|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch7:1119635..1120702+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_009092-T1 ID=KYF_009092-T1|Name=KYF_009092-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1068bp|location=Sequence derived from alignment at ch7:1119635..1120702+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTA
CGCTGGTTAGTAGTTGCTTTGGGAAGGAAACGCCTTGGCCCATCCTGGAA
TTTACTAACGGGCTGAGGTAGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGC
TACAACTGTGAGTAGACCCTGTTCATTGGCAGCTTATTCGTTGCGTATCA
TTTGCTGATATAATTACGCTGTTCAACAGGCAAGCAGCCTGGTAGGTCCC
TTCTGTGTGTCACGTCGCTCGAACAATATCTCTGATCGATCAATCGACAG
GCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGAGTAAGGTT
TTCGGTCCTCGTGGCTGCAACGCACCGGAATGCTGATATATCTCCGATCC
AGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATT
GTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGC
CAGCCCGGTCACCTTGCCGTACGTTTTCTCGTCGATCCCAGCTTATTGCT
TTCCGGGCAAAATCGTTGTTGACCTTCTCCTAGCGCAACTGCCCCGCTCC
TGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCG
GTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGC
GGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTG
CTACGCCTGTGGCAAGCTGGTAGGTGTTCTTGTCATACTTGATCCGATAC
GAACGTTGAGGCTTATCTGAATCTATAGGGTCACATCTCCCGCGAATGCA
CTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAG
TGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGT
CGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCG
CCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCT
ACTACCGCTGTCGCATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch7:1119635..1120702+ >KYF_009092-T1 ID=KYF_009092-T1|Name=KYF_009092-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=4809bp|location=Sequence derived from alignment at ch7:1119635..1120702+ (Aspergillus niger KYF3) ATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTA CGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGC CTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAG CAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTAC GTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCG GTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCC CCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATA CCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCC GTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGT CACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGC CGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACT GCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCC CCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCC CGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTC GTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGC TCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTC CAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACT GCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAAC GGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCG CAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCG GCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCT ACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGC TCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCG AATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGC TACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGA GGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTG CCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCG GCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTA CAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGC GTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCG CGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGG CCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCC GCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCT CCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAG CGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGT GCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAG TGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCC CAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCC AGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAG CAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGC CGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCG CTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAAC ATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAA CTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGA CTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCC GATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTG CAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTG CTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGT GGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAA CCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTG GCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCC CTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACAT CTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATG CCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCG GAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGAT GTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACG CTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCT GGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCA ATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGT TGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGT CACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCC TGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACC CCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGT GATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCA CATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCG GCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGC CCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCC TGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCG TTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGT CGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTC TTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCA GCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGC CAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGG TGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCA ACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGC GGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTAC TTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTC AGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAA TGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTA CAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGG CCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCC GCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGC TCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACA AGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGT CTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCG TCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCC ACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGC TGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCC TGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCG GTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGC GGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTG CTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCA ACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAG GCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCA GCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCG AGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCT GTCGCATAG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003676 | nucleic acid binding |
GO:0008270 | zinc ion binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036875 |
DBxref | InterPro:IPR001878 |
DBxref | PFAM:PF13917 |
DBxref | PFAM:PF00098 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch7 | supercontig | ch7:1119635..1120702 + |
|