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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000019.1:588607..591096+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_4690-T1 ID=CAN33_4690-T1|Name=CAN33_4690-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=2490bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000019.1:588607..591096+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGCCGACAGCTTGAAGATGGGAAACCTTTCCCTCAACGAGTCTCAGCA
CGCTCCTGCCCCTGCCCCCTCCACGGGTCGCGCCGCTTACATCCCTCCCC
ATCTTCGCGGACGCCAGATGGGTGGAAACATGGACGGTGCTGCCGCCGCT
GCCCCTCCCCCCGGTCCCGCCGCTGGCCCTGGCAACTCCTGGGGTGGTCC
TAGGTATGTGATATTCAATTACCGCGTGTCCCATTTCACGTTGTGTGTAG
TGACTAACTGGCATGATTCTGCAGAGGCGGCCCTCGTGGTGGCCAGTGGG
CCAACGCCAACGCCCCTGATTTCAGCCCTCGCGGTCCCAATGGTAACACT
AGCTGGAGCCCTCACGAAGCTCGCCGGCCCTTTAATCCAAATGCTTACGG
ACACCCAGGTCACGGAGGTTCTTATGGAAGTGGAGGTGGTTCTGCCCGAG
GCTCTGGAGATGGCCAGTGGCGTGACGGCAAGCACATTCCCGGTCCTGCC
AATCCCCGTCTCGAACGCGAACTGTTCGGTCTTCCCAACGATCCCACCAA
GCAAAACACTGGCATCAACTTTGCCAACTACGACGACATCCCCGTGGAGG
CCTCTGGTCACGATGTCCCGGAGCCGGTCAACGCCTTCACCAACCCGCCC
CTGGATGACCACTTGATCGAGAACATCAAGCTCGCCCACTACCAGACTCC
CACTCCCGTCCAGAAGTATTCCATCCCCATCGTCATGAACGGCCGCGACT
TGATGGCCTGCGCCCAGACTGGTTCCGGAAAGACTGGTGGTTTCCTCTTC
CCTATTTTGTCTCAGGCTTATCAGAACGGTCCTTCCGCTGCTCCTGCCCA
GGCCGGCGGCCAATTTGGCTACGGACGTCAACGCAAGGCGTACCCGACCT
CCCTCATTCTCGCCCCCACCCGTGAGCTTGTTTCCCAGATTTTCGATGAG
GCCCGCAAGTTCGCCTACCGCTCTTGGGTCCGCCCTTGTGTTGTGTACGG
TGGTGCCGATATCGGCTCCCAGCTCCGCCAGATCGAGCGCGGATGTGATC
TTCTGGTTGCTACTCCTGGTCGTCTTGTCGATCTTATCGAGCGTGGCCGC
ATCTCTCTGGTCAACATCAAGTACCTGATTCTCGATGAGGCCGATCGTAT
GTTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATTCGCCGCATTGTGGAAGGCGAGG
ATATGCCCCACGTGAACGACCGCCAGACGCTGATGTTTTCGGCCACCTTC
CCCCGTGACATCCAGATGCTGGCTCGCGACTTCTTGAAGGACTACGTCTT
CCTGTCCGTCGGCCGTGTCGGTTCTACCTCTGAGAACATCACCCAGAAGG
TTGAATACGTTGAGGACCACGACAAGCGCTCCGTCCTCTTGGATATCCTC
CACACGCACGGCACTAGCGGTCTGACCCTCATCTTCGTCGAAACCAAGCG
TATGGCCGACTCCCTGTCCGACTTCCTTCTCAACCAGCGTTTCCCCGCCA
CCGCTATTCACGGTGATCGTACCCAGCGTGAGCGTGAGCGTGCTTTGGAA
ATGTTCCGCTCTGGCCGTTGCCCTATCCTTGTTGCCACTGCTGTTGCTGC
TCGTGGTCTCGATATCCCCAATGTTACCCACGTCATCAACTACGACTTGC
CCACCGACATCGATGACTATGTTCACCGTATCGGTCGTACTGGTCGTGCC
GGTAACACTGGTATCGCCACTGCTTTCTTCAACCGTGGTAACCGGGGTGT
TGTCCGCGACCTGATTGATCTCCTGAAGGAGGCTCATCAGGAGGTCCCCT
CCTTCCTCGAGAGCATTGCTCGTGAGGGCAGCGGCTATGGTGGTCGTGGC
GGCCGTGGTGGCCGTGGTCGTGGCGCCAACGCTACCCGTGACATGCGTCG
