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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An16:69234..71027- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_009814-T1 ID=CBS51388_009814-T1|Name=CBS51388_009814-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1794bp|location=Sequence derived from alignment at An16:69234..71027- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGTCGACCTTGGACGTGAAGGATATTGAGAATGGACCGGCTCGCCGGGT
CGAGGAAGAGGGGGGCATGTGGGAGAATGATATGGAGAAGACGCCATCCG
TGGAGAGGGATCCTTTTGGAAATGAAGCTGTGGGAGAGGTTCACTATAAG
ACTCTCGACTGGTGGTATGTTTGAGCCCCGTGAACTATACCCGACCGTTG
ATACTAGGCGGCATATACTTGATGGCAGAGACTAACCAACTATTCTTTCT
CTTTATAGGCAATCTGGCATGCGTATGCTCTCCCCCACTTTGATATCAAT
ATTGTCTCTTTGTGCATGTAACCTAACATCCTTTCTCTCCAGTGATGATC
GCCGAGACTGTATCCCTGGGTGTTCTGTCTCTGCCCGCCACCGTGGCTGA
GGTTGGCCTGATTCCGTAAGTAGCATACGATCGCGTGCCTTCAACGTCGC
CCGCCCAGTCTGTCGCTAACCAGTAATGCAATCAGTGCCATCATCCTTAT
CGTGGGCATGGGCATCATTGCCACCTACTCCGGCTACGTCATTGGACAGT
TCCGGGCCAGATACCCCTTCATCCACAGCATGGCGGATGCCGGCGAGGTC
TTGTGCGGCCGCTACGGTCGCATGTTCACGGAATTTGCTCAGCTGGTGTT
CTTCATGTTTGCATCTGGCAGNCACTTGGTGACCTTCACCGTTATGATGA
ACACCCTTACCAACCACGGAACCTGCTCTGTCGTGTTTGGCGTCGTCGGC
TTGGTGCTTTCCTTCGCCTGCTCTCTTCCTCGTACCATGAAGAACGTCTC
ATGGCTGGCTGTCACTTGTCAGTATCTCATTGGGTTCATCCCCAGTCTCC
TTATATTGTGCTAACACTTTCACACAGCCTTCCTCAGTATTTTCACGGCC
GTCTTGATCACCATGATTGGTGTCGCCGTTGAACATCCGAACCCTCCGCC
CATGCAGCTTACCCGCTCAACTTCTTTCGTCAAGGGTTTCTCGGCTGTCA
CTAACATCGCTTTCGCCTACTGTTCGTCTCCCTTTCCTATGTCCACTGTC
ATCCGGTCGCATCTGAGTAACTAACCCCTTCTCCAGGTGGTCACCCGGCT
TTCTTTGGTTTCATCGCCGAAATGAAGGAGCCCAAGGACTTCCCCAAGTC
CCTCTGTATGTTGCAGGGTTTCGAGATCGTCTTCTATACGGTCGCCTCCG
CCGTCATCTACCGCTACGCCGGTCAGAACGTCACCTCCCCCGCCCTGGGC
TCTGCCGGTATCGTCGTTCGCAAGGTCGCCTACGGCATTGCCATCCCCAC
CATCGTCATCGCGGGTGTCGTCCTGGGACACGTGGCCATCAAGAACGTCT
ATGTCCGTCTCTTCCGCGGCACGGATGTCATGCACAAGCGCAGTGCCCTG
GGTATCGGTGCCTGGATTGGGCTCGCTGCGGGCTACTGGATTATTGCCTG
GGTGATTGCCGAGGCCATTCCTGTCTTTAGCGATCTCGTCAGCTTGGTCA
