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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000003.1:1145334..1147234+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_31545-T1 ID=CAN33_31545-T1|Name=CAN33_31545-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1901bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000003.1:1145334..1147234+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGGTGCAGACCGTATTGCAGTGGCCAATGATGGCATGACTCGTGAGAG
AAACATCGAGGCTCAGAGTGCCTTCGCTTCTACTTTGGTGGTGGATGTCG
AGAAGGCGCCTCATTCTAAGGAAGTGCCCACTGACAGACCGCATACCAAT
GTCTATGGCTCCACTATTGACACTCCCACTTCTGTGGCTGGAACCGATGC
CGTCTATGCGGCTAAGGCGGCGCTTCTGAACCAGGCGCTGATGGATATGG
GTATGGGGTTGTATCAGTGGTTGCTCTTTATTATCACCAGTGTGGGATGG
TTTCTCGATAGTGTATGCCTCCATATGAACAGTGGAAAAGTGAAGAAACA
TTTACTGATCAGTACAGTTCTGGTTGATGTCCTTCACGGTCATCGCCCCT
CCAGCGCCAATGAAGCCCAGTTCTTCTTCACCGACAACAAAGAGGCCTAC
CTCTTCATCAGTATGTACGTCGGTCTGACCACGGGCTCCACCGCCTGGCC
CTGGATGTCCGACATGCTGGGCCGGAAGTGGATCTTCACGAGCACCCTGG
TCCTTATGGGCATGGGTGGCCTCGTCGGTGCTGGAATGCCGTCTTTCACC
GGCCTTTGTGTCGTTGGCTTCGTTGTCGGCTTTGCAGTGGCTGGCAACCA
GGTCGTGGATGCGATGATTCTGCTCGAATCTGTTCCCGCATCTCACCAGT
TCCTTGTCTCCATGCAGGGTGCCATGTGGGGACTGGGTCAGCTGGTAGCA
GCAGCTGTCGGATGGTAAGTCTACCTACTGTCAGACACCATACCACGCAA
TCTAACAACCACAGGGCATTTATCGCTGAATACACTTGCGGCACCGGTCC
CGACGAGATCAGCACCGGCACAGCCCTCTCCCACCAGTCCCGCGCCGACC
ACTCCAGCAGCAGCAGCAGCTCCCAATGCCATTACGTCTCCAACAAGGGC
TGGCGCTACGTCTGGTGGACCTTCGGCTGTATGACACTCTTTCTGTACTT
GTGCCGGTTTGCCTTCCCGCTGCGCGAAACCCCCAAGTATCTGCTCTCCA
AGCGCCGCGACGCCGAAGCCACCCAGCTCGTCAAGGACATCGCCGCCTAC
AGCAACCGTAAGACCTGGCTGGAGGAGTCCTCCTTTGCGCGCATTGACTC
GACCGTTGATGCCAGCGCCCCCGAGTCCCGTCGCCAGTCGCGCACCAAGT
CCCTCCTGTCCTCTGCCGGAGCCATCGGCCTCCCCGTTCTCTGTCTCCTC
TGGGCCGTCGCCGGGTTGACTTTCACCCTGCACAAAACCTACATCAGCAA
GTACCTCGCCACTAAGGGTGTCGAGGCGGTATCAGCTACCTCCGTGACTA
CTGGATACCTCTACAGCCGGTACCTGTACGTTGCGCTGTGCGCTATCCCC
GGCCCGATCGTGGTGGGTCTTCTCATTGAGGCGAAGGGACTGGGTCGCAA
GCGCACGGGATCTATTGTCGCTGTGCTGACCGGTTTGTTCATGTTTCTCG
