You are here

Home

CAN33_43880-T1, CAN33_43880-T1 (mRNA) Aspergillus niger FDAARGOS_311

Overview
NameCAN33_43880-T1
Unique NameCAN33_43880-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger FDAARGOS_311
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at NKJJ01000022.1:1013973..1015496-

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>CAN33_43880-T1 ID=CAN33_43880-T1|Name=CAN33_43880-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1524bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000022.1:1013973..1015496- (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCC
CGTAAGTTCCTACTTGTCCCCTACGAGCTGAGAGGCCAGGTTGTCGGATG
TCGCGCTCTCGACGGAATCGGTTCAAATTGGTCTTGAATATTAAAGATCG
AGTACTACGTTCCTTGGAGACTCGACAGTCTGACGATTTGGCCGGGCTCA
ATGGTGTTGTTGCTGGACTAGGTGGCTAATGAAAATTTTTCACAGGGATT
CGTCGTCGACTTCCTGAGTATGTGCATTCCGGCTCGCCCCGAATGATCGA
TCATTGCACTACGATCGATCAATTCCCATCCCAACGAGCAACACGAATTG
TGCGATGTTGATTTGAAATTGATACTAACTACTGGTACAGTGGGTGGTGT
CTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGC
TCCTCATCCAGAACCAGGTTGGTTAAGCCTCAACACCAATGTCTTGCACT
GGCGGAACGAAAATACTTTGCACGATCTGCGGTTGCGTCTTCGAAACGAC
ATTGCTCCGACCGAAGATTGCCAATTCAGCCGGGCGCAAAAATTTTCACT
CCGGACAGTCGGGACGTGAGATCGGCCCAAACAGATGCTAATACGATTGT
CCTTCAGGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACG
GTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCC
CTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGC
TCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGA
AGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGT
GGTGTATGTATCCCTATATCCAGTTTGATACTCGAGCGATCCCGCTAACA
ATCGGTTCAGGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCG
ACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGT
GGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGC
CTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTG
GTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAG
CCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCT
GCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGG
ACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTAC
AAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAA
GTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTG
CTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAG
AAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000022.1:1013973..1015496-