GCGCATTGTTTGCCAGTTGGTTTTCATGTGAGTCTCCCATACAGTTTGAA
TCCTCCTACTTCATCATTGAACTCGGTCACTAATAATTTTTCAGTCGGTC
TGCCCGGTGTCTTCTGGCTGTACATGTACTGGGGCAACTACTTCACCTCG
GTTCGCAAAACGCTCCTTACTCTTGCCAACCTGGCGTTGTTCGGCATTGG
CGCTACCATCTGTGTCTGTGGTCTGTGGGTCTCTGGCCTCTCGATCTCTA
GTGACAGCTCTGGCAGCAGCTTTTCGTGCGCCAATAATGCCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An16:69234..71027- >CBS51388_009814-T1 ID=CBS51388_009814-T1|Name=CBS51388_009814-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=9576bp|location=Sequence derived from alignment at An16:69234..71027- (Aspergillus niger CBS 513.88) TCGGTCTGCCCGGTGTCTTCTGGCTGTACATGTACTGGGGCAACTACTTC ACCTCGGTTCGCAAAACGCTCCTTACTCTTGCCAACCTGGCGTTGTTCGG CATTGGCGCTACCATCTGTGTCTGTGGTCTGTGGGTCTCTGGCCTCTCGA TCTCTAGTGACAGCTCTGGCAGCAGCTTTTCGTGCGCCAATAATGCCTAA GTGGTCACCCGGCTTTCTTTGGTTTCATCGCCGAAATGAAGGAGCCCAAG GACTTCCCCAAGTCCCTCTGTATGTTGCAGGGTTTCGAGATCGTCTTCTA TACGGTCGCCTCCGCCGTCATCTACCGCTACGCCGGTCAGAACGTCACCT CCCCCGCCCTGGGCTCTGCCGGTATCGTCGTTCGCAAGGTCGCCTACGGC ATTGCCATCCCCACCATCGTCATCGCGGGTGTCGTCCTGGGACACGTGGC CATCAAGAACGTCTATGTCCGTCTCTTCCGCGGCACGGATGTCATGCACA AGCGCAGTGCCCTGGGTATCGGTGCCTGGATTGGGCTCGCTGCGGGCTAC TGGATTATTGCCTGGGTGATTGCCGAGGCCATTCCTGTCTTTAGCGATCT CGTCAGCTTGGTCAGCGCATTGTTTGCCAGTTGGTTTTCATCCTTCCTCA GTATTTTCACGGCCGTCTTGATCACCATGATTGGTGTCGCCGTTGAACAT CCGAACCCTCCGCCCATGCAGCTTACCCGCTCAACTTCTTTCGTCAAGGG TTTCTCGGCTGTCACTAACATCGCTTTCGCCTACTTGCCATCATCCTTAT CGTGGGCATGGGCATCATTGCCACCTACTCCGGCTACGTCATTGGACAGT TCCGGGCCAGATACCCCTTCATCCACAGCATGGCGGATGCCGGCGAGGTC TTGTGCGGCCGCTACGGTCGCATGTTCACGGAATTTGCTCAGCTGGTGTT CTTCATGTTTGCATCTGGCAGNCACTTGGTGACCTTCACCGTTATGATGA ACACCCTTACCAACCACGGAACCTGCTCTGTCGTGTTTGGCGTCGTCGGC TTGGTGCTTTCCTTCGCCTGCTCTCTTCCTCGTACCATGAAGAACGTCTC ATGGCTGGCTGTCACTTTGATGATCGCCGAGACTGTATCCCTGGGTGTTC TGTCTCTGCCCGCCACCGTGGCTGAGGTTGGCCTGATTCCGCAATCTGGC ATGCATGTCGACCTTGGACGTGAAGGATATTGAGAATGGACCGGCTCGCC GGGTCGAGGAAGAGGGGGGCATGTGGGAGAATGATATGGAGAAGACGCCA TCCGTGGAGAGGGATCCTTTTGGAAATGAAGCTGTGGGAGAGGTTCACTA