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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:4828025..4831023+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_005789-T1 ID=KYF_005789-T1|Name=KYF_005789-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2999bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4828025..4831023+ (Aspergillus niger KYF3) ATGGTTAAGTACGTTCACCCACACACACACCACCGGGCAGTCCCTCTGTC
AATCCCTATGGCTATGATATCCCATCGCATAGAGAGATCAAGGGCTCTGT
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CACTATCGAAGAGGTCCGTTCTATATTCCCCGCATCAACCTGCCTCGGGC
TGCTCCTCAACACCTAGGAGGGCAACACCGGCCCAGAATCGGGAAAAGCA
ATCAGTGAATGAAGATGGAAGTGTACTAATGCTGGAAATAGATCCGCGGC
CTGATGGACCGCCCGGCCAACATCCGTAACATGTCCGTCATTGCTCACGG
TATGTACTTACTACAAGGCTTGGCATCATGGATGGCCAGGTGTATCTTGA
ATGAATCTTGCTGACTCGCAACGATAGTCGATCACGGAAAGTCCACCCTT
TCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCGGTATTATCTCGGCTGCTAAGGCTGG
TGAGGGTCGTTACATGGACACCCGTCCCGATGAGCAGGACCGTGGTATCA
CCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACGCCAAGTTCCCCGATGAGGAG
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CCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTTCTCCTCTGAGGTCACTGCTG
CTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCGTCGTCGACTGTGTCTCCGGT
GTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCCTTCGTCAGGCCCTGACCGAGCGTAT
CAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAGGTCGACCGTGCTCTGCTCGAACTCC
AGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCTTCTCTCGTACCATCGAGTCC
GTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGACAAGGCTCTTGGTGATGTCCA
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GGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGCCGTCAAGTTCGCCAAGAAGTTCGGT
GTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGCGTCTCTGGGTATGGAACCATCAATC
AACCTTCTAGTATCTGAATGCAGCTAACATCCGTGATAGGGTGACAACTA
CTTCAACCCCGCCACCAAGAAGTGGACCAAGACCCAGCCCGAGGTCAACG
GCAAGCCCGTCGAGCGTGCCTTCAACATGTTCGTTCTGGACCCCATCTTC
AAGATCTTCCAGACCATCAACAACGACAAGAAGGACCAGATCCCCACTCT
CCTTGAGAAGCTTGAGGTCAAGCTTTCCAACGACGAGAAGGACCTTGCTG
GCAAGCAGCTCCTCAAGGCTGTCATGCGCAAGTTCCTCCCCGCTGCTGAT
GCCATGTTGGAGATGATCTGTATCCACCTTCCCTCCCCCGTTACTGCCCA
GAAGTACCGTGGTGAGACTCTCTACGAGGGTCCTTCCGACGACGACTGCG
CCGTCGGTATCCGCGACTGTGACCCCAAGGCTCCTCTGATGCTTTACGTC
TCCAAGATGGTTCCCACCTCCGACAAGGGTCGTTTCTACGCTTTCGGTCG
TGTCTACTCCGGTACCGTCCGCTCCGGTCTTAAGGTCCGTATCCAGGGTC
CCAACTACGTCCCTGGCAAGAAGGAGGACCTGTTCGTCAAGAACATCCAA
CGTACTATCCTGATGATGGGTCGTTTCGTCGAGCCCATTGAGGATGTTCC
CGCCGGTAACATCGTCGGTCTGGTCGGTGTTGACCAGTTCCTGCTCAAGT
CTGGTACCCTCACCACCTCCGAGACTGCCCACAACATGAAGGTCATGAAG
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CTTGTGTCCTGACCATGATCAACGAGTCCGGTGAGCACGTCGTTGCCGGT
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CACAACCGTCTGTACCTCACTGCCCAGCCCCTTGACGAGGAGGTCTCCCT
GGCCATTGAGGCTGGCAAGATCACCCCCCGTGACGATTTCAAGGCTCGTG
CCCGTCTCCTTGCTGACGAGTACGGCTGGGATGTCACCGATGCCCGTAAG
ATTTGGTGCTTCGGTCCCGACACCACCGGTGCCAACTTGCTGGTTGACCA