CATGGGCGGTGGTATGGGCGGTCCTCCCTCCTTTGGTGGCAGCAGCTACG
GTGCACCTGGCGGCAGCTATGGTGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCTAT
GGCGCTCCTCCCTCCTATGGAGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCAG
CTACGGTGGTGGTTACGGCAACCCGTCCGGCCCTACTGGACCTTCTTCCT
GGTGGTAAATCACCCGCCAGGGGAAGTTGTGGTCTCTGACGAGGCCGTCG
GGTCTGATTGGCTTCTTTCTCTTCATTTGCCTCTCCTTTGACGGATACGA
TCAGAACGAGTCCTGAGTTCTTCTTCTCTTTCCTCTCATCCCTATCTTTT
CTCTCTCAGGGTCGGCTTTGTCATGACTGCCACGACATTATCTTAGATGC
GTTCTAAGAATTTGTTTTTTTGCTTTTCTTTTCTTTCTTGTTATTCTCCT
ATGTGCAGGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGCTGCTGAGCATTTTATCAA
TGTCGCCTATTTTATCGTTTTGTTTTAGACATGGGTTTCGATGTGGTCCG
ATCTCCTTATCTCGCTGCTCGTGGTTATACCCGGTTATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000019.1:588607..591096+ >CAN33_4690-T1 ID=CAN33_4690-T1|Name=CAN33_4690-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=5436bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000019.1:588607..591096+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGCCGACAGCTTGAAGATGGGAAACCTTTCCCTCAACGAGTCTCAGCA
CGCTCCTGCCCCTGCCCCCTCCACGGGTCGCGCCGCTTACATCCCTCCCC
ATCTTCGCGGACGCCAGATGGGTGGAAACATGGACGGTGCTGCCGCCGCT
GCCCCTCCCCCCGGTCCCGCCGCTGGCCCTGGCAACTCCTGGGGTGGTCC
TAGAGGCGGCCCTCGTGGTGGCCAGTGGGCCAACGCCAACGCCCCTGATT
TCAGCCCTCGCGGTCCCAATGGTAACACTAGCTGGAGCCCTCACGAAGCT
CGCCGGCCCTTTAATCCAAATGCTTACGGACACCCAGGTCACGGAGGTTC
TTATGGAAGTGGAGGTGGTTCTGCCCGAGGCTCTGGAGATGGCCAGTGGC
GTGACGGCAAGCACATTCCCGGTCCTGCCAATCCCCGTCTCGAACGCGAA
CTGTTCGGTCTTCCCAACGATCCCACCAAGCAAAACACTGGCATCAACTT
TGCCAACTACGACGACATCCCCGTGGAGGCCTCTGGTCACGATGTCCCGG
AGCCGGTCAACGCCTTCACCAACCCGCCCCTGGATGACCACTTGATCGAG
AACATCAAGCTCGCCCACTACCAGACTCCCACTCCCGTCCAGAAGTATTC
CATCCCCATCGTCATGAACGGCCGCGACTTGATGGCCTGCGCCCAGACTG
GTTCCGGAAAGACTGGTGGTTTCCTCTTCCCTATTTTGTCTCAGGCTTAT
CAGAACGGTCCTTCCGCTGCTCCTGCCCAGGCCGGCGGCCAATTTGGCTA
CGGACGTCAACGCAAGGCGTACCCGACCTCCCTCATTCTCGCCCCCACCC
GTGAGCTTGTTTCCCAGATTTTCGATGAGGCCCGCAAGTTCGCCTACCGC
TCTTGGGTCCGCCCTTGTGTTGTGTACGGTGGTGCCGATATCGGCTCCCA
GCTCCGCCAGATCGAGCGCGGATGTGATCTTCTGGTTGCTACTCCTGGTC
GTCTTGTCGATCTTATCGAGCGTGGCCGCATCTCTCTGGTCAACATCAAG
TACCTGATTCTCGATGAGGCCGATCGTATGTTGGACATGGGTTTCGAGCC
CCAGATTCGCCGCATTGTGGAAGGCGAGGATATGCCCCACGTGAACGACC
GCCAGACGCTGATGTTTTCGGCCACCTTCCCCCGTGACATCCAGATGCTG
GCTCGCGACTTCTTGAAGGACTACGTCTTCCTGTCCGTCGGCCGTGTCGG
TTCTACCTCTGAGAACATCACCCAGAAGGTTGAATACGTTGAGGACCACG
ACAAGCGCTCCGTCCTCTTGGATATCCTCCACACGCACGGCACTAGCGGT