TAAGACTCTCGACTGGTGTCGGTCTGCCCGGTGTCTTCTGGCTGTACATG TACTGGGGCAACTACTTCACCTCGGTTCGCAAAACGCTCCTTACTCTTGC CAACCTGGCGTTGTTCGGCATTGGCGCTACCATCTGTGTCTGTGGTCTGT GGGTCTCTGGCCTCTCGATCTCTAGTGACAGCTCTGGCAGCAGCTTTTCG TGCGCCAATAATGCCTAAGTGGTCACCCGGCTTTCTTTGGTTTCATCGCC GAAATGAAGGAGCCCAAGGACTTCCCCAAGTCCCTCTGTATGTTGCAGGG TTTCGAGATCGTCTTCTATACGGTCGCCTCCGCCGTCATCTACCGCTACG CCGGTCAGAACGTCACCTCCCCCGCCCTGGGCTCTGCCGGTATCGTCGTT CGCAAGGTCGCCTACGGCATTGCCATCCCCACCATCGTCATCGCGGGTGT CGTCCTGGGACACGTGGCCATCAAGAACGTCTATGTCCGTCTCTTCCGCG GCACGGATGTCATGCACAAGCGCAGTGCCCTGGGTATCGGTGCCTGGATT GGGCTCGCTGCGGGCTACTGGATTATTGCCTGGGTGATTGCCGAGGCCAT TCCTGTCTTTAGCGATCTCGTCAGCTTGGTCAGCGCATTGTTTGCCAGTT GGTTTTCATCCTTCCTCAGTATTTTCACGGCCGTCTTGATCACCATGATT GGTGTCGCCGTTGAACATCCGAACCCTCCGCCCATGCAGCTTACCCGCTC AACTTCTTTCGTCAAGGGTTTCTCGGCTGTCACTAACATCGCTTTCGCCT ACTTGCCATCATCCTTATCGTGGGCATGGGCATCATTGCCACCTACTCCG GCTACGTCATTGGACAGTTCCGGGCCAGATACCCCTTCATCCACAGCATG GCGGATGCCGGCGAGGTCTTGTGCGGCCGCTACGGTCGCATGTTCACGGA ATTTGCTCAGCTGGTGTTCTTCATGTTTGCATCTGGCAGNCACTTGGTGA CCTTCACCGTTATGATGAACACCCTTACCAACCACGGAACCTGCTCTGTC GTGTTTGGCGTCGTCGGCTTGGTGCTTTCCTTCGCCTGCTCTCTTCCTCG TACCATGAAGAACGTCTCATGGCTGGCTGTCACTTTGATGATCGCCGAGA CTGTATCCCTGGGTGTTCTGTCTCTGCCCGCCACCGTGGCTGAGGTTGGC CTGATTCCGCAATCTGGCATGCATGTCGACCTTGGACGTGAAGGATATTG AGAATGGACCGGCTCGCCGGGTCGAGGAAGAGGGGGGCATGTGGGAGAAT GATATGGAGAAGACGCCATCCGTGGAGAGGGATCCTTTTGGAAATGAAGC TGTGGGAGAGGTTCACTATAAGACTCTCGACTGGTGTCGGTCTGCCCGGT GTCTTCTGGCTGTACATGTACTGGGGCAACTACTTCACCTCGGTTCGCAA AACGCTCCTTACTCTTGCCAACCTGGCGTTGTTCGGCATTGGCGCTACCA TCTGTGTCTGTGGTCTGTGGGTCTCTGGCCTCTCGATCTCTAGTGACAGC TCTGGCAGCAGCTTTTCGTGCGCCAATAATGCCTAAGTGGTCACCCGGCT TTCTTTGGTTTCATCGCCGAAATGAAGGAGCCCAAGGACTTCCCCAAGTC CCTCTGTATGTTGCAGGGTTTCGAGATCGTCTTCTATACGGTCGCCTCCG CCGTCATCTACCGCTACGCCGGTCAGAACGTCACCTCCCCCGCCCTGGGC TCTGCCGGTATCGTCGTTCGCAAGGTCGCCTACGGCATTGCCATCCCCAC CATCGTCATCGCGGGTGTCGTCCTGGGACACGTGGCCATCAAGAACGTCT ATGTCCGTCTCTTCCGCGGCACGGATGTCATGCACAAGCGCAGTGCCCTG