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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An09:1456202..1460096+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_006374-T1 ID=CBS51388_006374-T1|Name=CBS51388_006374-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=3895bp|location=Sequence derived from alignment at An09:1456202..1460096+ (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGTGTTCAAGCCTCTTACCATCGCTGCCGCGATAGCCGGCCTCACTCC
TTTTGTGTCCGCTTTCGATGCCCAGGCAAAGTCCAACGTTGCCGTTTACT
ACGTATGTTCTGACCACCCAAGCGCCCGTTCAGCCATTATAACTTGTACT
TATCTGTCTATAGGGTCAAGGATATGGTCAACAACGGTTGAGCCATTTCT
GCCAGGAAACCTCGTTGGATATCATCAACATTGGATTCATCAATACTTTC
CCTGATCAGGGAGCTGCCGGGTGGCCGGGTAGTAACTTCGGCAATCAATG
TGATGGCCTGACTTATGAAGTTGACGGCGTCTCAACGAAGCTCCTTTCTG
GTTGTCACCAGATTGCAGAAGATATTCCCATCTGCCAAGCAGCAGGAAAG
AAGGTTTTACTGTCCCTTGGTGGTGCCTCTCCCGACAACCAGCAGATTCT
GTCAGATGCCTCTGCTGTTCGGTTCGCCGATTTCCTCTGGGGTGCCTTTG
GTCCGCAGACGGAGGAATGGGTGTCGAATGATGGTCCTCGTCCTTTTGGA
GAGGTTGTTGTTGATGGGTTTGATTTCGACATTGAGCACAACGGCGGTTT
TGGTATGTCTCCCGCTCGAGGACTTTTGTTATTAATGTGCACCCCCCTCT
AATCGTGACCAGGATATGCGACTATGGTCAATCGGTTCCGAGAGCTTTTC
GCTTTGGTCCCGGAGCGTACCTTCTACATCTCTGGTGCCCCCCAGTGCCC
GATACCCGACCCTCAACTCAGTGATGCAATCGCCCAATCCCCTTTTGACT
TCGTTTGGGTGCAATTCTATAACACTGCTGGCTGTGCCGCTAGCGACTCC
ATCAATGGTGTCAGCACCGGCTTCAACTTTGATGACTGGGTGGATGTCAT
CAAGCGTGGAGCCAACCCGGACGCAAAGCTCTATGTGGGATTGCCTGCCG
GCCCCGGTGCAGCAGGAGCGGGATACTACCTGACACCGGAGGAAGTCTAC
CCTCTAGTGGATGTGTATATGAACCTCTACCCGGAGACGTTTGGAGGAAT
CATGCTTTGGGAAGCAACGGCTTCGGATGAGAACACGTTCAGTGGACTCA
CATTTGCCGACGTGATCAAAGACATTCTGGTTGCAGTTGACCCTTCACCA
CCGGTTCCCAGCCCTTCGTCTAGCAGCGTTATCGCCTCAAGCACACCTGT
GGCCTCGAGTACCCCTGTTGCATCAAGCGCTCCCGCTTCATCCACCCCGA
TTTCCTCAGGCAGCCCAGTTCCGTCAAGCTCTGCTGTTTCCAGCTCCCCC
GCGGTTTCAAGTACTACCGAGTCTTCAAGTACTCAGGTGGTATCGGGCAG
CGTCTCTGCGTCGAGTAGCCCTATTACATCAAGCCCTGTGGCTTCCAGCA
CTCCAGTGGCAAGTAGCGCGCCCTCGGCTACCAGTTCCGCTGTGGCTTCC
AGCTCACCTATTGCCCCAAGCTCCCCGGTTGCCTCTAGCTCTGCTATTGC
CTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTA
TTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCT
GCTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAG
CTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCT
CCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTCCTGTTGCGCCCAGCTCTCCTGTT
GCGTCTAGCTCTCCAGCAGTATCTAGCTCTGCCATCGTTTCCAGCACTCC
AGCGGTCAGCACTCCTGTGGCATCCAGCATCCCCGTTATCTCTAGCCCTG
CTATTGCATCTGGATCCGCTATTGCGTCTAGCTCTCATGTTGCTTCTTCA