CTGACCCTCATCTTCGTCGAAACCAAGCGTATGGCCGACTCCCTGTCCGA
CTTCCTTCTCAACCAGCGTTTCCCCGCCACCGCTATTCACGGTGATCGTA
CCCAGCGTGAGCGTGAGCGTGCTTTGGAAATGTTCCGCTCTGGCCGTTGC
CCTATCCTTGTTGCCACTGCTGTTGCTGCTCGTGGTCTCGATATCCCCAA
TGTTACCCACGTCATCAACTACGACTTGCCCACCGACATCGATGACTATG
TTCACCGTATCGGTCGTACTGGTCGTGCCGGTAACACTGGTATCGCCACT
GCTTTCTTCAACCGTGGTAACCGGGGTGTTGTCCGCGACCTGATTGATCT
CCTGAAGGAGGCTCATCAGGAGGTCCCCTCCTTCCTCGAGAGCATTGCTC
ACATGGGTTTCGATGTGGTCCGATCTCCTTATCTCGCTGCTCGTGGTTAT
ACCCGGTTATAAATGGCCGACAGCTTGAAGATGGGAAACCTTTCCCTCAA
CGAGTCTCAGCACGCTCCTGCCCCTGCCCCCTCCACGGGTCGCGCCGCTT
ACATCCCTCCCCATCTTCGCGGACGCCAGATGGGTGGAAACATGGACGGT
GCTGCCGCCGCTGCCCCTCCCCCCGGTCCCGCCGCTGGCCCTGGCAACTC
CTGGGGTGGTCCTAGAGGCGGCCCTCGTGGTGGCCAGTGGGCCAACGCCA
ACGCCCCTGATTTCAGCCCTCGCGGTCCCAATGGTAACACTAGCTGGAGC
CCTCACGAAGCTCGCCGGCCCTTTAATCCAAATGCTTACGGACACCCAGG
TCACGGAGGTTCTTATGGAAGTGGAGGTGGTTCTGCCCGAGGCTCTGGAG
ATGGCCAGTGGCGTGACGGCAAGCACATTCCCGGTCCTGCCAATCCCCGT
CTCGAACGCGAACTGTTCGGTCTTCCCAACGATCCCACCAAGCAAAACAC
TGGCATCAACTTTGCCAACTACGACGACATCCCCGTGGAGGCCTCTGGTC
ACGATGTCCCGGAGCCGGTCAACGCCTTCACCAACCCGCCCCTGGATGAC
CACTTGATCGAGAACATCAAGCTCGCCCACTACCAGACTCCCACTCCCGT
CCAGAAGTATTCCATCCCCATCGTCATGAACGGCCGCGACTTGATGGCCT
GCGCCCAGACTGGTTCCGGAAAGACTGGTGGTTTCCTCTTCCCTATTTTG
TCTCAGGCTTATCAGAACGGTCCTTCCGCTGCTCCTGCCCAGGCCGGCGG
CCAATTTGGCTACGGACGTCAACGCAAGGCGTACCCGACCTCCCTCATTC
TCGCCCCCACCCGTGAGCTTGTTTCCCAGATTTTCGATGAGGCCCGCAAG
TTCGCCTACCGCTCTTGGGTCCGCCCTTGTGTTGTGTACGGTGGTGCCGA
TATCGGCTCCCAGCTCCGCCAGATCGAGCGCGGATGTGATCTTCTGGTTG
CTACTCCTGGTCGTCTTGTCGATCTTATCGAGCGTGGCCGCATCTCTCTG
GTCAACATCAAGTACCTGATTCTCGATGAGGCCGATCGTATGTTGGACAT
GGGTTTCGAGCCCCAGATTCGCCGCATTGTGGAAGGCGAGGATATGCCCC
ACGTGAACGACCGCCAGACGCTGATGTTTTCGGCCACCTTCCCCCGTGAC
ATCCAGATGCTGGCTCGCGACTTCTTGAAGGACTACGTCTTCCTGTCCGT
CGGCCGTGTCGGTTCTACCTCTGAGAACATCACCCAGAAGGTTGAATACG
TTGAGGACCACGACAAGCGCTCCGTCCTCTTGGATATCCTCCACACGCAC
GGCACTAGCGGTCTGACCCTCATCTTCGTCGAAACCAAGCGTATGGCCGA
CTCCCTGTCCGACTTCCTTCTCAACCAGCGTTTCCCCGCCACCGCTATTC
ACGGTGATCGTACCCAGCGTGAGCGTGAGCGTGCTTTGGAAATGTTCCGC
TCTGGCCGTTGCCCTATCCTTGTTGCCACTGCTGTTGCTGCTCGTGGTCT
CGATATCCCCAATGTTACCCACGTCATCAACTACGACTTGCCCACCGACA
TCGATGACTATGTTCACCGTATCGGTCGTACTGGTCGTGCCGGTAACACT
GGTATCGCCACTGCTTTCTTCAACCGTGGTAACCGGGGTGTTGTCCGCGA
CCTGATTGATCTCCTGAAGGAGGCTCATCAGGAGGTCCCCTCCTTCCTCG
AGAGCATTGCTCACATGGGTTTCGATGTGGTCCGATCTCCTTATCTCGCT
GCTCGTGGTTATACCCGGTTATAAATGGCCGACAGCTTGAAGATGGGAAA
CCTTTCCCTCAACGAGTCTCAGCACGCTCCTGCCCCTGCCCCCTCCACGG