CGACGGTGTCGCGGTCGAGGAATGCGCTGCTCGCGTTCGAATGTATCCTG
TCGTTCTTGCAGACGGCGACGATGGCGGTGCTAGTTACGTACTCCGTCGA
GGTGTTTGCGGCACCGTTCCGGGGTTTCGGGCTGGGAGTCGTCGGATTCT
GCTGGGGATTGTTTGGGTTGATTGCTAGTATTATTACGACGTTCGAGAGC
ACTGTTGCCGATGGTGCGGCGGTGTGGTTCTGTGGTGCTATTTGGGTGAT
CATGGGTGGTGCTTGGATGGTTGTGCCGGAGACGAAGGGTCGGGCTGCTG
CTTAGATGGGTGTGATGTGAGGGAATGATGTGATGCGATCTGATGTTGAA
TGAGTGATGATTCACGTGTGTTGATGTCATGGCAAAATTAATTGCAAGTA
A back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000003.1:1145334..1147234+ >CAN33_31545-T1 ID=CAN33_31545-T1|Name=CAN33_31545-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=6432bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000003.1:1145334..1147234+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGGTGCAGACCGTATTGCAGTGGCCAATGATGGCATGACTCGTGAGAG AAACATCGAGGCTCAGAGTGCCTTCGCTTCTACTTTGGTGGTGGATGTCG AGAAGGCGCCTCATTCTAAGGAAGTGCCCACTGACAGACCGCATACCAAT GTCTATGGCTCCACTATTGACACTCCCACTTCTGTGGCTGGAACCGATGC CGTCTATGCGGCTAAGGCGGCGCTTCTGAACCAGGCGCTGATGGATATGG TTCTGGTTGATGTCCTTCACGGTCATCGCCCCTCCAGCGCCAATGAAGCC CAGTTCTTCTTCACCGACAACAAAGAGGCCTACCTCTTCATCAGTATGTA CGTCGGTCTGACCACGGGCTCCACCGCCTGGCCCTGGATGTCCGACATGC TGGGCCGGAAGTGGATCTTCACGAGCACCCTGGTCCTTATGGGCATGGGT GGCCTCGTCGGTGCTGGAATGCCGTCTTTCACCGGCCTTTGTGTCGTTGG CTTCGTTGTCGGCTTTGCAGTGGCTGGCAACCAGGTCGTGGATGCGATGA TTCTGCTCGAATCTGTTCCCGCATCTCACCAGTTCCTTGTCTCCATGCAG GGTGCCATGTGGGGACTGGGTCAGCTGGTAGCAGCAGCTGTCGGATGGGC ATTTATCGCTGAATACACTTGCGGCACCGGTCCCGACGAGATCAGCACCG GCACAGCCCTCTCCCACCAGTCCCGCGCCGACCACTCCAGCAGCAGCAGC AGCTCCCAATGCCATTACGTCTCCAACAAGGGCTGGCGCTACGTCTGGTG GACCTTCGGCTGTATGACACTCTTTCTGTACTTGTGCCGGTTTGCCTTCC CGCTGCGCGAAACCCCCAAGTATCTGCTCTCCAAGCGCCGCGACGCCGAA GCCACCCAGCTCGTCAAGGACATCGCCGCCTACAGCAACCGTAAGACCTG GCTGGAGGAGTCCTCCTTTGCGCGCATTGACTCGACCGTTGATGCCAGCG CCCCCGAGTCCCGTCGCCAGTCGCGCACCAAGTCCCTCCTGTCCTCTGCC GGAGCCATCGGCCTCCCCGTTCTCTGTCTCCTCTGGGCCGTCGCCGGGTT GACTTTCACCCTGCACAAAACCTACATCAGCAAGTACCTCGCCACTAAGG GTGTCGAGGCGGTATCAGCTACCTCCGTGACTACTGGATACCTCTACAGC