AGCACCCCTGCGGCATCGAGCAGCCCCGCTGTCTCGAGTTCTCCTGTGGC
ATCGAGCAGTCCGGCCCTGTCAAGCAGCCCATCTGCATCTGCATCAAGCA
CACCTATCATTCCAAGCTCGACTGCCAGTTCTGCCGTCGTATCGAGCTCT
CCCACTCCTTCAAGCTCCGTTGTGAGATCAAGCTCTCTGCTCTCTTCCAG
CTCACCGGCCCTGTCCAGCACTCGCACTCCCAGCAATCCTGTTATTCCAA
GCAGTTCAGCCATTTCCATCACTCCTTCAAGCACGCCTGTCCGGTCAACT
TCGTCTGTTGCCCCAGGAAAGTCGTCCAGTGCCCCTGTTATTCCAAAGCC
ATCTTCCACGGTCATTGCAACTTTCACCAGTTCCTCTGGGTCATTGCCCT
CTTCCAGCGCTCCCGCTGGATCCGGCGTTCCATCATCATCTACCCTGCCA
CATCCTTCTAGCACATCGTTGCTGTCAAGCTCACCCGTTAGCTCCGCCGA
ACCGGTCTCTTCAAGTTCTGCTGTAGGAACCAGTGTGGGTTCCTCGTCCA
ATGTGGTCACTGGGGTGTCGACCAGGTCAAGCTCGTCAGTTGTCCCCTCT
GGCACGCCAATCCCGCCAGTTTCGGGAACAGCCACCGAGTCTGTTACTTC
TTCATCAAGTGGATCGGGCAGTCCCACCGTGCCAAGCTCAATCAACACGT
CGAGCACAGATGCTTCATCAAGCTCTTCCGCCTCTTCCGTGGAGCCTACT
TCCTCAGGATCGGTGATCACATCAGTGACTTCATCCAGCGCCTCTCGTGT
GTCAAGCTCCTCTAGCTCGGTTGTAATCACCAATCCATCGGTGCCTTCCG
ACAGCTCGTCCTCCTCTGGTAGCGAACTGTCGACAACCTCGAGTACCGAG
TCTACTAGCTCAGCATCAAGCCAGACCGGAGCGCCAACGACTTCCGTTTC
TTTGGGCAGCTCGGAAGCAGCCAGCACCTCAACCTCCGGTGCCGCTGCAA
GTGGCTCGGGTGCTCAGGACAGCACAAAACCTACTGATCACGCAAGCACT
CTTTCCCCATCGTACTCGACTCCCCTCGCCAGCGCCTCAGGACAAACAGG
TAGCCCAACTACCGTTCCAGCTGGTATACCAACCGGCAATGGAAGTGGAC
TCGCTCCGATCACTTCCAGCATCACATCTGCCCAGGCGGTACCTTCCGTC
ACATCCAGCGGCTTGGAGTCGGAGCCGGAGCCTACCATCACTACCACGGT
CATTGTGACTTCTTACATTGACATCTGCCCAGAAGGTTTCACTACGATCA
CCACGACTTACACCACTACCTACTGTCCTGCAACGGTGTCTGCCACAGCC
ACAGCCACAGCCGCCGTCACCAACCCTCCCGGCGCTCCAGCGCAGACCAC
GAGTCCCAGCGTCCCTGAGGGCTGGACGACGACTGTGACCGTATGCACTC
ACTGCGCTCCCACACCGACTACTGTGACCCTTACTTTGCCGGCCACCAAT
CGGCCGTCTGCGCTGGCGTCCTCGACCAGCGCACCGAACTCTCCTGAAGA
CTGGACCACTACGGTCAGTGTCTGCACTGACTGTGGTCCTACGCCTACCA
CGGTAACGGTCACGATCCCCGTCGGCGCTGCCACGGGTGTTGATGCCCTC
ACTGCCAGTCCGTCCGGCAGTCAGCCTGCCGGGGAGAGTTCGCCCGGTCA
AAGTGCCCCTACAGCCCCCGCGTCAACAGCCCCCACCACCACCGAGACAG
TCATTGTGGTCCCGAGCCAATCGTCAACCAGCCAGCCGGTAATTCTTGGA
ACCGGCAGCGTCCGTGCCTCATCGACCTTCCATATCCAGCCATCCCAGAG
CGGGTCCCGAGTGCCTGTGGCTCCCAGCGGCACGGCCGCCGGCGTGTCGC
CCGTATTCACCGGCGCGGCTTCGCGGGTGTCACGACTGCAACACGGTGCG
GGTGCAGTGTCAGCGTTTGCGCTGTTCCTCTTGGCAGCCATCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An09:1456202..1460096+ >CBS51388_006374-T1 ID=CBS51388_006374-T1|Name=CBS51388_006374-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=11322bp|location=Sequence derived from alignment at An09:1456202..1460096+ (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGTGTTCAAGCCTCTTACCATCGCTGCCGCGATAGCCGGCCTCACTCC