>CAN33_43880-T1 ID=CAN33_43880-T1|Name=CAN33_43880-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=4800bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000022.1:1013973..1015496- (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
GCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCG
TACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTC
AGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGT
ATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGT
CTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTC
TGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGG
ACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCG
TCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCA
TGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTC
AAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCT
GTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGG
GTGGCTCTGGCTAAGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAG
TACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGT
TGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCA
CCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCC
TACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGC
CTCCGGTGGTTGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGC
CCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAGGGATTCGTCGTCG
ACTTCCTGAATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTT
CGGCATGCCCGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCG
ACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGT
GGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGC
CTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTG
GTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAG
CCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCT
GCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGG
ACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTAC
AAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAA
GTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTG
CTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAG
AAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAAGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCT
CGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCT
CCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGT
TACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTC
CATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGG
GTAACCTTGCCTCCGGTGGTTGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGA
CTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAGGGA
TTCGTCGTCGACTTCCTGAATGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACA
AGACCGTCTTCGGCATGCCCGCTGCTGGTGCCACTTCCCTCCTCTTCGTC
TACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACGCCAAGTCCGC
CAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGACGTCTACAAGA
AGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGGTTTCGGTCCC
TCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCGGCATGTACGA
CTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGTAACTTCCTTG
CTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGGTATCGCTTCT
TACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCTCCGGTGAGGC
CGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATCGTCGCCAAGG
AGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACATCCTCCGTGGT
GTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCCAGCTCATCCT
CTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAAGATGAGATGCTTCGCG
CTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTGCTTCCGTCGT
ACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTAACACTGCCAA
CGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCCTTCCGTGACA
CCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGGATACACCAAG
TGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGTGGTTGGGTGGTGTCTCCGCTGCC
GTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGCTCCTCATCCA
GAACCAGGGATTCGTCGTCGACTTCCTGAATGGCCAAGGGTGATGTTAAC
CAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGCTGCTGGTGCCACTTCCCT
CCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTTGCCAACGACG
CCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGGTCTCGTTGAC
GTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTCTCTACCGTGG
TTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGTCTGTACTTCG
GCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCCTCTCGAGGGT
AACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCACTGGTGCTGG
TATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATGATGATGACCT
CCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGCTCGCCAGATC
GTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCGGTGCTAACAT
CCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTACGACCAGGTCC
AGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGGCTAAGATGAG
ATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTATCATGGACTG
CTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCCCTGTGGCGTGGTA
ACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCTTAACTTCGCC
TTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGGAGCGTGATGG
ATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGTGGTTGGGTGGTGT
CTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAGCGTATCAAGC
TCCTCATCCAGAACCAGGGATTCGTCGTCGACTTCCTGAATGGCCAAGGG
TGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCCGCTGCTGGTG
CCACTTCCCTCCTCTTCGTCTACTCCCTCGACTACGCCCGTACCCGTCTT
GCCAACGACGCCAAGTCCGCCAAGGGCGGTGGTGACCGTCAGTTCAACGG
TCTCGTTGACGTCTACAAGAAGACCCTCGCCTCCGACGGTATTGCCGGTC
TCTACCGTGGTTTCGGTCCCTCTGTTGCTGGTATTGTTGTCTACCGTGGT
CTGTACTTCGGCATGTACGACTCCATCAAGCCCGTTGTTCTGGTTGGTCC
TCTCGAGGGTAACTTCCTTGCTTCTTTCCTGCTCGGCTGGACTGTCACCA
CTGGTGCTGGTATCGCTTCTTACCCTCTGGACACCATCCGTCGTCGTATG
ATGATGACCTCCGGTGAGGCCGTCAAGTACAAGTCCTCCATGGATGCTGC
TCGCCAGATCGTCGCCAAGGAGGGTGTCAAGTCTCTCTTCAAGGGTGCCG
GTGCTAACATCCTCCGTGGTGTTGCCGGTGCTGGTGTCCTGTCTATCTAC
GACCAGGTCCAGCTCATCCTCTTCGGCAAGAAGTACAAGGGTGGCTCTGG
CTAAGATGAGATGCTTCGCGCTGGTCGTCTCGACCGCAAGTACAACGGTA
TCATGGACTGCTTCCGTCGTACCGCTGCCTCCGAGGGTGTTGTTTCCCTG
TGGCGTGGTAACACTGCCAACGTTATCCGTTACTTCCCCACCCAGGCTCT
TAACTTCGCCTTCCGTGACACCTACAAGTCCATGTTCTCCTACAAGAAGG
AGCGTGATGGATACACCAAGTGGATGATGGGTAACCTTGCCTCCGGTGGT
TGGGTGGTGTCTCCGCTGCCGTCTCCAAGACTGCTGCCGCCCCCATCGAG
CGTATCAAGCTCCTCATCCAGAACCAGGGATTCGTCGTCGACTTCCTGAA
TGGCCAAGGGTGATGTTAACCAGGCCGACAAGACCGTCTTCGGCATGCCC
back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0005743mitochondrial inner membrane
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0022857transmembrane transporter activity
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0055085transmembrane transport
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_43880CAN33_43880Aspergillus niger FDAARGOS_311gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_43880-T1CAN33_43880-T1-proteinAspergillus niger FDAARGOS_311polypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_43880-T1.cdsCAN33_43880-T1.cdsAspergillus niger FDAARGOS_311CDS


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_43880-T1.exon5CAN33_43880-T1.exon5Aspergillus niger FDAARGOS_311exon
CAN33_43880-T1.exon4CAN33_43880-T1.exon4Aspergillus niger FDAARGOS_311exon
CAN33_43880-T1.exon3CAN33_43880-T1.exon3Aspergillus niger FDAARGOS_311exon
CAN33_43880-T1.exon2CAN33_43880-T1.exon2Aspergillus niger FDAARGOS_311exon
CAN33_43880-T1.exon1CAN33_43880-T1.exon1Aspergillus niger FDAARGOS_311exon


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR023395
DBxrefInterPro:IPR018108
DBxrefInterPro:IPR002067
DBxrefInterPro:IPR002113
DBxrefPFAM:PF00153
ProductMitochondrial carrier protein family protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger FDAARGOS_311 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
NKJJ01000022.1supercontigNKJJ01000022.1:1013973..1015496 -
Powered by Drupal