CGGTACCTGTACGTTGCGCTGTGCGCTATCCCCGGCCCGATCGTGGTGGG TCTTCTCATTGAGGCGAAGGGACTGGGTCGCAAGCGCACGGGATCTATTG TCGCTGTGCTGACCGGTTTGTTCATGTTTCTCGCGACGGTGTCGCGGTCG AGGAATGCGCTGCTCGCGTTCGAATGTATCCTGTCGTTCTTGCAGACGGC GACGATGGCGGTGCTAGTTACGTACTCCGTCGAGGTGTTTGCGGCACCGT TCCGGGGTTTCGGGCTGGGAGTCGTCGGATTCTGCTGGGGATTGTTTGGG TTGATTGCTAGTATTATTACGACGTTCGAGAGCACTGTTGCCGATGGTGC GGCGGTGTGGTTCTGTGGTGCTATTTGGGTGATCATGGGTGGTGCTTGGA TGGTTTAAATGGGTGCAGACCGTATTGCAGTGGCCAATGATGGCATGACT CGTGAGAGAAACATCGAGGCTCAGAGTGCCTTCGCTTCTACTTTGGTGGT GGATGTCGAGAAGGCGCCTCATTCTAAGGAAGTGCCCACTGACAGACCGC ATACCAATGTCTATGGCTCCACTATTGACACTCCCACTTCTGTGGCTGGA ACCGATGCCGTCTATGCGGCTAAGGCGGCGCTTCTGAACCAGGCGCTGAT GGATATGGTTCTGGTTGATGTCCTTCACGGTCATCGCCCCTCCAGCGCCA ATGAAGCCCAGTTCTTCTTCACCGACAACAAAGAGGCCTACCTCTTCATC AGTATGTACGTCGGTCTGACCACGGGCTCCACCGCCTGGCCCTGGATGTC CGACATGCTGGGCCGGAAGTGGATCTTCACGAGCACCCTGGTCCTTATGG GCATGGGTGGCCTCGTCGGTGCTGGAATGCCGTCTTTCACCGGCCTTTGT GTCGTTGGCTTCGTTGTCGGCTTTGCAGTGGCTGGCAACCAGGTCGTGGA TGCGATGATTCTGCTCGAATCTGTTCCCGCATCTCACCAGTTCCTTGTCT CCATGCAGGGTGCCATGTGGGGACTGGGTCAGCTGGTAGCAGCAGCTGTC GGATGGGCATTTATCGCTGAATACACTTGCGGCACCGGTCCCGACGAGAT CAGCACCGGCACAGCCCTCTCCCACCAGTCCCGCGCCGACCACTCCAGCA GCAGCAGCAGCTCCCAATGCCATTACGTCTCCAACAAGGGCTGGCGCTAC GTCTGGTGGACCTTCGGCTGTATGACACTCTTTCTGTACTTGTGCCGGTT TGCCTTCCCGCTGCGCGAAACCCCCAAGTATCTGCTCTCCAAGCGCCGCG ACGCCGAAGCCACCCAGCTCGTCAAGGACATCGCCGCCTACAGCAACCGT AAGACCTGGCTGGAGGAGTCCTCCTTTGCGCGCATTGACTCGACCGTTGA TGCCAGCGCCCCCGAGTCCCGTCGCCAGTCGCGCACCAAGTCCCTCCTGT CCTCTGCCGGAGCCATCGGCCTCCCCGTTCTCTGTCTCCTCTGGGCCGTC GCCGGGTTGACTTTCACCCTGCACAAAACCTACATCAGCAAGTACCTCGC CACTAAGGGTGTCGAGGCGGTATCAGCTACCTCCGTGACTACTGGATACC TCTACAGCCGGTACCTGTACGTTGCGCTGTGCGCTATCCCCGGCCCGATC GTGGTGGGTCTTCTCATTGAGGCGAAGGGACTGGGTCGCAAGCGCACGGG ATCTATTGTCGCTGTGCTGACCGGTTTGTTCATGTTTCTCGCGACGGTGT CGCGGTCGAGGAATGCGCTGCTCGCGTTCGAATGTATCCTGTCGTTCTTG CAGACGGCGACGATGGCGGTGCTAGTTACGTACTCCGTCGAGGTGTTTGC GGCACCGTTCCGGGGTTTCGGGCTGGGAGTCGTCGGATTCTGCTGGGGAT