GACCAAGGCCGTCCAGTACCTCAACGAAATCAAGGATTCCTTCGTCTCTG
GTTTCCAGTGGGCTACTCGTGAGGGTCCTATTGCTGAGGAGCCCATGCGC
TCTATCCGCTTCAACATCCTTGATGTTACTCTGCACGCTGATGCTATTCA
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CTACCATGCTTGCCGACCCCGGCATCCTGGAGCCCATCTTCAACGTCGAG
ATCCAGGTCCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTATCTACGGTGTCCTTACCCG
TCGTCGTGGTCACGTCTACACCGAGGAGCAGCGCCCTGGTACTCCTCTCT
TCAACGTCAAGGCCTACCTGCCCGTCAACGAGTCCTTCGGTTTCCCCGGC
GAGCTTCGTCAGGCCACCGGTGGACAGGCCTTCCCCCAGTCTGTCTTCGA
CCACTGGGCCGTCCTTCCTGGTGGATCTCCTCTTGACACCACCAGCAAGC
CTGGTCAGATCGTTGCTGAGATGCGTAAGCGCAAGGGTCTCAAGGAGCAG
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AAGAGTATCTGAAGCTAACATGTGTGAACAGTACTACGACAAGCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:4828025..4831023+ >KYF_005789-T1 ID=KYF_005789-T1|Name=KYF_005789-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=15210bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:4828025..4831023+ (Aspergillus niger KYF3) ATGGTTAACTTCACTATCGAAGAGATCCGCGGCCTGATGGACCGCCCGGC CAACATCCGTAACATGTCCGTCATTGCTCACGTCGATCACGGAAAGTCCA CCCTTTCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCGGTATTATCTCGGCTGCTAAG GCTGGTGAGGGTCGTTACATGGACACCCGTCCCGATGAGCAGGACCGTGG TATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACGCCAAGTTCCCCGATG AGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGGTCGATGGCTCTGAGTTCCTG ATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTTCTCCTCTGAGGTCAC TGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCGTCGTCGACTGTGTCT CCGGTGTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCCTTCGTCAGGCCCTGACCGAG CGTATCAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAGGTCGACCGTGCTCTGCTCGA ACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCTTCTCTCGTACCATCG AGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGACAAGGCTCTTGGTGAT GTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTTGCCTTCGGTTCCGGTCTCCA CGGCTGGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGCCGTCAAGTTCGCCAAGAAGT TCGGTGTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGCGTCTCTGGGGTGACAACTAC TTCAACCCCGCCACCAAGAAGTGGACCAAGACCCAGCCCGAGGTCAACGG CAAGCCCGTCGAGCGTGCCTTCAACATGTTCGTTCTGGACCCCATCTTCA AGATCTTCCAGACCATCAACAACGACAAGAAGGACCAGATCCCCACTCTC CTTGAGAAGCTTGAGGTCAAGCTTTCCAACGACGAGAAGGACCTTGCTGG CAAGCAGCTCCTCAAGGCTGTCATGCGCAAGTTCCTCCCCGCTGCTGATG CCATGTTGGAGATGATCTGTATCCACCTTCCCTCCCCCGTTACTGCCCAG AAGTACCGTGGTGAGACTCTCTACGAGGGTCCTTCCGACGACGACTGCGC CGTCGGTATCCGCGACTGTGACCCCAAGGCTCCTCTGATGCTTTACGTCT CCAAGATGGTTCCCACCTCCGACAAGGGTCGTTTCTACGCTTTCGGTCGT GTCTACTCCGGTACCGTCCGCTCCGGTCTTAAGGTCCGTATCCAGGGTCC CAACTACGTCCCTGGCAAGAAGGAGGACCTGTTCGTCAAGAACATCCAAC GTACTATCCTGATGATGGGTCGTTTCGTCGAGCCCATTGAGGATGTTCCC GCCGGTAACATCGTCGGTCTGGTCGGTGTTGACCAGTTCCTGCTCAAGTC TGGTACCCTCACCACCTCCGAGACTGCCCACAACATGAAGGTCATGAAGT TCTCCGTCTCCCCCGTCGTCCAGCGTTCCGTTGAGGTCAAGAACGCCCAG GATCTGCCCAAGCTGGTCGAAGGTCTCAAGCGTCTGTCCAAGTCTGACCC TTGTGTCCTGACCATGATCAACGAGTCCGGTGAGCACGTCGTTGCCGGTG 