGTTGAGGCCAACA
AGTGGCCCGAGGAGCTCAAGGTTGGTCTTATCGGCTCTTGCACCAACTCC
TCCTACGAGGACATGTCCCGCGCTGCCTCCATTGCTCAGGACGCCCTTGA
CCACGGTCTGAAGTCCAAGTCCCTCTTCACCGTCACCCCCGGTTCCGAGC
AGATCCGTGCTACCATTGAGCGCGATGGTCAGCTCAAGACCCTTGAGGAG
TACGGTGGTGTTATCCTTGCCAACGCCTGCGGTCCTTGCATTGGACAGTG
GGATCGTAAGGACGTCAAGAAGGGTGAGGCCAACTCTATCATCTCCTCCT
ACAACCGTAACTTCACCGGTCGTAACGATGCCAACCCCGCCACCCACGCT
TTCGTCGCCTCTCCCGACCTGGTCGTCGCCATGACTGTTGCCGGTACCCT
CAAGTTCAACCCTCTCACCGACAAGCTGAAGGACAAGGACGGCAAGGAGT
TCATGCTCAAGCCCCCCTCCGGCGAGGGTCTCCCTGCTCAGGGCTACGAC
CCCGGCCGTGACACCTACCAGGCTCCTCCCACCAACCGCGAGGGCGTCAA
CGTCGCTGTCGCTCCCACCAGTGACCGTCTCCAGATCCTTGCTGGTTTCG
AGAAGTGGGATGGCAAGGATGCCACTGGCATCCCTATCCTGATCAAGTGC
CAGGGCAAGACCACCACCGACCACATCTCCATGGCTGGCCCGTGGTTGAA
GTACCGTGGTCACCTTGACAACATCTCCAACAACATGCTGATTGGTGCCA
TCAACGCCGAGAACGGTGAGGCCAACAAGGTCAAGAACGCCTTCACCGGC
GAGTACGATGCCGTCCCCGCTACTGCCCGTGACTACAAGGCCCGTGGCGT
CAAGTGGGTTGTCATCGGTGACTGGAACTACGGTGAGGGTTCTTCCCGTG
AGCACGCTGCTCTGGAGCCCCGCCACCTTGGTGGTCTTGCCATCATCACC
CGCTCCTTCGCTCGTATTGTAAGTTCTCTCCAGTCTTGACTACCATAACA
CTCTGAACGCGAACTAACGTCATCCTTTAGCACGAGACCAACCTGAAGAA
GCAGGGTATGCTTCCTCTTACCTTCTCCGACCCCGCCGACTACGACAAGA
TCAAGCCCGAGGACAAGGTCGACCTCCTCTGCACTGAGCTCGAGGTTGGC
AAGCCCGTCACTCTGCGTGTCCACCCCAAGGACGGTGCCTCCTTCGACAT
CAAGCTCAGCCACACCTTCAACGAGTCCCAGATTGAGTGGTTCCGCGATG
GTTCCGCCCTCAACACCATGGCCCGCAAGGCTGGCAACTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An08:2517127..2520017- >CBS51388_005772-T1 ID=CBS51388_005772-T1|Name=CBS51388_005772-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=16506bp|location=Sequence derived from alignment at An08:2517127..2520017- (Aspergillus niger CBS 513.88) CACGAGACCAACCTGAAGAAGCAGGGTATGCTTCCTCTTACCTTCTCCGA CCCCGCCGACTACGACAAGATCAAGCCCGAGGACAAGGTCGACCTCCTCT GCACTGAGCTCGAGGTTGGCAAGCCCGTCACTCTGCGTGTCCACCCCAAG GACGGTGCCTCCTTCGACATCAAGCTCAGCCACACCTTCAACGAGTCCCA GATTGAGTGGTTCCGCGATGGTTCCGCCCTCAACACCATGGCCCGCAAGG CTGGCAACTAAATATCATCCTCAAGGTTGCTGGTCTCCTCACCGTCAAGG GTGGTACTGGCGCTATCATCGAGTACCACGGACCTGGTGTCAACTCCCTG