|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:2427998..2430568- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_012052-T1 ID=KJC3_012052-T1|Name=KJC3_012052-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=2571bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:2427998..2430568- (Aspergillus niger KJC3)
GTCTCCACGCTCTTATCCGCCGCCATGGCTTTTTCGTTGCTTGCTGATAT
CTATCTATCGGTCGTATTGATTGCGACTAACCATGGCCCAGGGTTGCGCC
TAGTGCCCGAATGGGTGGAACCGGCCATGAATCAATGCAAGTGAGACCAT
GGCGTTTCATTCTGACTGGTATCATCGCCCTACTCCGACTATTCCCAGTA
CTATTTATCACTCCTGCATCCCCTCCCCTTCCCCCTGCAGTGGCTTGTTT
TGCTTTTTGAATTAGGCTCCATCGTCGTCTTCTTTTTCCCTTCGTCCCAT
AATTCCTTTTTTCCTCTCGATCGCTAGTGTCTAGAGATCCCCCCCGACTT
GCTGTCCATCTCTTGTTGCCTTAACCCATTAAAGGCCTCTGGGTCTACAC
GTCGACCCCATCTCGCGCCCTCTGCGGTCTACAGGGCTCCTGGTCTTAGT
GTGCTAGGTTTAGGAGTCACCTACACACTTTTATACACAGTTCTGGGCCT
TTCTTTGTCAGAAAGCTCAGTGTAATTAACCATGTCGGAATACCCTGTCG
CCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGAT
CTTAACATCTACTACAGCGTATGTCTTCCCTAGATATGTGACGCAGGCTA
TGACTGGGCTCATCCCCACTAACTGATTCCAGTCTGGAGATATCGCTTGG
GTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGGTA
TGATACCACCTGTCAACCTCCAAGCCATTGAGCCCCTCCAACTGACGGCA
ACAGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTA
ATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTT
CTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTG
ACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGC
AGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGC
TGCTATTACGTGAGTGTCCCCAAATCCGAAGCAACCTTCATGATTGATAA
CTGATAACGGAGATAGGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGC
GGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTAT
CTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACA
AACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCC
GGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACA
TGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCA
TTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCT
GCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCT
GGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGG
AGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTC
GTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCAT
CTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGT
ATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATT
GGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCGTAAGGCCC
CCTGATCTCTAAAGAAAACAGACAACCTCAAACCGGTGGGCACTCAACTA
ACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACG
GTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCA
GCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCA
TCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCC
GAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGC
CGTAAGTGCCTTCCCATATCATCGAAGTAAACGACTCTCCCTCTAACAAA
AACTAGTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAG
TCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACG
GCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGAACTATATTACCCAGTATA
GTACTATAGGAGTTATGTCGAGGGTGACCAATCATCTTCACTTCCTTCCT
AACTACAAGCCATGAACGAACACAACAACTTCATCAACTTTATTTGGATT
TAATTTTTACTTGATACCTATTTCGTTTCTGGTCATTTATGTCATAACTT
GGATACCTTCTGATGTACATATTATTCACTTTTCATTTGTCCTTACTTTC
TGACATCAACATAAGCTTCTCATATATTACCAAAATTCATCATATTATGC
ATTTACCTGAATGAATTCATG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:2427998..2430568- >KJC3_012052-T1 ID=KJC3_012052-T1|Name=KJC3_012052-T1|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=8640bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:2427998..2430568- (Aspergillus niger KJC3)
TACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGA
GAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACG
AAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGG
TTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTG
GCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGT
AGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCG
TATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTG
AATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCAT
GCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATC
CAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGT
GGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGC
TGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCC
ACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACC
GTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAG
CGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCT
CCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAG
TGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCAT
CACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAG
TTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTT
CGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCT
CGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTC
TCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCT
GTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTT
TTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGA
AGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATT
CTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATC
GCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGT
CGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGG
TGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACG
TGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGAC
GTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGT
GGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTC
ATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCT
GGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCA
TCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAA
GAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGG
TTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGC
ATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTG
CTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACT
TCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCA
TACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAA
CTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCT
GGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTG
CGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGG
TGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCG
TCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGC
TCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGC
CGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACG
ACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAAC
CTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACG
CAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGG
TGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACC
GCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTT
GGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTG
TCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTA
TCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGG
AATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCC
CTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCAC
CCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCA
AGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAG
GCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAG
GCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCC
ATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGT
CATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGA
TCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGC
TGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTA
GCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGG
AACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGG
TACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGA
TGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCG
CACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTG
GTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCA
TGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGG
TGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTG
CTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCG
TGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGC
AACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGA
TATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTG
GTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCA
TTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCA
ATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGT
ACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCT
TCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGG
AATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTAC
GGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGT
CGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAG
ATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTC
ATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCAT
GACTCCTCCCAACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGAC
TACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAA
CCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCA
TGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTG
ATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGT
CGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCA
GTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTG
GTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCG
GCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTC
CACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAA
GCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCA
CACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTC
AATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGT
TGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGG
ATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTC
ATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTG
GGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCA
CGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCA
GTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGC
TGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAA
TATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTC
TGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGA
CCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCA
GCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCT
GCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTG
TTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAAT
GGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACAT
CTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCA
CCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCC
AACGGCAACGAAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCC
ACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTAC
ATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTC
GTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTC
TTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCT
GAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAAC
GCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATT
ATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTA
CAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCT
CCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGA
CATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGT
CATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCT
CTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAAC
CTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACT
GGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTC
TCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTC
ATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAA
GTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCA
TTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTC
TACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTC
AATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACT
CGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAAT
TTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGT
CCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTC
TGGAGATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGA
TTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACA
ATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGC
TACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGA
GAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCTCCCAACGGCAACG
AAGAGTCCGTGGAGACAAAGGCTTGATGACTACATCGCCCACCTGGATGG
TTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTG
GCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGT
AGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCG
TATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTG
AATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCAT
GCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATC
CAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGT
GGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGC
TGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCC
ACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACC
GTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAG
CGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCT
CCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAG
TGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCAT
CACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAG
TTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTT
CGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCT
CGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTC
TCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCT
GTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTT
TTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGA
AGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATT
CTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATC
GCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGT
CGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGG
TGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGC back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016020 | membrane |
| GO:0005887 | integral component of plasma membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0008519 | ammonium transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0072488 | ammonium transmembrane transport |
| GO:0015696 | ammonium transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_012052-T1.utr3p1 | KJC3_012052-T1.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_012052-T1.utr5p1 | KJC3_012052-T1.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR018047 |
| DBxref | InterPro:IPR029020 |
| DBxref | InterPro:IPR001905 |
| DBxref | InterPro:IPR024041 |
| DBxref | InterPro:IPR002229 |
| DBxref | PFAM:PF00909 |
| Product | ammonium transporter Amt1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch8 | supercontig | ch8:2427998..2430568 - |
|