TTTTGTGTCCGCTTTCGATGCCCAGGCAAAGTCCAACGTTGCCGTTTACT ACGGTCAAGGATATGGTCAACAACGGTTGAGCCATTTCTGCCAGGAAACC TCGTTGGATATCATCAACATTGGATTCATCAATACTTTCCCTGATCAGGG AGCTGCCGGGTGGCCGGGTAGTAACTTCGGCAATCAATGTGATGGCCTGA CTTATGAAGTTGACGGCGTCTCAACGAAGCTCCTTTCTGGTTGTCACCAG ATTGCAGAAGATATTCCCATCTGCCAAGCAGCAGGAAAGAAGGTTTTACT GTCCCTTGGTGGTGCCTCTCCCGACAACCAGCAGATTCTGTCAGATGCCT CTGCTGTTCGGTTCGCCGATTTCCTCTGGGGTGCCTTTGGTCCGCAGACG GAGGAATGGGTGTCGAATGATGGTCCTCGTCCTTTTGGAGAGGTTGTTGT TGATGGGTTTGATTTCGACATTGAGCACAACGGCGGTTTTGGATATGCGA CTATGGTCAATCGGTTCCGAGAGCTTTTCGCTTTGGTCCCGGAGCGTACC TTCTACATCTCTGGTGCCCCCCAGTGCCCGATACCCGACCCTCAACTCAG TGATGCAATCGCCCAATCCCCTTTTGACTTCGTTTGGGTGCAATTCTATA ACACTGCTGGCTGTGCCGCTAGCGACTCCATCAATGGTGTCAGCACCGGC TTCAACTTTGATGACTGGGTGGATGTCATCAAGCGTGGAGCCAACCCGGA CGCAAAGCTCTATGTGGGATTGCCTGCCGGCCCCGGTGCAGCAGGAGCGG GATACTACCTGACACCGGAGGAAGTCTACCCTCTAGTGGATGTGTATATG AACCTCTACCCGGAGACGTTTGGAGGAATCATGCTTTGGGAAGCAACGGC TTCGGATGAGAACACGTTCAGTGGACTCACATTTGCCGACGTGATCAAAG ACATTCTGGTTGCAGTTGACCCTTCACCACCGGTTCCCAGCCCTTCGTCT AGCAGCGTTATCGCCTCAAGCACACCTGTGGCCTCGAGTACCCCTGTTGC ATCAAGCGCTCCCGCTTCATCCACCCCGATTTCCTCAGGCAGCCCAGTTC CGTCAAGCTCTGCTGTTTCCAGCTCCCCCGCGGTTTCAAGTACTACCGAG TCTTCAAGTACTCAGGTGGTATCGGGCAGCGTCTCTGCGTCGAGTAGCCC TATTACATCAAGCCCTGTGGCTTCCAGCACTCCAGTGGCAAGTAGCGCGC CCTCGGCTACCAGTTCCGCTGTGGCTTCCAGCTCACCTATTGCCCCAAGC TCCCCGGTTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTC CAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTG CCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCT ATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTC 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GCTCTTCCGCCTCTTCCGTGGAGCCTACTTCCTCAGGATCGGTGATCACA TCAGTGACTTCATCCAGCGCCTCTCGTGTGTCAAGCTCCTCTAGCTCGGT TGTAATCACCAATCCATCGGTGCCTTCCGACAGCTCGTCCTCCTCTGGTA GCGAACTGTCGACAACCTCGAGTACCGAGTCTACTAGCTCAGCATCAAGC CAGACCGGAGCGCCAACGACTTCCGTTTCTTTGGGCAGCTCGGAAGCAGC CAGCACCTCAACCTCCGGTGCCGCTGCAAGTGGCTCGGGTGCTCAGGACA GCACAAAACCTACTGATCACGCAAGCACTCTTTCCCCATCGTACTCGACT CCCCTCGCCAGCGCCTCAGGACAAACAGGTAGCCCAACTACCGTTCCAGC TGGTATACCAACCGGCAATGGAAGTGGACTCGCTCCGATCACTTCCAGCA TCACATCTGCCCAGGCGGTACCTTCCGTCACATCCAGCGGCTTGGAGTCG GAGCCGGAGCCTACCATCACTACCACGGTCATTGTGACTTCTTACATTGA CATCTGCCCAGAAGGTTTCACTACGATCACCACGACTTACACCACTACCT ACTGTCCTGCAACGGTGTCTGCCACAGCCACAGCCACAGCCGCCGTCACC AACCCTCCCGGCGCTCCAGCGCAGACCACGAGTCCCAGCGTCCCTGAGGG CTGGACGACGACTGTGACCGTATGCACTCACTGCGCTCCCACACCGACTA