TCCTGCACTGGTATGGCCACCATCTGTAATATGGGTGCTGAGATTGGTGC CACCACCTCCATGTTCCCCTTCAACGACCGCATGTACGATTACCTGAAGG CCACCAAGCGTCAGCACATTGGTAACTTCTCCCGCGAGTACGCCAAGGAG CTCCGCGAGGATGAGGGTGCTGAGTACGACCAGCTGATTGAGATCAACCT GTCCGAGCTCGAGCCCCATGTCAACGGTCCCTTCACTCCTGACTTGGCCA CCCCCATCTCCAAGTTCAAGGAGGCCGTTGAGGCCAACAAGTGGCCCGAG GAGCTCAAGGTTGGTCTTATCGGCTCTTGCACCAACTCCTCCTACGAGGA CATGTCCCGCGCTGCCTCCATTGCTCAGGACGCCCTTGACCACGGTCTGA AGTCCAAGTCCCTCTTCACCGTCACCCCCGGTTCCGAGCAGATCCGTGCT ACCATTGAGCGCGATGGTCAGCTCAAGACCCTTGAGGAGTACGGTGGTGT TATCCTTGCCAACGCCTGCGGTCCTTGCATTGGACAGTGGGATCGTAAGG ACGTCAAGAAGGGTGAGGCCAACTCTATCATCTCCTCCTACAACCGTAAC TTCACCGGTCGTAACGATGCCAACCCCGCCACCCACGCTTTCGTCGCCTC TCCCGACCTGGTCGTCGCCATGACTGTTGCCGGTACCCTCAAGTTCAACC CTCTCACCGACAAGCTGAAGGACAAGGACGGCAAGGAGTTCATGCTCAAG CCCCCCTCCGGCGAGGGTCTCCCTGCTCAGGGCTACGACCCCGGCCGTGA CACCTACCAGGCTCCTCCCACCAACCGCGAGGGCGTCAACGTCGCTGTCG CTCCCACCAGTGACCGTCTCCAGATCCTTGCTGGTTTCGAGAAGTGGGAT GGCAAGGATGCCACTGGCATCCCTATCCTGATCAAGTGCCAGGGCAAGAC CACCACCGACCACATCTCCATGGCTGGCCCGTGGTTGAAGTACCGTGGTC ACCTTGACAACATCTCCAACAACATGCTGATTGGTGCCATCAACGCCGAG AACGGTGAGGCCAACAAGGTCAAGAACGCCTTCACCGGCGAGTACGATGC CGTCCCCGCTACTGCCCGTGACTACAAGGCCCGTGGCGTCAAGTGGGTTG TCATCGGTGACTGGAACTACGGTGAGGGTTCTTCCCGTGAGCACGCTGCT CTGGAGCCCCGCCACCTTGGTGGTCTTGCCATCATCACCCGCTCCTTCGC TCGTATTGAAGATGTCCGAGAACCTCGACATCGTTCGTCGTCGTCTGAGC CGTCCTCTCACATACGCCGAGAAGGTTCTGTACTCTCACCTTGACGACCC CCACGGACAGGAGATCGAGCGTGGCAGCTCCTACCTCAAGCTGCGCCCCG ACCGTGTCGCTTGCCAGGATGCCACTGCCCAGATGGCTATCCTCCAGTTC ATGTCCGCTGGCATGCCCTCCGTCGCTACTCCCACTACCGTCCACTGTGA CCACTTGATTGAGGCCCAGGTCGGTGGTGACAAGGATCTTGCTCGTGCCA ACGACATCAACAAGGAAGTCTACGACTTCCTTGCCTCTGCTACTGCCAAG TACAACATCGGTTTCTGGAAGCCCGGTTCCGGTATCATCCACCAGATCGT TCTGGAGAACTACGCTTTCCCCGGTGGTCTCATGATCGGTACCGACTCTC ACACCCCTAACGCTGGTGGTCTCGCCACTGCTGCCATCGGTGTTGGTGGT GCTGATGCCGTCGACGTTATGGCTGGTCTCCCTTGGGAGCTGAAGGCCCC CAAGGTCATCGGTGTTAAGCTCACCGGTCAGATGTCCGGCTGGACTACTC CTAAGGGGTAACTACATCAACTACAAATGCTCGGGGCTCGGGGTATGGCC