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CAN33_54465-T1, CAN33_54465-T1 (mRNA) Aspergillus niger FDAARGOS_311

Overview
NameCAN33_54465-T1
Unique NameCAN33_54465-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger FDAARGOS_311
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at NKJJ01000020.1:2843517..2845277+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>CAN33_54465-T1 ID=CAN33_54465-T1|Name=CAN33_54465-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1761bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000020.1:2843517..2845277+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTC
TGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCG
AGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG
CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGG
TTACTCTACTGGTATGGTGACATCGATTCTCTGCAGCTAGTCCCCTCGGT
TGCTAACCTTTTCCACCACCAGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGA
TGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTT
TCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGGTAAGTGGCATACAT
CATGGACTGTCCCTAGAGACCAACCCGACTGACAATCTCTTCAGCTGTGT
ATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCAT
GGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTA
TCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGT
CGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCAT
GTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTG
CCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAAC
TTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGG
CATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGC
CCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGT
GAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGC
CCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCG
GTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGT
ACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAA
CTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCA
ACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACC
CTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGAT
GGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTG
GTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGT
AAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCAC
CTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCT
ACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAAC
TTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGC
CTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCT
TCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACC
ATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCG
GAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAG
GGTCAGGCTGA
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Coding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000020.1:2843517..2845277+

>CAN33_54465-T1 ID=CAN33_54465-T1|Name=CAN33_54465-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=4923bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000020.1:2843517..2845277+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTC
TGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCG
AGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGG
CGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGG
TTACTCTACTGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCC
AACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTC
CGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGC
CCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCT
GTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACC
GACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGG
TGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTC
CCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCC
TTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCA
GTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCT
TGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCC
TACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTA
CGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGA
AGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAG
CTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCT
GCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAA
ACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATC
ATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGT
CGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGT
TCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTT
GCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCAC
TTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGG
CCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGT
ATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCAC
CCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTG
GATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACC
CAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAA
GCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACAT
GCACCGCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAATGGGTGTC
TCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTC
CACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACA
ATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGGCGCTCCTTC
ATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTAC
TGGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCG
GTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGT
CTCATTGTCGGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGC
TGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGT
CTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAAC
TGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGC
CCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGG
TCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATC
TTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGC
TTCCTGGCGTATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGG
CTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAG
GGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAG
CCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGC
TCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACC
GGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCT
CCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCT
TCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGT
GCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTT
CGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCT
TCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCT
CAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTT
CATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTG
GTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACC
GCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCAT
CTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTT
TCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGC
ACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCA
GAGTGCCAGCTGGGTTCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCC
CCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAATGGGTGTCTCTAATATG
ATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGC
TCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGC
TCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGGCGCTCCTTCATCCTGGGT
ATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTCAAAT
CTCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAAC
AGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTC
GGTCTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTAT
CGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCC
ACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAG
GTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAG
CATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTG
CCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCC
TACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCG
TATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCT
CTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATC
GATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCA
CCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGG
AGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGC
ATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCT
GACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCA
CTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAAC
TTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCG
TAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCT
GGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACT
CCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGG
TTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGT
ACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAAC
TGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTC
CATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCA
TCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAG
GAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAG
CTGGGTTCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCTTCCTCT
TCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGA
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016021integral component of membrane
GO:0016020membrane
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0022857transmembrane transporter activity
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0055085transmembrane transport
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_54465CAN33_54465Aspergillus niger FDAARGOS_311gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_54465-T1.exon1CAN33_54465-T1.exon1Aspergillus niger FDAARGOS_311exon
CAN33_54465-T1.exon2CAN33_54465-T1.exon2Aspergillus niger FDAARGOS_311exon
CAN33_54465-T1.exon3CAN33_54465-T1.exon3Aspergillus niger FDAARGOS_311exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_54465-T1.cdsCAN33_54465-T1.cdsAspergillus niger FDAARGOS_311CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
CAN33_54465-T1CAN33_54465-T1-proteinAspergillus niger FDAARGOS_311polypeptide


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR036259
DBxrefInterPro:IPR020846
DBxrefInterPro:IPR005829
DBxrefInterPro:IPR005828
DBxrefInterPro:IPR003663
DBxrefPFAM:PF00083
DBxrefPFAM:PF07690
ProductSugar (and other) transporter family protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger FDAARGOS_311 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
NKJJ01000020.1supercontigNKJJ01000020.1:2843517..2845277 +
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