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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:586034..587435+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_004464-T1 ID=KYF_004464-T1|Name=KYF_004464-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1402bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:586034..587435+ (Aspergillus niger KYF3) ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTC
TGCTCAGCACCACCACCAGCACCGCCATCACCACAAGCGCTCCCCCGACA
CCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGAC
GGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGAGGGTGTCGCCAAGGGTAC
TTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTT
CGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTTCAG
GCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCAAGCAGCTC
CAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAGACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCT
CCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACC
GGCGTGGACAAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTCCC
CTCTGAATACGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGT
CCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGACACCATCGTT
ACCGGTGTCACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTATGC
CTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCGCCCAGGGTTCTA
CCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTT
ACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGT
CCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACT
ACCCTGGTAAGCATTGAACTTTCCTTCCGACAGGTGGGTCCAAACAAAGA
TATTAATTCTGTATGCAGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTC
GCTGCCAACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTA
CTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCA
AGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCGCTCCT
ATCGGTAACTGGGCTCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAA
GTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACT
TCAACGTGAAGATCTCGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAG
GACGGTACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGT
AAGTGCCCTTGCGTTTGTTTTTTGGCTGGGACTTTTCGCTGATCATCATC
TCCTCTCCAGGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACT
AA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:586034..587435+ >KYF_004464-T1 ID=KYF_004464-T1|Name=KYF_004464-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=3834bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:586034..587435+ (Aspergillus niger KYF3) ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTC TGCTCAGCACCACCACCAGCACCGCCATCACCACAAGCGCTCCCCCGACA CCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGAC GGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGAGGGTGTCGCCAAGGGTAC TTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTT CGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTTCAG GCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCAAGCAGCTC CAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAGACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCT CCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACC GGCGTGGACAAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTCCC CTCTGAATACGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGT CCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGACACCATCGTT ACCGGTGTCACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTATGC CTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCGCCCAGGGTTCTA CCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTT ACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGT CCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACT ACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGCCAACAGC GAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACAAGTGGGA GAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCAAGGGTGTTTCCA CCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCGCTCCTATCGGTAACTGG GCTCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGCTTTCTCT GTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACTTCAACGTGAAGA TCTCGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGGTACCTTC TACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGGTTCTCTC CGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAAATGAAGTTCAATACTGTCGCCC TCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTCTGCTCAGCACCACCACCAGCAC CGCCATCACCACAAGCGCTCCCCCGACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGG CCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGACGGCAAGGTCATTACCTTCGAGG AGGCCTGCGAGGGTGTCGCCAAGGGTACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTG CCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCAC CAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTTCAGGCTGCTGCTGAGTTCATCGAGG TCGCCGTCAACAAGCACTCAAGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCAGCACC AAGACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCTCCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAG CTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACCGGCGTGGACAAGGAGTTCCCCG ATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTCCCCTCTGAATACGGTGCCGTTGCC CTCGACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCAT CGTCGACGAGATTGTCGACACCATCGTTACCGGTGTCACCGGCGACTCCT GCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAG TCCCAGTGGCCCAGCGCCCAGGGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTAT TGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTTACCAACAAGTCTCTGTCCAAGA AGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGC GAGGAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGAC CATCCCTCTCGCTGTCGCTGCCAACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCC CCAACGGCGCCACCTACTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAG TACTATGTTAACCCCAAGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGG TAACGGCAGCGCTCCTATCGGTAACTGGGCTCCTATCAACCTTGGTGTCG GTTACAACGATGGCAAGTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACC ACCACCAAGCTTGACTTCAACGTGAAGATCTCGGGTGACAACCTCAGCGG TTCTTGCAAGTACGAGGACGGTACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACG ACTCCGGTTGCACTGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTC TACTAAATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCAT GGTGTCTGCTCAGCACCACCACCAGCACCGCCATCACCACAAGCGCTCCC CCGACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTT CTCGACGGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGAGGGTGTCGCCAA GGGTACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCT CCTCTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCC GTTCAGGCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCAAG CAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAGACCAGCAGCTCGTACGCCG CTGCCTCCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCT GCCACCGGCGTGGACAAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACAC CTTCCCCTCTGAATACGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCCTTGGTG GTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGACACC ATCGTTACCGGTGTCACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTC CTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCGCCCAGG GTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTC CACCTTACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGG AGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTTGCCGTA CCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGCC AACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACAA GTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCAAGGGTG TTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCGCTCCTATCGGT AACTGGGCTCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGCT TTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACTTCAACG TGAAGATCTCGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGGT ACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGGT TCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
Note | CAZy:GH132 |
DBxref | InterPro:IPR005556 |
DBxref | PFAM:PF03856 |
Product | Secreted beta-glucosidase sun1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch4 | supercontig | ch4:586034..587435 + |
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