ACCGTCACCGACTCTCCCCTCGACAAGAAGGTCGAGATGTCCAACCTGGA GAAGGCCCCTAAGTCCCGCCTTATGATTACCACAAGGCTTGCGCGCATGG GTGCGCTGCACGAGACCAACCTGAAGAAGCAGGGTATGCTTCCTCTTACC TTCTCCGACCCCGCCGACTACGACAAGATCAAGCCCGAGGACAAGGTCGA CCTCCTCTGCACTGAGCTCGAGGTTGGCAAGCCCGTCACTCTGCGTGTCC 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TGCTCAAGCCCCCCTCCGGCGAGGGTCTCCCTGCTCAGGGCTACGACCCC GGCCGTGACACCTACCAGGCTCCTCCCACCAACCGCGAGGGCGTCAACGT CGCTGTCGCTCCCACCAGTGACCGTCTCCAGATCCTTGCTGGTTTCGAGA AGTGGGATGGCAAGGATGCCACTGGCATCCCTATCCTGATCAAGTGCCAG GGCAAGACCACCACCGACCACATCTCCATGGCTGGCCCGTGGTTGAAGTA CCGTGGTCACCTTGACAACATCTCCAACAACATGCTGATTGGTGCCATCA ACGCCGAGAACGGTGAGGCCAACAAGGTCAAGAACGCCTTCACCGGCGAG TACGATGCCGTCCCCGCTACTGCCCGTGACTACAAGGCCCGTGGCGTCAA GTGGGTTGTCATCGGTGACTGGAACTACGGTGAGGGTTCTTCCCGTGAGC ACGCTGCTCTGGAGCCCCGCCACCTTGGTGGTCTTGCCATCATCACCCGC TCCTTCGCTCGTATTGAAGATGTCCGAGAACCTCGACATCGTTCGTCGTC GTCTGAGCCGTCCTCTCACATACGCCGAGAAGGTTCTGTACTCTCACCTT GACGACCCCCACGGACAGGAGATCGAGCGTGGCAGCTCCTACCTCAAGCT GCGCCCCGACCGTGTCGCTTGCCAGGATGCCACTGCCCAGATGGCTATCC TCCAGTTCATGTCCGCTGGCATGCCCTCCGTCGCTACTCCCACTACCGTC CACTGTGACCACTTGATTGAGGCCCAGGTCGGTGGTGACAAGGATCTTGC TCGTGCCAACGACATCAACAAGGAAGTCTACGACTTCCTTGCCTCTGCTA CTGCCAAGTACAACATCGGTTTCTGGAAGCCCGGTTCCGGTATCATCCAC CAGATCGTTCTGGAGAACTACGCTTTCCCCGGTGGTCTCATGATCGGTAC 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CAACAAGTGGCCCGAGGAGCTCAAGGTTGGTCTTATCGGCTCTTGCACCA ACTCCTCCTACGAGGACATGTCCCGCGCTGCCTCCATTGCTCAGGACGCC CTTGACCACGGTCTGAAGTCCAAGTCCCTCTTCACCGTCACCCCCGGTTC CGAGCAGATCCGTGCTACCATTGAGCGCGATGGTCAGCTCAAGACCCTTG AGGAGTACGGTGGTGTTATCCTTGCCAACGCCTGCGGTCCTTGCATTGGA CAGTGGGATCGTAAGGACGTCAAGAAGGGTGAGGCCAACTCTATCATCTC CTCCTACAACCGTAACTTCACCGGTCGTAACGATGCCAACCCCGCCACCC ACGCTTTCGTCGCCTCTCCCGACCTGGTCGTCGCCATGACTGTTGCCGGT ACCCTCAAGTTCAACCCTCTCACCGACAAGCTGAAGGACAAGGACGGCAA GGAGTTCATGCTCAAGCCCCCCTCCGGCGAGGGTCTCCCTGCTCAGGGCT ACGACCCCGGCCGTGACACCTACCAGGCTCCTCCCACCAACCGCGAGGGC GTCAACGTCGCTGTCGCTCCCACCAGTGACCGTCTCCAGATCCTTGCTGG