CTGTGACCCTTACTTTGCCGGCCACCAATCGGCCGTCTGCGCTGGCGTCC TCGACCAGCGCACCGAACTCTCCTGAAGACTGGACCACTACGGTCAGTGT CTGCACTGACTGTGGTCCTACGCCTACCACGGTAACGGTCACGATCCCCG TCGGCGCTGCCACGGGTGTTGATGCCCTCACTGCCAGTCCGTCCGGCAGT CAGCCTGCCGGGGAGAGTTCGCCCGGTCAAAGTGCCCCTACAGCCCCCGC GTCAACAGCCCCCACCACCACCGAGACAGTCATTGTGGTCCCGAGCCAAT CGTCAACCAGCCAGCCGGTAATTCTTGGAACCGGCAGCGTCCGTGCCTCA TCGACCTTCCATATCCAGCCATCCCAGAGCGGGTCCCGAGTGCCTGTGGC TCCCAGCGGCACGGCCGCCGGCGTGTCGCCCGTATTCACCGGCGCGGCTT CGCGGGTGTCACGACTGCAACACGGTGCGGGTGCAGTGTCAGCGTTTGCG CTGTTCCTCTTGGCAGCCATCTAAATGGTGTTCAAGCCTCTTACCATCGC TGCCGCGATAGCCGGCCTCACTCCTTTTGTGTCCGCTTTCGATGCCCAGG CAAAGTCCAACGTTGCCGTTTACTACGGTCAAGGATATGGTCAACAACGG TTGAGCCATTTCTGCCAGGAAACCTCGTTGGATATCATCAACATTGGATT CATCAATACTTTCCCTGATCAGGGAGCTGCCGGGTGGCCGGGTAGTAACT TCGGCAATCAATGTGATGGCCTGACTTATGAAGTTGACGGCGTCTCAACG AAGCTCCTTTCTGGTTGTCACCAGATTGCAGAAGATATTCCCATCTGCCA AGCAGCAGGAAAGAAGGTTTTACTGTCCCTTGGTGGTGCCTCTCCCGACA ACCAGCAGATTCTGTCAGATGCCTCTGCTGTTCGGTTCGCCGATTTCCTC TGGGGTGCCTTTGGTCCGCAGACGGAGGAATGGGTGTCGAATGATGGTCC TCGTCCTTTTGGAGAGGTTGTTGTTGATGGGTTTGATTTCGACATTGAGC ACAACGGCGGTTTTGGATATGCGACTATGGTCAATCGGTTCCGAGAGCTT TTCGCTTTGGTCCCGGAGCGTACCTTCTACATCTCTGGTGCCCCCCAGTG CCCGATACCCGACCCTCAACTCAGTGATGCAATCGCCCAATCCCCTTTTG ACTTCGTTTGGGTGCAATTCTATAACACTGCTGGCTGTGCCGCTAGCGAC TCCATCAATGGTGTCAGCACCGGCTTCAACTTTGATGACTGGGTGGATGT CATCAAGCGTGGAGCCAACCCGGACGCAAAGCTCTATGTGGGATTGCCTG CCGGCCCCGGTGCAGCAGGAGCGGGATACTACCTGACACCGGAGGAAGTC TACCCTCTAGTGGATGTGTATATGAACCTCTACCCGGAGACGTTTGGAGG AATCATGCTTTGGGAAGCAACGGCTTCGGATGAGAACACGTTCAGTGGAC TCACATTTGCCGACGTGATCAAAGACATTCTGGTTGCAGTTGACCCTTCA CCACCGGTTCCCAGCCCTTCGTCTAGCAGCGTTATCGCCTCAAGCACACC TGTGGCCTCGAGTACCCCTGTTGCATCAAGCGCTCCCGCTTCATCCACCC CGATTTCCTCAGGCAGCCCAGTTCCGTCAAGCTCTGCTGTTTCCAGCTCC CCCGCGGTTTCAAGTACTACCGAGTCTTCAAGTACTCAGGTGGTATCGGG CAGCGTCTCTGCGTCGAGTAGCCCTATTACATCAAGCCCTGTGGCTTCCA GCACTCCAGTGGCAAGTAGCGCGCCCTCGGCTACCAGTTCCGCTGTGGCT TCCAGCTCACCTATTGCCCCAAGCTCCCCGGTTGCCTCTAGCTCTGCTAT TGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTG CTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGC TCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTC CAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTG 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ACTTCCTCAGGATCGGTGATCACATCAGTGACTTCATCCAGCGCCTCTCG TGTGTCAAGCTCCTCTAGCTCGGTTGTAATCACCAATCCATCGGTGCCTT CCGACAGCTCGTCCTCCTCTGGTAGCGAACTGTCGACAACCTCGAGTACC GAGTCTACTAGCTCAGCATCAAGCCAGACCGGAGCGCCAACGACTTCCGT