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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000019.1:1445830..1448143+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_6085-T1 ID=CAN33_6085-T1|Name=CAN33_6085-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=2314bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000019.1:1445830..1448143+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGCCGACGGCAGTGTTATGCCCCCCAAGTCCTCCGTGGTAAGAAATCG
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TCCACCAGAAGCACCCGACAGGTACCCACTTGAAAGACCTTGACGAGTAC
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CAGCAGGGTGTGAAGAAGGGTGACACCGTTGCTATCTACCTTCCCATGAT
TCCGGAGGCCATTGTCGCTTTCTTGGCTTGCTCTCGTATCGGTGCCGTCC
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CTGGACGCTGGCTCCAAGGTCGTCATCACGACCGATGAGGGCAAGCGTGG
AGGAAAGGTCATTGGCACCAAGCGCATTGTCGATGAAGCCCTGAAGCAGT
GCCCCGATGTCACTAGCGTCCTGGTCTACAAGCGCACCGGCGCGGAGGTC
CCCTGGACCAAGGGCCGTGATGTCTGGTGGCACGAGGAGGTCGAGAAGTA
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GTGGTCTTCGAGAGTACCCCGGCTTACCCCAACTTCTCCCGTTACTGGGA
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TAAGTGACTTGTTGGGTTTTTCTTGACTTGGAATGATAGTCTAATGCGCT
TCCACAGACCTACTGGCAGACTGAGACGGGTTCGAATGTCATCACTCCCT
GGGTGGTATTACCCCGACGAAACCCGGAAGCGCGTCGCTTCCCTTCTTTG
GCATTGAGCCCGCCATCATTGACCCGGTCTCTGGTGAGGAGATCACTGGC
AACGATGTGGAGGGTGTGCTTGCCTTCAAGCAACCCTGGCCGAGCATGGC
CCGTACCGTGTGGGGCGCCCACAAGCGCTACATGGATACCTACTTGAACG
TTTACAAGGGCTACTACGTAAGCGACATTCAAAAACGAATGCTCAATGGA
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CGATCACGACGGATACTACTGGATCCGGGGTCGTGTTGACGATGTGGTCA
ACGTTTCCGGACACCGTCTGTCCACGGCTGAGATTGAAGCCGCCCTCATT
GAGCACCGTAAGTTACCACAATGATCATCCATATATATATAACAACAACT
AATCGGTTATGATAGACATGGTGGCTGAGGCTGCTGTCGTTGGTATTGCT
GACGAGCTTACCGGTCAGGCCGTCAACGCATTCGTGGCCCTGAAAGAGGG
CAACGAGACCAGCGACCAGGTCCGCAAGGATCTGATCATGCAGGTTCGTC
GGTCCATCGGACCTTTCGCTGCCCCCAAGGCTGTCTACGTTGTCGAGGAT
CTCCCCAAGACCCGTAGCGGTAAGATCATGCGCCGTATTCTCCGGAAGAT
CCTGAGCGGTGAGGAGGACAGCCTGGGTGACACTTCTACTGTAAGATTAC
AACTACTCTTGCCTATGCTGGGTATGCAGAAACTAACTAAATATCTTACA
GCTGTCGGACCCTTCGGTTGTTGACAAGATCATTGCCACGGTGCACGCTG
CCCGTGGCAAATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000019.1:1445830..1448143+ >CAN33_6085-T1 ID=CAN33_6085-T1|Name=CAN33_6085-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=13713bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000019.1:1445830..1448143+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGGCCGACGGCAGTGTTATGCCCCCCAAGTCCTCCGTGGTGGTCGAGGC CCACGAAGTCGACACCTTCCATGTCCCCGAAGCATTCCACCAGAAGCACC CGACAGGTACCCACTTGAAAGACCTTGACGAGTACAAGAAGCTCTATGAG GAGTCCATCCGCAGCCCAGACACTTTTTGGGCTCGCATGGCCCGCGAACT TCTTCACTTCGACCAAGACTTCCAGACCACCCACAGTGGGTCGCTGGAGA ATGGCGACAATGCCTGGTTTGTCGAGGGTCGTCTGAACGCCTCCTACAAC TGCGTCGATCGCCATGCCTTCAAGAACCCCGACAAGGTCGCCATTATCTA CGAGGCCGATGAGCCCAGCGAGGGCCGCACAATCACCTACGGTGAGCTCC TGCGCGAGGTGTCTCGTGTGGCCTGGGTTCTCCGCCAGCAGGGTGTGAAG AAGGGTGACACCGTTGCTATCTACCTTCCCATGATTCCGGAGGCCATTGT