TGTTTGGGTTGATTGCTAGTATTATTACGACGTTCGAGAGCACTGTTGCC GATGGTGCGGCGGTGTGGTTCTGTGGTGCTATTTGGGTGATCATGGGTGG TGCTTGGATGGTTTAAATGGGTGCAGACCGTATTGCAGTGGCCAATGATG GCATGACTCGTGAGAGAAACATCGAGGCTCAGAGTGCCTTCGCTTCTACT TTGGTGGTGGATGTCGAGAAGGCGCCTCATTCTAAGGAAGTGCCCACTGA CAGACCGCATACCAATGTCTATGGCTCCACTATTGACACTCCCACTTCTG TGGCTGGAACCGATGCCGTCTATGCGGCTAAGGCGGCGCTTCTGAACCAG GCGCTGATGGATATGGTTCTGGTTGATGTCCTTCACGGTCATCGCCCCTC CAGCGCCAATGAAGCCCAGTTCTTCTTCACCGACAACAAAGAGGCCTACC TCTTCATCAGTATGTACGTCGGTCTGACCACGGGCTCCACCGCCTGGCCC TGGATGTCCGACATGCTGGGCCGGAAGTGGATCTTCACGAGCACCCTGGT CCTTATGGGCATGGGTGGCCTCGTCGGTGCTGGAATGCCGTCTTTCACCG GCCTTTGTGTCGTTGGCTTCGTTGTCGGCTTTGCAGTGGCTGGCAACCAG GTCGTGGATGCGATGATTCTGCTCGAATCTGTTCCCGCATCTCACCAGTT CCTTGTCTCCATGCAGGGTGCCATGTGGGGACTGGGTCAGCTGGTAGCAG CAGCTGTCGGATGGGCATTTATCGCTGAATACACTTGCGGCACCGGTCCC GACGAGATCAGCACCGGCACAGCCCTCTCCCACCAGTCCCGCGCCGACCA CTCCAGCAGCAGCAGCAGCTCCCAATGCCATTACGTCTCCAACAAGGGCT GGCGCTACGTCTGGTGGACCTTCGGCTGTATGACACTCTTTCTGTACTTG TGCCGGTTTGCCTTCCCGCTGCGCGAAACCCCCAAGTATCTGCTCTCCAA GCGCCGCGACGCCGAAGCCACCCAGCTCGTCAAGGACATCGCCGCCTACA GCAACCGTAAGACCTGGCTGGAGGAGTCCTCCTTTGCGCGCATTGACTCG ACCGTTGATGCCAGCGCCCCCGAGTCCCGTCGCCAGTCGCGCACCAAGTC CCTCCTGTCCTCTGCCGGAGCCATCGGCCTCCCCGTTCTCTGTCTCCTCT GGGCCGTCGCCGGGTTGACTTTCACCCTGCACAAAACCTACATCAGCAAG TACCTCGCCACTAAGGGTGTCGAGGCGGTATCAGCTACCTCCGTGACTAC TGGATACCTCTACAGCCGGTACCTGTACGTTGCGCTGTGCGCTATCCCCG GCCCGATCGTGGTGGGTCTTCTCATTGAGGCGAAGGGACTGGGTCGCAAG CGCACGGGATCTATTGTCGCTGTGCTGACCGGTTTGTTCATGTTTCTCGC GACGGTGTCGCGGTCGAGGAATGCGCTGCTCGCGTTCGAATGTATCCTGT CGTTCTTGCAGACGGCGACGATGGCGGTGCTAGTTACGTACTCCGTCGAG GTGTTTGCGGCACCGTTCCGGGGTTTCGGGCTGGGAGTCGTCGGATTCTG CTGGGGATTGTTTGGGTTGATTGCTAGTATTATTACGACGTTCGAGAGCA CTGTTGCCGATGGTGCGGCGGTGTGGTTCTGTGGTGCTATTTGGGTGATC ATGGGTGGTGCTTGGATGGTTTAAATGGGTGCAGACCGTATTGCAGTGGC CAATGATGGCATGACTCGTGAGAGAAACATCGAGGCTCAGAGTGCCTTCG CTTCTACTTTGGTGGTGGATGTCGAGAAGGCGCCTCATTCTAAGGAAGTG CCCACTGACAGACCGCATACCAATGTCTATGGCTCCACTATTGACACTCC CACTTCTGTGGCTGGAACCGATGCCGTCTATGCGGCTAAGGCGGCGCTTC