GTCGCGCCGCTTACATCCCTCCCCATCTTCGCGGACGCCAGATGGGTGGA
AACATGGACGGTGCTGCCGCCGCTGCCCCTCCCCCCGGTCCCGCCGCTGG
CCCTGGCAACTCCTGGGGTGGTCCTAGAGGCGGCCCTCGTGGTGGCCAGT
GGGCCAACGCCAACGCCCCTGATTTCAGCCCTCGCGGTCCCAATGGTAAC
ACTAGCTGGAGCCCTCACGAAGCTCGCCGGCCCTTTAATCCAAATGCTTA
CGGACACCCAGGTCACGGAGGTTCTTATGGAAGTGGAGGTGGTTCTGCCC
GAGGCTCTGGAGATGGCCAGTGGCGTGACGGCAAGCACATTCCCGGTCCT
GCCAATCCCCGTCTCGAACGCGAACTGTTCGGTCTTCCCAACGATCCCAC
CAAGCAAAACACTGGCATCAACTTTGCCAACTACGACGACATCCCCGTGG
AGGCCTCTGGTCACGATGTCCCGGAGCCGGTCAACGCCTTCACCAACCCG
CCCCTGGATGACCACTTGATCGAGAACATCAAGCTCGCCCACTACCAGAC
TCCCACTCCCGTCCAGAAGTATTCCATCCCCATCGTCATGAACGGCCGCG
ACTTGATGGCCTGCGCCCAGACTGGTTCCGGAAAGACTGGTGGTTTCCTC
TTCCCTATTTTGTCTCAGGCTTATCAGAACGGTCCTTCCGCTGCTCCTGC
CCAGGCCGGCGGCCAATTTGGCTACGGACGTCAACGCAAGGCGTACCCGA
CCTCCCTCATTCTCGCCCCCACCCGTGAGCTTGTTTCCCAGATTTTCGAT
GAGGCCCGCAAGTTCGCCTACCGCTCTTGGGTCCGCCCTTGTGTTGTGTA
CGGTGGTGCCGATATCGGCTCCCAGCTCCGCCAGATCGAGCGCGGATGTG
ATCTTCTGGTTGCTACTCCTGGTCGTCTTGTCGATCTTATCGAGCGTGGC
CGCATCTCTCTGGTCAACATCAAGTACCTGATTCTCGATGAGGCCGATCG
TATGTTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATTCGCCGCATTGTGGAAGGCG
AGGATATGCCCCACGTGAACGACCGCCAGACGCTGATGTTTTCGGCCACC
TTCCCCCGTGACATCCAGATGCTGGCTCGCGACTTCTTGAAGGACTACGT
CTTCCTGTCCGTCGGCCGTGTCGGTTCTACCTCTGAGAACATCACCCAGA
AGGTTGAATACGTTGAGGACCACGACAAGCGCTCCGTCCTCTTGGATATC
CTCCACACGCACGGCACTAGCGGTCTGACCCTCATCTTCGTCGAAACCAA
GCGTATGGCCGACTCCCTGTCCGACTTCCTTCTCAACCAGCGTTTCCCCG
CCACCGCTATTCACGGTGATCGTACCCAGCGTGAGCGTGAGCGTGCTTTG
GAAATGTTCCGCTCTGGCCGTTGCCCTATCCTTGTTGCCACTGCTGTTGC
TGCTCGTGGTCTCGATATCCCCAATGTTACCCACGTCATCAACTACGACT
TGCCCACCGACATCGATGACTATGTTCACCGTATCGGTCGTACTGGTCGT
GCCGGTAACACTGGTATCGCCACTGCTTTCTTCAACCGTGGTAACCGGGG
TGTTGTCCGCGACCTGATTGATCTCCTGAAGGAGGCTCATCAGGAGGTCC
CCTCCTTCCTCGAGAGCATTGCTCACATGGGTTTCGATGTGGTCCGATCT
CCTTATCTCGCTGCTCGTGGTTATACCCGGTTATAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
| GO:0005524 | ATP binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR027417 |
| DBxref | InterPro:IPR014014 |
| DBxref | InterPro:IPR000629 |
| DBxref | InterPro:IPR011545 |
| DBxref | InterPro:IPR001650 |
| DBxref | InterPro:IPR014001 |
| DBxref | PFAM:PF00271 |
| DBxref | PFAM:PF00270 |
| Product | DEAD-box ATP-dependent RNA helicase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| NKJJ01000019.1 | supercontig | NKJJ01000019.1:588607..591096 + |
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