GGTATCGGTGCCTGGATTGGGCTCGCTGCGGGCTACTGGATTATTGCCTG GGTGATTGCCGAGGCCATTCCTGTCTTTAGCGATCTCGTCAGCTTGGTCA GCGCATTGTTTGCCAGTTGGTTTTCATCCTTCCTCAGTATTTTCACGGCC GTCTTGATCACCATGATTGGTGTCGCCGTTGAACATCCGAACCCTCCGCC CATGCAGCTTACCCGCTCAACTTCTTTCGTCAAGGGTTTCTCGGCTGTCA CTAACATCGCTTTCGCCTACTTGCCATCATCCTTATCGTGGGCATGGGCA TCATTGCCACCTACTCCGGCTACGTCATTGGACAGTTCCGGGCCAGATAC CCCTTCATCCACAGCATGGCGGATGCCGGCGAGGTCTTGTGCGGCCGCTA CGGTCGCATGTTCACGGAATTTGCTCAGCTGGTGTTCTTCATGTTTGCAT CTGGCAGNCACTTGGTGACCTTCACCGTTATGATGAACACCCTTACCAAC CACGGAACCTGCTCTGTCGTGTTTGGCGTCGTCGGCTTGGTGCTTTCCTT CGCCTGCTCTCTTCCTCGTACCATGAAGAACGTCTCATGGCTGGCTGTCA CTTTGATGATCGCCGAGACTGTATCCCTGGGTGTTCTGTCTCTGCCCGCC ACCGTGGCTGAGGTTGGCCTGATTCCGCAATCTGGCATGCATGTCGACCT TGGACGTGAAGGATATTGAGAATGGACCGGCTCGCCGGGTCGAGGAAGAG GGGGGCATGTGGGAGAATGATATGGAGAAGACGCCATCCGTGGAGAGGGA TCCTTTTGGAAATGAAGCTGTGGGAGAGGTTCACTATAAGACTCTCGACT GGTGTCGGTCTGCCCGGTGTCTTCTGGCTGTACATGTACTGGGGCAACTA CTTCACCTCGGTTCGCAAAACGCTCCTTACTCTTGCCAACCTGGCGTTGT TCGGCATTGGCGCTACCATCTGTGTCTGTGGTCTGTGGGTCTCTGGCCTC TCGATCTCTAGTGACAGCTCTGGCAGCAGCTTTTCGTGCGCCAATAATGC CTAAGTGGTCACCCGGCTTTCTTTGGTTTCATCGCCGAAATGAAGGAGCC CAAGGACTTCCCCAAGTCCCTCTGTATGTTGCAGGGTTTCGAGATCGTCT TCTATACGGTCGCCTCCGCCGTCATCTACCGCTACGCCGGTCAGAACGTC ACCTCCCCCGCCCTGGGCTCTGCCGGTATCGTCGTTCGCAAGGTCGCCTA CGGCATTGCCATCCCCACCATCGTCATCGCGGGTGTCGTCCTGGGACACG TGGCCATCAAGAACGTCTATGTCCGTCTCTTCCGCGGCACGGATGTCATG CACAAGCGCAGTGCCCTGGGTATCGGTGCCTGGATTGGGCTCGCTGCGGG CTACTGGATTATTGCCTGGGTGATTGCCGAGGCCATTCCTGTCTTTAGCG ATCTCGTCAGCTTGGTCAGCGCATTGTTTGCCAGTTGGTTTTCATCCTTC CTCAGTATTTTCACGGCCGTCTTGATCACCATGATTGGTGTCGCCGTTGA ACATCCGAACCCTCCGCCCATGCAGCTTACCCGCTCAACTTCTTTCGTCA AGGGTTTCTCGGCTGTCACTAACATCGCTTTCGCCTACTTGCCATCATCC TTATCGTGGGCATGGGCATCATTGCCACCTACTCCGGCTACGTCATTGGA CAGTTCCGGGCCAGATACCCCTTCATCCACAGCATGGCGGATGCCGGCGA GGTCTTGTGCGGCCGCTACGGTCGCATGTTCACGGAATTTGCTCAGCTGG TGTTCTTCATGTTTGCATCTGGCAGNCACTTGGTGACCTTCACCGTTATG ATGAACACCCTTACCAACCACGGAACCTGCTCTGTCGTGTTTGGCGTCGT