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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch1:2909548..2912434+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_001143-T1 ID=KJC3_001143-T1|Name=KJC3_001143-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2887bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:2909548..2912434+ (Aspergillus niger KJC3)
CAGCACCGAATCACGCCCGGCCGCCAGCATCACGGACATATGGGGGTCAT
TAGATTCTGCAGAATGGACTGGCAAAGATGCGGTCGCCGTAGTAGAACCT
CCTGGTGACGCCGGAGAGCTGAAGCTGGTTACCATGCTGGCCAGCGCGTT
GCTCGGTACATCACGGGATCGTCGGCAAAACCGCCCCGGAAAGGCTAAGC
CGGACACATTCGCCCGTGTCCACCTCAACCTCAACCTCTTCCCTTCCTTT
CCCTCTTTCTTCCCTCTCCCCATCCTCTCGTCCTTTTGACCTTTTCTATA
CCCCATTTCGCTCTTCAACACCATCAAGATGTTCAAGAGGTATGTGATGA
TGTTCTCCCGGATCCCTCCTCCAACCTTTTATACATTTAGATAATTTTTT
ATCTACCTTTTAACCTTTTAGAGGCTTCCAACTAACCATTTCTTTCCCCC
TTGTTACAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCGAC
CTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTCCC
TCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCA
CCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGGTATGTCCCGGTCCCCCGTCCCAG
AGAAAACCCTGCCGGCGGCTACGCGAAAATCTTTTCCGAGCCTCGATTCC
ATCCACAATCTCATCAAATTCGACTCAATGGCCATCAAAAGAACACGATA
TCTGACTCTCGCCAACAGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCATT
CTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGT
TTCTGTATGTACACCAAAATCGAAGCTCCAATGACATCAAGCTCTTATAG
CTAACCCAACCTAGCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCC
ATGGACGGTAAGCTTTTCACTCTTCCCTGACCATGAAATTCGAGAGTTGC
TTGGCAATATCAACATATTGTCACCGCCTTCTCTCTACCTGGTCCTTCCA
CGTGTACTCGTCTCGCCGTGGCTAACATCAATGTGCTTCACAGGTACCGA
GGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCA
TCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGAC
CCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCA
CACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCG
TCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGT
AAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCA
GGAGCTGATTGTAAGTTTGGCAATCTTATCAAAAAGAAATTTCTCGTGGC
CCCGTAGAACTAACACATTCTCTAGAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTG
GTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGAT
CTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTC
CAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTG
CCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAG
GAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCA
GGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCG
GTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATT
ACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCC
TGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGG
ACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCT
GCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGT
CGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGG
AGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTG
TCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTT
CCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTA
AGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAAC
GGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGGTAAGTTGATTTCTCCACTTTCTGT
TTGGTGATCGGCATGGATGCTAATTTGTTTATCTACAGCTGCTTTCTACA
TGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCC
GAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTAATATTGTTTTTAAGCGCCCTTTTC
CTTTTTTGTTAGACATGGACTTCCTTTCTTCCATGTGCCGTTTTCTACCG
ATCCGTGTACAGTACTCGAATTGAGAAAAGGGAGTTGAAAGAAAGGCGAG
GTCCCCCCTATATAAAAGGATGAGAGCGCTCTTAACGTACACCTCTCTGA
AAGTCTGGATGGAAACTTCTAGACTTGTGTTACACTACGTGCTCATGTAA
GTAAGTTAAAATGACCACAGTCAGCCTGATACCCGCTGGGCTGGGACAAT
TGTACTCAAATTTCCTTTGTTGAACCGGGGGACCGTGATATCTGTTGCGT
AGACATTCCTGTAGCATGTAATCTGTAAGATTCCAAACGAGCCATACGTC
CCTTCTATGCCACGTATCAAGTTCTCGTTATCGTGCC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch1:2909548..2912434+ >KJC3_001143-T1 ID=KJC3_001143-T1|Name=KJC3_001143-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=10899bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:2909548..2912434+ (Aspergillus niger KJC3)
ATGTTCAAGAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCG
ACCTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTC
CCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATT
CACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCT
CCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCG
TCCTTGAGGTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCC
ATGGACGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGG
TGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTA
ACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAG
TTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGA
GGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCT
ACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAG
ACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGG
TTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATC
TGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCC
AAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGC
CCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGG
AGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAG
GCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGG
TTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTA
CCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCT
GCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGA
CGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTG
CCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTC
GGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGA
GTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGT
CTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTC
CTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAA
GCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACG
GTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTC
GAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAA
GGCCTAAATGTTCAAGAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTT
TTGCCCGACCTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAAT
GGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGG
AAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTG
ACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAG
AAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTAC
CATTGCCATGGACGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTG
ACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGT
ATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGC
CGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGT
CCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTT
GCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGT
CGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTC
ACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGT
AACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGG
TGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTG
CCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGT
GACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTT
CACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTG
CCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAG
CGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTA
CGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTC
ACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATC
TACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCG
TATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGC
TCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGAC
GAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCA
GCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCG
AGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATC
ATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGCTGCTTTCTACATGGTTGG
TGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCG
AGAACAAGGCCTAAATGTTCAAGAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGG
GCTGCTTTTGCCCGACCTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAA
GACCAATGGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTT
CCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTC
GACGGTGACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGG
TGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCG
TTCGTACCATTGCCATGGACGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCC
GCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCT
TGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCG
TCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTC
GAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGA
TCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTG
CCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCC
AAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCG
TGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGC
TCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCC
CCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTA
CTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTT
TCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATC
CCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTAT
GCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGG
CCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACC
TTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTT
GGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCG
ACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAG
CAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGG
TATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTA
AGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACT
GGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAA
GGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGCTGCTTTCTACA
TGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCC
GAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTTCAAGAGCGGTCTTGCCCGGACCTT
CGGGAGGGCTGCTTTTGCCCGACCTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCC
AGCCTAAGACCAATGGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAG
GCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGT
GAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCG
AGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTCAACACTTGGGTGAG
AATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGG
TGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCG
GCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGT
GGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGA
GTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGG
TCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTC
GGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTAACAA
CATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGC
GTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTC
ATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAA
CGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTG
CCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGAC
AACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGG
TCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGG
GTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCC
GTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGC
CACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCT
CCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGT
ATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCG
TGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCA
TTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGT
GCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGT
CTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCA
GTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGCTGCT
TTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGAT
CTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTTCAAGAGCGGTCTTGCCC
GGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCGACCTACCTCCGTCGCCCGTCGC
GCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTATGGCCAG
CACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCG
TCGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATT
GAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTCAACACTT
GGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGGTACCGAGGGTCTGA
CCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTC
GGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGA
CGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGG
CTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGT
ATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGG
TCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGA
TTAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTC
GGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGAC
TGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTC
AGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTG
ACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTT
CATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCC
TTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTC
GACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCAT
TACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTG
CCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGT
GGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAA
GTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCG
CCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATC
ATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGT
CGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCG
CCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACC
ATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGA
GGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTG
AGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTTCAAGAGCGGT
CTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCGACCTACCTCCGTCGC
CCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTA
TGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTGGT
GCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCATTCTCAA
CGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTC
AACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGGTACCGAG
GGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCAT
CCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACC
CCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCAC
ACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGT
CACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTA
AGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAG
GAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTG
TGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGC
AGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTG
TTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTAC
CGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGC
TGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTG
TCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCT
GGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGG
GTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACT
GACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTT
GTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCG
ACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTAC
AACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCA
GGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGC
TTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTC
ACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAA
GGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACC
TTCCTGAGGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCC
AAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTTCAA
GAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCGACCTACCT
CCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTCCCTCCCTG
GCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGT
CATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCA
TTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAG
GTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGG
TACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCA
TCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACT
GGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCC
CATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGA
TTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGT
GGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTT
CATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCG
TCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCAC
GAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGC
CCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCG
CCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAG
GACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTC
TGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGC
CCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACC
ACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGA
TTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCA
CTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGAC
CCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGA
CCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGT
CCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCT
GACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCA
GCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCG
ACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGT
GACGACCTTCCTGAGGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGC
CCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0045261 | proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0046933 | proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism |
| GO:0005524 | ATP binding |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0015986 | ATP synthesis coupled proton transport |
| GO:0046034 | ATP metabolic process |
| GO:1902600 | proton transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_001143-T1.utr5p1 | KJC3_001143-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_001143-T1.utr3p1 | KJC3_001143-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG09261T74 |
| DBxref | InterPro:IPR036121 |
| DBxref | InterPro:IPR027417 |
| DBxref | InterPro:IPR020003 |
| DBxref | InterPro:IPR005722 |
| DBxref | InterPro:IPR000194 |
| DBxref | InterPro:IPR004100 |
| DBxref | InterPro:IPR024034 |
| DBxref | InterPro:IPR003593 |
| DBxref | PFAM:PF02874 |
| DBxref | PFAM:PF00006 |
| Product | beta subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase |
| Product | atp2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch1 | supercontig | ch1:2909548..2912434 + |
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