TGAACCAGGCGCTGATGGATATGGTTCTGGTTGATGTCCTTCACGGTCAT CGCCCCTCCAGCGCCAATGAAGCCCAGTTCTTCTTCACCGACAACAAAGA GGCCTACCTCTTCATCAGTATGTACGTCGGTCTGACCACGGGCTCCACCG CCTGGCCCTGGATGTCCGACATGCTGGGCCGGAAGTGGATCTTCACGAGC ACCCTGGTCCTTATGGGCATGGGTGGCCTCGTCGGTGCTGGAATGCCGTC TTTCACCGGCCTTTGTGTCGTTGGCTTCGTTGTCGGCTTTGCAGTGGCTG GCAACCAGGTCGTGGATGCGATGATTCTGCTCGAATCTGTTCCCGCATCT CACCAGTTCCTTGTCTCCATGCAGGGTGCCATGTGGGGACTGGGTCAGCT GGTAGCAGCAGCTGTCGGATGGGCATTTATCGCTGAATACACTTGCGGCA CCGGTCCCGACGAGATCAGCACCGGCACAGCCCTCTCCCACCAGTCCCGC GCCGACCACTCCAGCAGCAGCAGCAGCTCCCAATGCCATTACGTCTCCAA CAAGGGCTGGCGCTACGTCTGGTGGACCTTCGGCTGTATGACACTCTTTC TGTACTTGTGCCGGTTTGCCTTCCCGCTGCGCGAAACCCCCAAGTATCTG CTCTCCAAGCGCCGCGACGCCGAAGCCACCCAGCTCGTCAAGGACATCGC CGCCTACAGCAACCGTAAGACCTGGCTGGAGGAGTCCTCCTTTGCGCGCA TTGACTCGACCGTTGATGCCAGCGCCCCCGAGTCCCGTCGCCAGTCGCGC ACCAAGTCCCTCCTGTCCTCTGCCGGAGCCATCGGCCTCCCCGTTCTCTG TCTCCTCTGGGCCGTCGCCGGGTTGACTTTCACCCTGCACAAAACCTACA TCAGCAAGTACCTCGCCACTAAGGGTGTCGAGGCGGTATCAGCTACCTCC GTGACTACTGGATACCTCTACAGCCGGTACCTGTACGTTGCGCTGTGCGC TATCCCCGGCCCGATCGTGGTGGGTCTTCTCATTGAGGCGAAGGGACTGG GTCGCAAGCGCACGGGATCTATTGTCGCTGTGCTGACCGGTTTGTTCATG TTTCTCGCGACGGTGTCGCGGTCGAGGAATGCGCTGCTCGCGTTCGAATG TATCCTGTCGTTCTTGCAGACGGCGACGATGGCGGTGCTAGTTACGTACT CCGTCGAGGTGTTTGCGGCACCGTTCCGGGGTTTCGGGCTGGGAGTCGTC GGATTCTGCTGGGGATTGTTTGGGTTGATTGCTAGTATTATTACGACGTT CGAGAGCACTGTTGCCGATGGTGCGGCGGTGTGGTTCTGTGGTGCTATTT GGGTGATCATGGGTGGTGCTTGGATGGTTTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0016021 | integral component of membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | EggNog:ENOG41 |
| DBxref | InterPro:IPR036259 |
| DBxref | InterPro:IPR020846 |
| DBxref | InterPro:IPR005828 |
| DBxref | PFAM:PF00083 |
| DBxref | PFAM:PF07690 |
| Product | Sugar (and other) transporter family protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000003.1 | supercontig | NKJJ01000003.1:1145334..1147234 + |
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