|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch3:1836028..1837301+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_003554-T1 ID=KYF_003554-T1|Name=KYF_003554-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1274bp|location=Sequence derived from alignment at ch3:1836028..1837301+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCAT
TGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCC
CTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGT
GCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGGTACGATCTTCTTCATTCAGTCT
CCCCGGATTTCCCGTGTCAATCAAACATCAACTGACTCTCATCCGATATA
GCCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACTCCTT
TTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGGTATGTCCTCGGCTCC
ATCCGCCAAGATGACCGTCCGAATAACCTCAAAACTGACTGATTTGATAT
TAACAGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCG
CTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCT
GGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGC
TTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTA
GCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCT
GCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGG
CTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCG
CTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCTGGTGCTTCCCCTAGC
GGTGCCGCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGC
TGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCG
GAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTACACC
CCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGATCCC
CAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCCACCC
CCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGC
TCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGG
CACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACTGGCG
CCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGTCTTC
GCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch3:1836028..1837301+ >KYF_003554-T1 ID=KYF_003554-T1|Name=KYF_003554-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=3384bp|location=Sequence derived from alignment at ch3:1836028..1837301+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCAT
TGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCC
CTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGT
GCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGCCTACCACCGTCACCATCTCTGG
CACCCCCTACACCTACTCCACTCCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACT
GTGACAAGTGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGT
GCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGG
CTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCG
GTGCTTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCT
CCTAGCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGC
CGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCT
CTGGCTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCT
GGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCTGGTGCTTCCCC
TAGCGGTGCCGCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCG
GTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCC
AGCGGAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTA
CACCCCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGA
TCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCC
ACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTC
CGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTG
CTGGCACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACT
GGCGCCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGT
CTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAAATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTG
TCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGGTGCCATTGCTACCGAGTACAAGACCGTC
TATGTCACCGAGTACACCACCGTTTGCCCTAAGGCCACCTCTCTGGCCAC
TGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGCTCGGGTGCCCAGACTACCCCGGCTGCTG
CTCAGCCTACCACCGTCACCATCTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACT
CCTTTTGTCACCTCGACCGTGACCCACTGTGACAAGTGCTCCGCTACCGC
CGCCCCTGCCACCTCCACCCCCAACGGTGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTG
CCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCC
AGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCGGCTCCGGTGCTTCTCCTAGCGAGGGTGC
CAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGCGCTTCTCCTAGCGGTGCTGCCGCTGGCT
CCGGCTCTGGATCTTCCCCCAGCGGCGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCC
TCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCCCCTCCCCCAG
TGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTG
CCACTGGCTCCGGCTCTGGTGCTTCCCCTAGCGGTGCCGCCGCTGGCTCT
GGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCCCCAGCGGTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGC
TGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCTGGTCCCAGCGGAGCCGGTGCCATTGGAA
TCGGCGCCACCACCCCGGTCGTCTCTTACACCCCGGTCCCCACCCCTAGC
GGCTTCCACCCCTCCTCTCGCCCTCTGATCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTC
CTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCCAGCGCCACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCG
CCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAGCTCTTCCGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCC
GCTACCTCCCCCGAGGGTGTCTCCGCTGCTGGCACTGGCTCTGGCTCCGC
CACCACTCCCTCCGCCCCTGTCTTCACTGGCGCCGCTACCCGCGCCGCGG
CTGGTGCTGGTGCCGGATTGGCCTCCGTCTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTT
CTGTAAATGCGTGTCGCTTCCGCTGCTGTCGTTGCCTCCCTGGCTGCCGG
TGCCATTGCTACCGAGTACAAGACCGTCTATGTCACCGAGTACACCACCG
TTTGCCCTAAGGCCACCTCTCTGGCCACTGGTCCTGGTGCCGGTTCTGGC
TCGGGTGCCCAGACTACCCCGGCTGCTGCTCAGCCTACCACCGTCACCAT
CTCTGGCACCCCCTACACCTACTCCACTCCTTTTGTCACCTCGACCGTGA
CCCACTGTGACAAGTGCTCCGCTACCGCCGCCCCTGCCACCTCCACCCCC
AACGGTGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGG
CTCTGGCTCTGGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCTCCGGCTCCG
GCTCCGGTGCTTCTCCTAGCGAGGGTGCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGC
GCTTCTCCTAGCGGTGCTGCCGCTGGCTCCGGCTCTGGATCTTCCCCCAG
CGGCGCCGCTGCTGTCGGTACCGGTGCCTCCCCCAGTGAGGCTCCTGGCT
CTGGCTCTGGCTCTGGCCCCTCCCCCAGTGAAGCTGCCGGCTCTGGCTCT
GGCTCTGGCGCTTCCCCCAGCGAGGGTGCCACTGGCTCCGGCTCTGGTGC
TTCCCCTAGCGGTGCCGCCGCTGGCTCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCTCCC
CCAGCGGTGCTGCCGCTGGTTCCGGAGCTGGTTCCGCCGGTGCTTCCGCT
GGTCCCAGCGGAGCCGGTGCCATTGGAATCGGCGCCACCACCCCGGTCGT
CTCTTACACCCCGGTCCCCACCCCTAGCGGCTTCCACCCCTCCTCTCGCC
CTCTGATCCCCAGCAGCAAGCCCGCTTCCTCCAAGCTTGTTGCTTCCTCC
AGCGCCACCCCCGCTGCCTCTAGCGCCGCCCCTGCCAGTTCTTCCTCCAG
CTCTTCCGGCTCTAGCTCCGGCTCCTCCGCTACCTCCCCCGAGGGTGTCT
CCGCTGCTGGCACTGGCTCTGGCTCCGCCACCACTCCCTCCGCCCCTGTC
TTCACTGGCGCCGCTACCCGCGCCGCGGCTGGTGCTGGTGCCGGATTGGC
CTCCGTCTTCGCTCTCGTCGCCTTCCTTCTGTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch3 | supercontig | ch3:1836028..1837301 + |
|