TTTCGAGAAGTGGGATGGCAAGGATGCCACTGGCATCCCTATCCTGATCA AGTGCCAGGGCAAGACCACCACCGACCACATCTCCATGGCTGGCCCGTGG TTGAAGTACCGTGGTCACCTTGACAACATCTCCAACAACATGCTGATTGG TGCCATCAACGCCGAGAACGGTGAGGCCAACAAGGTCAAGAACGCCTTCA CCGGCGAGTACGATGCCGTCCCCGCTACTGCCCGTGACTACAAGGCCCGT GGCGTCAAGTGGGTTGTCATCGGTGACTGGAACTACGGTGAGGGTTCTTC CCGTGAGCACGCTGCTCTGGAGCCCCGCCACCTTGGTGGTCTTGCCATCA 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CAGCCACACCTTCAACGAGTCCCAGATTGAGTGGTTCCGCGATGGTTCCG CCCTCAACACCATGGCCCGCAAGGCTGGCAACTAAATATCATCCTCAAGG TTGCTGGTCTCCTCACCGTCAAGGGTGGTACTGGCGCTATCATCGAGTAC CACGGACCTGGTGTCAACTCCCTGTCCTGCACTGGTATGGCCACCATCTG TAATATGGGTGCTGAGATTGGTGCCACCACCTCCATGTTCCCCTTCAACG ACCGCATGTACGATTACCTGAAGGCCACCAAGCGTCAGCACATTGGTAAC TTCTCCCGCGAGTACGCCAAGGAGCTCCGCGAGGATGAGGGTGCTGAGTA CGACCAGCTGATTGAGATCAACCTGTCCGAGCTCGAGCCCCATGTCAACG GTCCCTTCACTCCTGACTTGGCCACCCCCATCTCCAAGTTCAAGGAGGCC GTTGAGGCCAACAAGTGGCCCGAGGAGCTCAAGGTTGGTCTTATCGGCTC TTGCACCAACTCCTCCTACGAGGACATGTCCCGCGCTGCCTCCATTGCTC AGGACGCCCTTGACCACGGTCTGAAGTCCAAGTCCCTCTTCACCGTCACC CCCGGTTCCGAGCAGATCCGTGCTACCATTGAGCGCGATGGTCAGCTCAA GACCCTTGAGGAGTACGGTGGTGTTATCCTTGCCAACGCCTGCGGTCCTT GCATTGGACAGTGGGATCGTAAGGACGTCAAGAAGGGTGAGGCCAACTCT ATCATCTCCTCCTACAACCGTAACTTCACCGGTCGTAACGATGCCAACCC CGCCACCCACGCTTTCGTCGCCTCTCCCGACCTGGTCGTCGCCATGACTG TTGCCGGTACCCTCAAGTTCAACCCTCTCACCGACAAGCTGAAGGACAAG GACGGCAAGGAGTTCATGCTCAAGCCCCCCTCCGGCGAGGGTCTCCCTGC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003994 | aconitate hydratase activity |
GO:0051539 | 4 iron, 4 sulfur cluster binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036008 |
DBxref | InterPro:IPR018136 |
DBxref | InterPro:IPR000573 |
DBxref | InterPro:IPR015928 |
DBxref | InterPro:IPR015932 |
DBxref | InterPro:IPR015931 |
DBxref | InterPro:IPR006248 |
DBxref | InterPro:IPR001030 |
DBxref | PFAM:PF00694 |
DBxref | PFAM:PF00330 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
An08 | supercontig | An08:2517127..2520017 - |
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