CGGCTTGGTGCTTTCCTTCGCCTGCTCTCTTCCTCGTACCATGAAGAACG TCTCATGGCTGGCTGTCACTTTGATGATCGCCGAGACTGTATCCCTGGGT GTTCTGTCTCTGCCCGCCACCGTGGCTGAGGTTGGCCTGATTCCGCAATC TGGCATGCATGTCGACCTTGGACGTGAAGGATATTGAGAATGGACCGGCT CGCCGGGTCGAGGAAGAGGGGGGCATGTGGGAGAATGATATGGAGAAGAC GCCATCCGTGGAGAGGGATCCTTTTGGAAATGAAGCTGTGGGAGAGGTTC ACTATAAGACTCTCGACTGGTGTCGGTCTGCCCGGTGTCTTCTGGCTGTA CATGTACTGGGGCAACTACTTCACCTCGGTTCGCAAAACGCTCCTTACTC TTGCCAACCTGGCGTTGTTCGGCATTGGCGCTACCATCTGTGTCTGTGGT CTGTGGGTCTCTGGCCTCTCGATCTCTAGTGACAGCTCTGGCAGCAGCTT TTCGTGCGCCAATAATGCCTAAGTGGTCACCCGGCTTTCTTTGGTTTCAT CGCCGAAATGAAGGAGCCCAAGGACTTCCCCAAGTCCCTCTGTATGTTGC AGGGTTTCGAGATCGTCTTCTATACGGTCGCCTCCGCCGTCATCTACCGC TACGCCGGTCAGAACGTCACCTCCCCCGCCCTGGGCTCTGCCGGTATCGT CGTTCGCAAGGTCGCCTACGGCATTGCCATCCCCACCATCGTCATCGCGG GTGTCGTCCTGGGACACGTGGCCATCAAGAACGTCTATGTCCGTCTCTTC CGCGGCACGGATGTCATGCACAAGCGCAGTGCCCTGGGTATCGGTGCCTG GATTGGGCTCGCTGCGGGCTACTGGATTATTGCCTGGGTGATTGCCGAGG CCATTCCTGTCTTTAGCGATCTCGTCAGCTTGGTCAGCGCATTGTTTGCC AGTTGGTTTTCATCCTTCCTCAGTATTTTCACGGCCGTCTTGATCACCAT GATTGGTGTCGCCGTTGAACATCCGAACCCTCCGCCCATGCAGCTTACCC GCTCAACTTCTTTCGTCAAGGGTTTCTCGGCTGTCACTAACATCGCTTTC GCCTACTTGCCATCATCCTTATCGTGGGCATGGGCATCATTGCCACCTAC TCCGGCTACGTCATTGGACAGTTCCGGGCCAGATACCCCTTCATCCACAG CATGGCGGATGCCGGCGAGGTCTTGTGCGGCCGCTACGGTCGCATGTTCA CGGAATTTGCTCAGCTGGTGTTCTTCATGTTTGCATCTGGCAGNCACTTG GTGACCTTCACCGTTATGATGAACACCCTTACCAACCACGGAACCTGCTC TGTCGTGTTTGGCGTCGTCGGCTTGGTGCTTTCCTTCGCCTGCTCTCTTC CTCGTACCATGAAGAACGTCTCATGGCTGGCTGTCACTTTGATGATCGCC GAGACTGTATCCCTGGGTGTTCTGTCTCTGCCCGCCACCGTGGCTGAGGT TGGCCTGATTCCGCAATCTGGCATGCATGTCGACCTTGGACGTGAAGGAT ATTGAGAATGGACCGGCTCGCCGGGTCGAGGAAGAGGGGGGCATGTGGGA GAATGATATGGAGAAGACGCCATCCGTGGAGAGGGATCCTTTTGGAAATG AAGCTGTGGGAGAGGTTCACTATAAGACTCTCGACTGGTGTCGGTCTGCC CGGTGTCTTCTGGCTGTACATGTACTGGGGCAACTACTTCACCTCGGTTC GCAAAACGCTCCTTACTCTTGCCAACCTGGCGTTGTTCGGCATTGGCGCT ACCATCTGTGTCTGTGGTCTGTGGGTCTCTGGCCTCTCGATCTCTAGTGA CAGCTCTGGCAGCAGCTTTTCGTGCGCCAATAATGCCTAAGTGGTCACCC