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CCGACACCACCGGTGCCAACTTGCTGGTTGACCAGACCAAGGCCGTCCAG TACCTCAACGAAATCAAGGATTCCTTCGTCTCTGGTTTCCAGTGGGCTAC TCGTGAGGGTCCTATTGCTGAGGAGCCCATGCGCTCTATCCGCTTCAACA TCCTTGATGTTACTCTGCACGCTGATGCTATTCACCGTGGTGGTGGTCAG ATCATCCCCACTGCTCGTCGTGTCCTGTATGCTGCTACCATGCTTGCCGA CCCCGGCATCCTGGAGCCCATCTTCAACGTCGAGATCCAGGTCCCCGAGC AGGCCATGGGTGGTATCTACGGTGTCCTTACCCGTCGTCGTGGTCACGTC TACACCGAGGAGCAGCGCCCTGGTACTCCTCTCTTCAACGTCAAGGCCTA CCTGCCCGTCAACGAGTCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGCTTCGTCAGGCCA CCGGTGGACAGGCCTTCCCCCAGTCTGTCTTCGACCACTGGGCCGTCCTT CCTGGTGGATCTCCTCTTGACACCACCAGCAAGCCTGGTCAGATCGTTGC TGAGATGCGTAAGCGCAAGGGTCTCAAGGAGCAGGTTCCTGGCTACGAGA ACTACTACGACAAGCTGTAAATGGTTAACTTCACTATCGAAGAGATCCGC GGCCTGATGGACCGCCCGGCCAACATCCGTAACATGTCCGTCATTGCTCA CGTCGATCACGGAAAGTCCACCCTTTCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCG GTATTATCTCGGCTGCTAAGGCTGGTGAGGGTCGTTACATGGACACCCGT CCCGATGAGCAGGACCGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCT CTACGCCAAGTTCCCCGATGAGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGG TCGATGGCTCTGAGTTCCTGATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTT GATTTCTCCTCTGAGGTCACTGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCT GGTCGTCGTCGACTGTGTCTCCGGTGTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCC TTCGTCAGGCCCTGACCGAGCGTATCAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAG GTCGACCGTGCTCTGCTCGAACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCA GTCCTTCTCTCGTACCATCGAGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACT TCGACAAGGCTCTTGGTGATGTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTT GCCTTCGGTTCCGGTCTCCACGGCTGGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGC CGTCAAGTTCGCCAAGAAGTTCGGTGTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGC GTCTCTGGGGTGACAACTACTTCAACCCCGCCACCAAGAAGTGGACCAAG ACCCAGCCCGAGGTCAACGGCAAGCCCGTCGAGCGTGCCTTCAACATGTT CGTTCTGGACCCCATCTTCAAGATCTTCCAGACCATCAACAACGACAAGA AGGACCAGATCCCCACTCTCCTTGAGAAGCTTGAGGTCAAGCTTTCCAAC GACGAGAAGGACCTTGCTGGCAAGCAGCTCCTCAAGGCTGTCATGCGCAA GTTCCTCCCCGCTGCTGATGCCATGTTGGAGATGATCTGTATCCACCTTC CCTCCCCCGTTACTGCCCAGAAGTACCGTGGTGAGACTCTCTACGAGGGT CCTTCCGACGACGACTGCGCCGTCGGTATCCGCGACTGTGACCCCAAGGC TCCTCTGATGCTTTACGTCTCCAAGATGGTTCCCACCTCCGACAAGGGTC GTTTCTACGCTTTCGGTCGTGTCTACTCCGGTACCGTCCGCTCCGGTCTT AAGGTCCGTATCCAGGGTCCCAACTACGTCCCTGGCAAGAAGGAGGACCT GTTCGTCAAGAACATCCAACGTACTATCCTGATGATGGGTCGTTTCGTCG AGCCCATTGAGGATGTTCCCGCCGGTAACATCGTCGGTCTGGTCGGTGTT GACCAGTTCCTGCTCAAGTCTGGTACCCTCACCACCTCCGAGACTGCCCA CAACATGAAGGTCATGAAGTTCTCCGTCTCCCCCGTCGTCCAGCGTTCCG TTGAGGTCAAGAACGCCCAGGATCTGCCCAAGCTGGTCGAAGGTCTCAAG CGTCTGTCCAAGTCTGACCCTTGTGTCCTGACCATGATCAACGAGTCCGG TGAGCACGTCGTTGCCGGTGCTGGTGAGCTTCACCTGGAAATTTGCCTGA AGGATCTCGAGGAGGACCACGCTGGTGTTCCCCTTCGTATCTCCGACCCT GTCGTCTCCTACCGTGAGACCGTCAGCGGCACTTCCAGCATGACTGCTCT GTCCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGTCTGTACCTCACTGCCCAGCCCC