TTCTTTGGGCAGCTCGGAAGCAGCCAGCACCTCAACCTCCGGTGCCGCTG CAAGTGGCTCGGGTGCTCAGGACAGCACAAAACCTACTGATCACGCAAGC ACTCTTTCCCCATCGTACTCGACTCCCCTCGCCAGCGCCTCAGGACAAAC AGGTAGCCCAACTACCGTTCCAGCTGGTATACCAACCGGCAATGGAAGTG GACTCGCTCCGATCACTTCCAGCATCACATCTGCCCAGGCGGTACCTTCC GTCACATCCAGCGGCTTGGAGTCGGAGCCGGAGCCTACCATCACTACCAC GGTCATTGTGACTTCTTACATTGACATCTGCCCAGAAGGTTTCACTACGA TCACCACGACTTACACCACTACCTACTGTCCTGCAACGGTGTCTGCCACA GCCACAGCCACAGCCGCCGTCACCAACCCTCCCGGCGCTCCAGCGCAGAC CACGAGTCCCAGCGTCCCTGAGGGCTGGACGACGACTGTGACCGTATGCA CTCACTGCGCTCCCACACCGACTACTGTGACCCTTACTTTGCCGGCCACC AATCGGCCGTCTGCGCTGGCGTCCTCGACCAGCGCACCGAACTCTCCTGA AGACTGGACCACTACGGTCAGTGTCTGCACTGACTGTGGTCCTACGCCTA CCACGGTAACGGTCACGATCCCCGTCGGCGCTGCCACGGGTGTTGATGCC CTCACTGCCAGTCCGTCCGGCAGTCAGCCTGCCGGGGAGAGTTCGCCCGG 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ATGCAATCGCCCAATCCCCTTTTGACTTCGTTTGGGTGCAATTCTATAAC ACTGCTGGCTGTGCCGCTAGCGACTCCATCAATGGTGTCAGCACCGGCTT CAACTTTGATGACTGGGTGGATGTCATCAAGCGTGGAGCCAACCCGGACG CAAAGCTCTATGTGGGATTGCCTGCCGGCCCCGGTGCAGCAGGAGCGGGA TACTACCTGACACCGGAGGAAGTCTACCCTCTAGTGGATGTGTATATGAA CCTCTACCCGGAGACGTTTGGAGGAATCATGCTTTGGGAAGCAACGGCTT CGGATGAGAACACGTTCAGTGGACTCACATTTGCCGACGTGATCAAAGAC ATTCTGGTTGCAGTTGACCCTTCACCACCGGTTCCCAGCCCTTCGTCTAG CAGCGTTATCGCCTCAAGCACACCTGTGGCCTCGAGTACCCCTGTTGCAT CAAGCGCTCCCGCTTCATCCACCCCGATTTCCTCAGGCAGCCCAGTTCCG TCAAGCTCTGCTGTTTCCAGCTCCCCCGCGGTTTCAAGTACTACCGAGTC TTCAAGTACTCAGGTGGTATCGGGCAGCGTCTCTGCGTCGAGTAGCCCTA TTACATCAAGCCCTGTGGCTTCCAGCACTCCAGTGGCAAGTAGCGCGCCC TCGGCTACCAGTTCCGCTGTGGCTTCCAGCTCACCTATTGCCCCAAGCTC CCCGGTTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCCTCCA GCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCTATTGCC TCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCTAGCTCTGCTAT TGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTG CTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGCTCTGCTATTGCCTCCAGC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004553 | hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0005975 | carbohydrate metabolic process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | SECRETED:SignalP(1-21) |
Note | CAZy:GH18 |
DBxref | InterPro:IPR017853 |
DBxref | InterPro:IPR001579 |
DBxref | InterPro:IPR001223 |
DBxref | PFAM:PF00704 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
An09 | supercontig | An09:1456202..1460096 + |
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