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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch5:1730593..1732376+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_006772-T1 ID=KYF_006772-T1|Name=KYF_006772-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1784bp|location=Sequence derived from alignment at ch5:1730593..1732376+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTC
CGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAGTGTA
TGTGATGTTTGTCCGAGTTTTCGTTGTACCACTCTAACAGAAGTAGGGGT
TGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCC
TGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGA
AACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGAC
TCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGA
AGTCGGTATGTTATCGCTCATGCCCCTGATATTGTTGGTCGTTGCAACAC
TAACTGGTTACATAGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGC
TGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGTAAGTGGATACAGTTGGAT
GAGAAAGGTGGCATATGATGGCTAACAGCCTGCAGTGATGGAAGCATCAT
TACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAAT
TTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAGTGAGTAGACCTTTTAC
TATACCATTTATACAAAGAGATAACTAATGGAAATAGACAACGAGTACCA
TGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACG
GTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACACAGTACATCTTCGTCGAGGGTAAC
GCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCGGG
CCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTG
ACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGC
CAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCA
GGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGG
CTGTTGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTT
GGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTC
TCTGGAGCCCACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCG
AGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTC
TCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGA
GCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTT
CCTCTTCGGCCAGCGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCC
AAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTTTCCAGCGCCACCTCCAGCGCCGTCCC
CAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCG
TCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTCACCACTTCCGTTTACGTT
CCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGC
TGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCCCAGGGTCCCTCGG
CTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATC
AACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCA
GAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch5:1730593..1732376+ >KYF_006772-T1 ID=KYF_006772-T1|Name=KYF_006772-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=7830bp|location=Sequence derived from alignment at ch5:1730593..1732376+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTC
CGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAGTGGG
TTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACC
CTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAG
AAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGA
CTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTG
AAGTCGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGA
CCCCCACAACTACGGACGTTTTGATGGAAGCATCATTACTTCCACCTCCG
ACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATTTGCCGACAACGAC
AAGGTCATCTTCGATACCAACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCT
GGTTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTG
CCACCACACAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGG
GACTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCGGGCCTGACCGACAGCGAGGA
CAAGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTA
CTTCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAG
GCCACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATT
CGCCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTTGAGGGTATGCTCG
CGTACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCT
GCCGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCCACCGATGG
CACCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCG
GTGATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACC
TCCACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGC
CACCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAGCGCCG
CCAGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGC
AAGCTTTCCAGCGCCACCTCCAGCGCCGTCCCCAGCGCTGTCGCTGCCAC
CACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCA
GCGTCGCTTTCGTCACCACTTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTGCTGCC
GTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGT
CGTCGGTGTCAGCGACCCCCAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGGTG
AGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTACC
GTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTACTACCA
GTGCGTTGCTGAGTAAATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTG
CCGCCAGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGAC
TCTGGCTTCAAGTGGGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTC
CGCCCTCCCCGGCACCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCA
AGATCCAGGTCCTGAGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTC
CTCATGGAGCGTTTGACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGAC
TTACCTCTCTGACCTGAAGTCGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTG
CCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTTGATGGAAGCATC
ATTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGA
ATTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACAACGAGTACCATG
ACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGGT
ATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACACAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACGC
CTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCGGGCC
TGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGAC
TCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCCA
GGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAGG
GTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCT
GTTGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTGG
TGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCTC
TGGAGCCCACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGAG
AAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTC
CGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAGC
AGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCC
TCTTCGGCCAGCGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAA
GTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTTTCCAGCGCCACCTCCAGCGCCGTCCCCA
GCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCGTC
GCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTCACCACTTCCGTTTACGTTCC
CACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTG
CTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCCCAGGGTCCCTCGGCT
ACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAA
CTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGA
ACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAAATGAGAATTAGCAACTTG
ATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCA
GATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAGTGGGTTGGTACTAGTGAATCCG
GCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCCTGGGAACCGACTACACC
TGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGAAACAAGGGCATGAACAT
CTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGACTCCCGATGGCTTGACCA
GCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGAAGTCGACTGTCGAATTC
GTTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACG
TTTTGATGGAAGCATCATTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGA
AGAACGTCGCTACCGAATTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACC
AACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCA
GGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACACAGTACATCT
TCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAAC
GACAACCTGTCGGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGAT
GCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCA
GCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAG
ACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTC
CGTGTGTGAGGAGGCTGTTGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACT
CCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGA
ACCTACATGTACTCTCTGGAGCCCACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTA
CCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCA
GCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACC
ACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGC
CTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAGCGCCGCCAGCCAGACTACTCTCA
GCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTTTCCAGCGCCACC
TCCAGCGCCGTCCCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGC
CACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTCACCA
CTTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTT
AGCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCC
CCAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACC
AGTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTAC
ACCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAAAT
GAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTCCG
CTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAGTGGGTT
GGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCCT
GGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGAA
ACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGACT
CCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGAA
GTCGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACC
CCCACAACTACGGACGTTTTGATGGAAGCATCATTACTTCCACCTCCGAC
TTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATTTGCCGACAACGACAA
GGTCATCTTCGATACCAACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGG
TTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCC
ACCACACAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGA
CTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCGGGCCTGACCGACAGCGAGGACA
AGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACT
TCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGC
CACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCG
CCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTTGAGGGTATGCTCGCG
TACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGC
CGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCCACCGATGGCA
CCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGT
GATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTC
CACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCA
CCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAGCGCCGCC
AGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAA
GCTTTCCAGCGCCACCTCCAGCGCCGTCCCCAGCGCTGTCGCTGCCACCA
CCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCAGC
GTCGCTTTCGTCACCACTTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTGCTGCCGT
TGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCG
TCGGTGTCAGCGACCCCCAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGGTGAG
GTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTACCGT
CTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTACTACCAGT
GCGTTGCTGAGTAAATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCC
GCCAGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTC
TGGCTTCAAGTGGGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCG
CCCTCCCCGGCACCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAG
ATCCAGGTCCTGAGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCT
CATGGAGCGTTTGACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTT
ACCTCTCTGACCTGAAGTCGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCC
TACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTTGATGGAAGCATCAT
TACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAAT
TTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACAACGAGTACCATGAC
ATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGGTAT
CCGTGCCGCTGGTGCCACCACACAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACGCCT
ACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCGGGCCTG
ACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGACTC
CGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCCAGG
AGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAGGGT
ATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCTGT
TGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTGGTG
CTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCTCTG
GAGCCCACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGAGAA
GTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTCCG
TTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAGCAG
ACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCCTC
TTCGGCCAGCGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAAGT
CCAAGTCCCCTTGCAAGCTTTCCAGCGCCACCTCCAGCGCCGTCCCCAGC
GCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCGTCGC
CCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTCACCACTTCCGTTTACGTTCCCA
CCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTGCT
AGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCCCAGGGTCCCTCGGCTAC
CAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAACT
GGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGAAC
GACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005576 | extracellular region |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0004553 | hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds |
| GO:0030248 | cellulose binding |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005975 | carbohydrate metabolic process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
| Note | CAZy:GH5 |
| Note | CAZy:GH5_5 |
| DBxref | InterPro:IPR035971 |
| DBxref | InterPro:IPR017853 |
| DBxref | InterPro:IPR001547 |
| DBxref | InterPro:IPR000254 |
| DBxref | PFAM:PF00150 |
| DBxref | PFAM:PF00734 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch5 | supercontig | ch5:1730593..1732376 + |
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