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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch5:2802256..2805115+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_007562-T1 ID=KJC3_007562-T1|Name=KJC3_007562-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2860bp|location=Sequence derived from alignment at ch5:2802256..2805115+ (Aspergillus niger KJC3) CTGCAGTGAACGTTGTACCTGTTTGATATTACCCCATATCCATTAGGTAA
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TTGTTGCTCCCTCCCAGATTGAGCTGCGATAATCCCGGTGGATAATGGAT
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CACTGGGCTGACGTGCTCTCCTTCTCTCTTATTTTCCCACGGAATTCCCT
ACATTCTCTCTCTTTATTCATCATTACCCTTCCTCCTCCTCCCTCCCTCC
TTCTTCTTCTTTCCTCCCTCCCCTTAATCCTCTCTCTTGGACTCTCCCTT
GAACCTGTCTAGTTTCCCTGGTGGCACATACTCGACAATTGATACACCCT
GTCCCACCATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCC
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TGACGGATGGTTGTGGTTGATGCAGGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCC
ATTCTAAATGTATGTCGGCAAATCAACGCCTCCGCTTGATGTCGATAAGA
GACCGTCTCTGGTACTAGGCCACACCAGGAAGTTGGTAGCTAATTAAGTC
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GTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTAAGTCATTGGTGCTTTGGG
TTCATCCCTGCTTCTACTCTGCAAGGCGGATATGTTTCTTGCTTTGATCG
TGTCGGTAGTAGGTGAGATCCTTCTGCTAACTCCTGTTTTCTCTAGGGTT
GATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGT
TCTTGTCGGCCTATCCTACGTAGGTGCTTCTGGTTGTGCTTCTTGGGCTT
TGGACTAATTTGGCTAGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGTGA
GTATTCTTGATTCATACTCCATGACTATTTCGGTACGGTGCTGACTATTC
TTCCTCTACAGTTAGTAGGTTTTCCATAACCTGTTCGATATCACTTCCTT
GCTGACGATAGATGAAAGTTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCG
TGGATTACAGGATGGGCGAACGTGACTGGCTGGGTATGTGTACAAGACTT
ATTTGTGCATGCAGCTGCTAATTCTTACAGGTTGCCTTGACTGCAACTGG
TGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATC
CCGTAAGTCCTTTGCTGGCTTTTAGACCCGAACACTTTACTCACAGCCCA
ACAGTCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCT
ATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCC
AAGGTTACTAAGGGTGCCTGTAAGTAGAATTGTCCGTCTGGGGATATCGA
TCTAAAGCTGACGTGTCTCTAGTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTAT
AATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCG
AGTGAGTAATGCCGTTAGCTGACTTCCATTGGACGTGTTGCTGACTCAAT
AGGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATGTAAGGCAGACCA
CACCCCTTTCTGATCGGCCAATGCTAACATTTCTTAGGGCCTGATGGACT
TGCTTGGCTGCTCGGAGTATGTTTCACTACCTAAATTCTGTGTGAAGATT
GTTACTCATACCATCTAGCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTT
TGTAAGTCTTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGG
ACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGGTAAATCTGCCAAATACTACCGGCCT
CGTCGCATACTAAACATGCATAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGC
CCAAGATCATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATC
TTCCTGATCGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAA
CTCCGCGGCTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACA
ACGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTGTAAGTTGTTCCTAAGATTTCGGTC
CGCATTTACTGACATGCTTAAGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCC
GCTATCACGATCATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAG
AGATGGCGGTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGC
TTGAGGTTCCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATT
TTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGGTACGTAAACTACAAAAAGGC
AATAATACATCTTGCGGTATGCTAACCTTAACAGTGCATTCAACGCTATT
GTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGC
AGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTT
TGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGA
CTACGCATGCACAGAATTCTTACATGTTTCCTGAATAGATCTCGCTAGCC
TACGTTTCTC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch5:2802256..2805115+ >KJC3_007562-T1 ID=KJC3_007562-T1|Name=KJC3_007562-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=22440bp|location=Sequence derived from alignment at ch5:2802256..2805115+ (Aspergillus niger KJC3) ATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCA CAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTGTCAATGTTGGGTTTAG CGTTTGCCATTCTAAATTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTC AGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGGTTGATCACGGC TGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCGG CCTATCCTACTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGTTATTTCCTGG GAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATGGGCGAACGTGAC TGGCTGGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGA TCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCTCATATGTGTCGCAACGCTGG CATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAA TGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTTTATCT GGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCG TCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGA AACAGGATGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGACTCCTTCAAGGAG 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CAACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTCTTCCCTCTCGTG TGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGACCAGTAGTCGTATGAT CTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCA AGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAAC ATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGTGCATT CAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCA TCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGG TCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCT CACTTGGTGAATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGG CCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTGTCAATG TTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAG TTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGGT TGATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAG TTCTTGTCGGCCTATCCTACTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGT TATTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATGGG CGAACGTGACTGGCTGGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTCTCGGA AGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCTCATATGTGTC GCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCAT TCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGT GCCTTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCT GGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTTCGTCTTCGGAGAAT TCATCAACGAAACAGGATGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGACTC CTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGACGGTGTCGCGCACATGAT CGAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGATCGGTT GCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTCTCCTC TTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACGCCTTT GCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTTGCC TTCTCGTCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATG ACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCC CGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGA ATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTC CTTGGCTCGTCAAGTGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCAT GCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGC GGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGG ATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGAATGAAAGACTTTCGGGGAGA TGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCA ATTTCTCAATGCTGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATTCA TGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTG 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TCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGTGCATTCAACGCTATT GTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGC AGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTT TGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGA ATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCA CAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTGTCAATGTTGGGTTTAG CGTTTGCCATTCTAAATTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTC AGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGGTTGATCACGGC TGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCGG CCTATCCTACTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGTTATTTCCTGG GAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATGGGCGAACGTGAC TGGCTGGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGA TCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCTCATATGTGTCGCAACGCTGG CATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAA TGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTTTATCT GGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCG TCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGA AACAGGATGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGACTCCTTCAAGGAG GACTGGGTCTCACAGGCTTTGACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGAAATT CCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGATCGGTTGCGTCGGTAT TGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTCTCCTCTTTGTGGCTG GAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACGCCTTTGCTGCAAATT TTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTCTT CCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGACCAGTA GTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCTTCTCCT TTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGCTTTGTA CCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGT CAAGTGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATA GCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCT ACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACT TGGTACGTCTCACTTGGTGAATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCC CAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAAT GCTGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATTCATGGACCGCTC TGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTC ATCTGGGGGTTGATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTC CCTTGCCGAGTTCTTGTCGGCCTATCCTACTGCTGGTGGACAATACCATT GGGTTGCAGTTATTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATT ACAGGATGGGCGAACGTGACTGGCTGGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGG 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AGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTT TGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGA ATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCA CAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTGTCAATGTTGGGTTTAG CGTTTGCCATTCTAAATTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTC AGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGGTTGATCACGGC TGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCGG CCTATCCTACTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGTTATTTCCTGG GAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATGGGCGAACGTGAC TGGCTGGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGA TCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCTCATATGTGTCGCAACGCTGG CATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAA TGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTTTATCT GGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCG TCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGA AACAGGATGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGACTCCTTCAAGGAG GACTGGGTCTCACAGGCTTTGACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGAAATT CCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGATCGGTTGCGTCGGTAT TGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTCTCCTCTTTGTGGCTG GAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACGCCTTTGCTGCAAATT TTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTATTTGCCTTCTCGTCTT CCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGACCAGTA GTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCTTCTCCT TTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGCTTTGTA CCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTGGCTCGT CAAGTGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATATA GCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGCT ACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAACT TGGTACGTCTCACTTGGTGAATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCC CAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAAT GCTGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATTCATGGACCGCTC TGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTC ATCTGGGGGTTGATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTC CCTTGCCGAGTTCTTGTCGGCCTATCCTACTGCTGGTGGACAATACCATT GGGTTGCAGTTATTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATT ACAGGATGGGCGAACGTGACTGGCTGGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGG TCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCT CATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAAC GTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGT TACTAAGGGTGCCTTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCA TCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTTCGTC TTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATGGCCTGATGGACTTGCTTGGCT GCTCGGACTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGACGGTGTCG CGCACATGATCGAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATC ATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGAT CGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGG CTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGT GCTATTTGCCTTCTCGTCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTAT CACGATCATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATG GCGGTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAG GTTCCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGG GTGTATTTTCCTTGGCTCGTCAAGTGCATTCAACGCTATTGTATCTGCAT CGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGC ATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGT TGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
KJC3_007562-T1.utr5p1 | KJC3_007562-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
KJC3_007562-T1.utr3p1 | KJC3_007562-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR002293 |
DBxref | PFAM:PF13520 |
DBxref | PFAM:PF00324 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch5 | supercontig | ch5:2802256..2805115 + |
|