GGCTTTCTTTGGTTTCATCGCCGAAATGAAGGAGCCCAAGGACTTCCCCA AGTCCCTCTGTATGTTGCAGGGTTTCGAGATCGTCTTCTATACGGTCGCC TCCGCCGTCATCTACCGCTACGCCGGTCAGAACGTCACCTCCCCCGCCCT GGGCTCTGCCGGTATCGTCGTTCGCAAGGTCGCCTACGGCATTGCCATCC CCACCATCGTCATCGCGGGTGTCGTCCTGGGACACGTGGCCATCAAGAAC GTCTATGTCCGTCTCTTCCGCGGCACGGATGTCATGCACAAGCGCAGTGC CCTGGGTATCGGTGCCTGGATTGGGCTCGCTGCGGGCTACTGGATTATTG CCTGGGTGATTGCCGAGGCCATTCCTGTCTTTAGCGATCTCGTCAGCTTG GTCAGCGCATTGTTTGCCAGTTGGTTTTCATCCTTCCTCAGTATTTTCAC GGCCGTCTTGATCACCATGATTGGTGTCGCCGTTGAACATCCGAACCCTC CGCCCATGCAGCTTACCCGCTCAACTTCTTTCGTCAAGGGTTTCTCGGCT GTCACTAACATCGCTTTCGCCTACTTGCCATCATCCTTATCGTGGGCATG GGCATCATTGCCACCTACTCCGGCTACGTCATTGGACAGTTCCGGGCCAG ATACCCCTTCATCCACAGCATGGCGGATGCCGGCGAGGTCTTGTGCGGCC GCTACGGTCGCATGTTCACGGAATTTGCTCAGCTGGTGTTCTTCATGTTT GCATCTGGCAGNCACTTGGTGACCTTCACCGTTATGATGAACACCCTTAC CAACCACGGAACCTGCTCTGTCGTGTTTGGCGTCGTCGGCTTGGTGCTTT CCTTCGCCTGCTCTCTTCCTCGTACCATGAAGAACGTCTCATGGCTGGCT GTCACTTTGATGATCGCCGAGACTGTATCCCTGGGTGTTCTGTCTCTGCC CGCCACCGTGGCTGAGGTTGGCCTGATTCCGCAATCTGGCATGCATGTCG ACCTTGGACGTGAAGGATATTGAGAATGGACCGGCTCGCCGGGTCGAGGA AGAGGGGGGCATGTGGGAGAATGATATGGAGAAGACGCCATCCGTGGAGA GGGATCCTTTTGGAAATGAAGCTGTGGGAGAGGTTCACTATAAGACTCTC GACTGGTGTCGGTCTGCCCGGTGTCTTCTGGCTGTACATGTACTGGGGCA 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TATGATGAACACCCTTACCAACCACGGAACCTGCTCTGTCGTGTTTGGCG TCGTCGGCTTGGTGCTTTCCTTCGCCTGCTCTCTTCCTCGTACCATGAAG AACGTCTCATGGCTGGCTGTCACTTTGATGATCGCCGAGACTGTATCCCT GGGTGTTCTGTCTCTGCCCGCCACCGTGGCTGAGGTTGGCCTGATTCCGC AATCTGGCATGCATGTCGACCTTGGACGTGAAGGATATTGAGAATGGACC GGCTCGCCGGGTCGAGGAAGAGGGGGGCATGTGGGAGAATGATATGGAGA AGACGCCATCCGTGGAGAGGGATCCTTTTGGAAATGAAGCTGTGGGAGAG GTTCACTATAAGACTCTCGACTGGTG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | antiSMASH:Cluster_16.1 |
| DBxref | InterPro:IPR013057 |
| DBxref | PFAM:PF01490 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An16 | supercontig | An16:69234..71027 - |
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