CGCTTTCTTGGCTTGCTCTCGTATCGGTGCCGTCCACTCCGTTGTTTTCG CCGGTTTCTCGTCCGACTCTCTCCGGGACCGTGTCCTGGACGCTGGCTCC AAGGTCGTCATCACGACCGATGAGGGCAAGCGTGGAGGAAAGGTCATTGG 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CCTTCCCATGATTCCGGAGGCCATTGTCGCTTTCTTGGCTTGCTCTCGTA TCGGTGCCGTCCACTCCGTTGTTTTCGCCGGTTTCTCGTCCGACTCTCTC CGGGACCGTGTCCTGGACGCTGGCTCCAAGGTCGTCATCACGACCGATGA GGGCAAGCGTGGAGGAAAGGTCATTGGCACCAAGCGCATTGTCGATGAAG CCCTGAAGCAGTGCCCCGATGTCACTAGCGTCCTGGTCTACAAGCGCACC GGCGCGGAGGTCCCCTGGACCAAGGGCCGTGATGTCTGGTGGCACGAGGA GGTCGAGAAGTACCCCAACTACCTTGCTCCTGAGCCGGTGAACTCGGAAG ATCCCCTCTTCCTGCTCTACACCTCTGGTTCTACCGGAAAGCCCAAGGGT GTCATGCACACCACGGCTGGTTACCTTTTGGGTGCTGCCATGACCGGCAA GTATGTCTTTGATATCCACGACGATGACCGCTACTTCTGTGGTGGTGATG TTGGCTGGATCACCGGCCACACGTACGTCGTATATGCACCCTTGCTGCTC GGATGCTCTACCGTGGTCTTCGAGAGTACCCCGGCTTACCCCAACTTCTC CCGTTACTGGGACGTGATCGAGAAGCACAAGGTGACCCAATTCTACGTCG CCCCCACTGCCCTGCGACTTCTGAAGCGGGCTGGCGACGAGCACATTCAC CACAAGATGGCACACCTGCGTGTCCTGGGCTCTGTCGGTGAGCCTATTGC TGCCGAGGTCTGGAAATGGTACTTCGAGGTGGTCGGAAAGGAAGAAGCCC ACATCTGCGATACCTACTGGCAGACTGAGACGGGTTCGAATGTCATCACT CCCTGGGTGCCCGCCATCATTGACCCGGTCTCTGGTGAGGAGATCACTGG CAACGATGTGGAGGGTGTGCTTGCCTTCAAGCAACCCTGGCCGAGCATGG CCCGTACCGTGTGGGGCGCCCACAAGCGCTACATGGATACCTACTTGAAC GTTTACAAGGGCTACTACTTCACTGGAGATGGTGCAGGCCGCGATCACGA CGGATACTACTGGATCCGGGGTCGTGTTGACGATGTGGTCAACGTTTCCG GACACCGTCTGTCCACGGCTGAGATTGAAGCCGCCCTCATTGAGCACCAC ATGGTGGCTGAGGCTGCTGTCGTTGGTATTGCTGACGAGCTTACCGGTCA GGCCGTCAACGCATTCGTGGCCCTGAAAGAGGGCAACGAGACCAGCGACC AGGTCCGCAAGGATCTGATCATGCAGGTTCGTCGGTCCATCGGACCTTTC GCTGCCCCCAAGGCTGTCTACGTTGTCGAGGATCTCCCCAAGACCCGTAG CGGTAAGATCATGCGCCGTATTCTCCGGAAGATCCTGAGCGGTGAGGAGG ACAGCCTGGGTGACACTTCTACTCTGTCGGACCCTTCGGTTGTTGACAAG ATCATTGCCACGGTGCACGCTGCCCGTGGCAAATAAATGGCCGACGGCAG TGTTATGCCCCCCAAGTCCTCCGTGGTGGTCGAGGCCCACGAAGTCGACA CCTTCCATGTCCCCGAAGCATTCCACCAGAAGCACCCGACAGGTACCCAC TTGAAAGACCTTGACGAGTACAAGAAGCTCTATGAGGAGTCCATCCGCAG CCCAGACACTTTTTGGGCTCGCATGGCCCGCGAACTTCTTCACTTCGACC AAGACTTCCAGACCACCCACAGTGGGTCGCTGGAGAATGGCGACAATGCC TGGTTTGTCGAGGGTCGTCTGAACGCCTCCTACAACTGCGTCGATCGCCA TGCCTTCAAGAACCCCGACAAGGTCGCCATTATCTACGAGGCCGATGAGC CCAGCGAGGGCCGCACAATCACCTACGGTGAGCTCCTGCGCGAGGTGTCT 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003824 | catalytic activity |
| GO:0016208 | AMP binding |
| GO:0003987 | acetate-CoA ligase activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0019427 | acetyl-CoA biosynthetic process from acetate |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR020845 |
| DBxref | InterPro:IPR000873 |
| DBxref | InterPro:IPR025110 |
| DBxref | InterPro:IPR011904 |
| DBxref | InterPro:IPR032387 |
| DBxref | InterPro:IPR042099 |
| DBxref | PFAM:PF13193 |
| DBxref | PFAM:PF00501 |
| DBxref | PFAM:PF16177 |
| Product | acetate--CoA ligase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000019.1 | supercontig | NKJJ01000019.1:1445830..1448143 + |
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