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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch1:2738201..2740355+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_001057-T1 ID=KYF_001057-T1|Name=KYF_001057-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2155bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:2738201..2740355+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTTCAAGAGGTGTGTGATGATGTTCCCCCGGATCCCTCCTACAACCTT
TTATACATTTAGATAATTTTTTATCTACCTTTTAACCTTTTAGACGCTTC
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GGGAGGGCTGCTTTTGCCCGACCTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCA
GCCTAAGACCAATGGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGG
CCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGGT
ATGTCCCGGTCCCCCGTCCCAGAGAAAACCCTGCCGGCGGCTACGCGAAA
ATCTTTTCCGAGCCTCGATTCCATCCACAATCTCATCAAATTCGACTCAA
TGGCCATCAAAAGAACACGATATCTGACTCTCGCCAACAGTGAAGTTCGA
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GCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTGTATGTACACCAAAATCGAAGCTC
CAATGACATCAAGCTCTTATAGCTAACCCAATCTAGCAACACTTGGGTGA
GAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGGTAAGCTTTTCCCTCTCTCTC
TCTCATGACCATGAAATTCCAGAGTTGCTTGGCAATATCAACATATTGTC
ACCGCCTTCTCTCTACCTGGTCCTTCCACGTGTACTCGTCTCGCTGTGGC
TAACATCAATGTTCCTCACAGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCC
GCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCT
TGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCG
TCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTC
GAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGA
TCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTG
CCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTGTAAGTTTTGGC
AATCTTATCAAAAGAAATTCCATGTGACCCCGTAGAACTAACACATTTTC
TAGAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGT
CGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGA
CTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGT
CAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCTCGTGTCGCCCTTACCGGTCT
GACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCT
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CTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGT
CGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCA
TTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCT
GCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCG
TGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCA
AGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACC
GCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATAT
CATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCG
TCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTC
GCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACAC
CATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTG
AGGGTAAGTTAATTTATTCCCACTTTCTATTTGGTGACCAACATGGATGC
TAATTTGTTTCCTTCTCTACAGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGA
GTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGG
CCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch1:2738201..2740355+ >KYF_001057-T1 ID=KYF_001057-T1|Name=KYF_001057-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=10899bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:2738201..2740355+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTTCAAGAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCG ACCTACCTCCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTC CCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATT CACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCT CCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCG TCCTTGAGGTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCC ATGGACGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGG TGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTA ACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAG TTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGA GGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCT ACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAG ACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGG TTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATC 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GGCCTTCCCTCCCTGGCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGG AAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTG ACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAG AAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTAC CATTGCCATGGACGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTG ACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGT ATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGC CGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGT CCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTT GCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGT CGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTC ACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGT AACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGG TGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTG CCCGTGCTCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGT GACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTT CACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTG CCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAG CGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTA 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TTCCTGAGGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCC AAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTTCAA GAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGGCTGCTTTTGCCCGACCTACCT CCGTCGCCCGTCGCGCTTTCCAGCCTAAGACCAATGGCCTTCCCTCCCTG GCCCGTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGT CATTGGTGCCGTCGTCGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCA TTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAG GTTTCTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGG TACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCA TCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACT GGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCC CATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGA TTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGT GGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTT CATTCAGGAGCTGATTAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCG TCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCAC GAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGC CCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCTCGTGTCG CCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0045261 | proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0046034 | ATP metabolic process |
GO:1902600 | proton transmembrane transport |
GO:0015986 | ATP synthesis coupled proton transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0005524 | ATP binding |
GO:0046933 | proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09261T74 |
DBxref | InterPro:IPR027417 |
DBxref | InterPro:IPR036121 |
DBxref | InterPro:IPR020003 |
DBxref | InterPro:IPR004100 |
DBxref | InterPro:IPR000194 |
DBxref | InterPro:IPR005722 |
DBxref | InterPro:IPR024034 |
DBxref | InterPro:IPR003593 |
DBxref | PFAM:PF02874 |
DBxref | PFAM:PF00006 |
Product | beta subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase |
Product | atp2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch1 | supercontig | ch1:2738201..2740355 + |
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