TTGACGAGGAGGTCTCCCTGGCCATTGAGGCTGGCAAGATCACCCCCCGT GACGATTTCAAGGCTCGTGCCCGTCTCCTTGCTGACGAGTACGGCTGGGA TGTCACCGATGCCCGTAAGATTTGGTGCTTCGGTCCCGACACCACCGGTG CCAACTTGCTGGTTGACCAGACCAAGGCCGTCCAGTACCTCAACGAAATC AAGGATTCCTTCGTCTCTGGTTTCCAGTGGGCTACTCGTGAGGGTCCTAT TGCTGAGGAGCCCATGCGCTCTATCCGCTTCAACATCCTTGATGTTACTC TGCACGCTGATGCTATTCACCGTGGTGGTGGTCAGATCATCCCCACTGCT CGTCGTGTCCTGTATGCTGCTACCATGCTTGCCGACCCCGGCATCCTGGA GCCCATCTTCAACGTCGAGATCCAGGTCCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTA TCTACGGTGTCCTTACCCGTCGTCGTGGTCACGTCTACACCGAGGAGCAG CGCCCTGGTACTCCTCTCTTCAACGTCAAGGCCTACCTGCCCGTCAACGA GTCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGCTTCGTCAGGCCACCGGTGGACAGGCCT TCCCCCAGTCTGTCTTCGACCACTGGGCCGTCCTTCCTGGTGGATCTCCT CTTGACACCACCAGCAAGCCTGGTCAGATCGTTGCTGAGATGCGTAAGCG CAAGGGTCTCAAGGAGCAGGTTCCTGGCTACGAGAACTACTACGACAAGC TGTAAATGGTTAACTTCACTATCGAAGAGATCCGCGGCCTGATGGACCGC CCGGCCAACATCCGTAACATGTCCGTCATTGCTCACGTCGATCACGGAAA GTCCACCCTTTCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCGGTATTATCTCGGCTG CTAAGGCTGGTGAGGGTCGTTACATGGACACCCGTCCCGATGAGCAGGAC CGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACGCCAAGTTCCC CGATGAGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGGTCGATGGCTCTGAGT TCCTGATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTTCTCCTCTGAG GTCACTGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCGTCGTCGACTG TGTCTCCGGTGTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCCTTCGTCAGGCCCTGA CCGAGCGTATCAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAGGTCGACCGTGCTCTG CTCGAACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCTTCTCTCGTAC CATCGAGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGACAAGGCTCTTG GTGATGTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTTGCCTTCGGTTCCGGT 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TGGTATCTACGGTGTCCTTACCCGTCGTCGTGGTCACGTCTACACCGAGG AGCAGCGCCCTGGTACTCCTCTCTTCAACGTCAAGGCCTACCTGCCCGTC AACGAGTCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGCTTCGTCAGGCCACCGGTGGACA GGCCTTCCCCCAGTCTGTCTTCGACCACTGGGCCGTCCTTCCTGGTGGAT CTCCTCTTGACACCACCAGCAAGCCTGGTCAGATCGTTGCTGAGATGCGT AAGCGCAAGGGTCTCAAGGAGCAGGTTCCTGGCTACGAGAACTACTACGA CAAGCTGTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0005525 | GTP binding |
GO:0003924 | GTPase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR035647 |
DBxref | InterPro:IPR020568 |
DBxref | InterPro:IPR009000 |
DBxref | InterPro:IPR027417 |
DBxref | InterPro:IPR031157 |
DBxref | InterPro:IPR014721 |
DBxref | InterPro:IPR005225 |
DBxref | InterPro:IPR041095 |
DBxref | InterPro:IPR004161 |
DBxref | InterPro:IPR005517 |
DBxref | InterPro:IPR000640 |
DBxref | InterPro:IPR000795 |
DBxref | PFAM:PF03144 |
DBxref | PFAM:PF00009 |
DBxref | PFAM:PF03764 |
DBxref | PFAM:PF14492 |
DBxref | PFAM:PF00679 |
Product | Elongation factor 2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch4 | supercontig | ch4:4828025..4831023 + |
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