You are here

KYF_009092-T1, KYF_009092-T1 (mRNA) Aspergillus niger KYF3

Overview
NameKYF_009092-T1
Unique NameKYF_009092-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger KYF3
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ch7:1119635..1120702+

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>KYF_009092-T1 ID=KYF_009092-T1|Name=KYF_009092-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1068bp|location=Sequence derived from alignment at ch7:1119635..1120702+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTA CGCTGGTTAGTAGTTGCTTTGGGAAGGAAACGCCTTGGCCCATCCTGGAA TTTACTAACGGGCTGAGGTAGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGC TACAACTGTGAGTAGACCCTGTTCATTGGCAGCTTATTCGTTGCGTATCA TTTGCTGATATAATTACGCTGTTCAACAGGCAAGCAGCCTGGTAGGTCCC TTCTGTGTGTCACGTCGCTCGAACAATATCTCTGATCGATCAATCGACAG GCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGAGTAAGGTT TTCGGTCCTCGTGGCTGCAACGCACCGGAATGCTGATATATCTCCGATCC AGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATT GTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGC CAGCCCGGTCACCTTGCCGTACGTTTTCTCGTCGATCCCAGCTTATTGCT TTCCGGGCAAAATCGTTGTTGACCTTCTCCTAGCGCAACTGCCCCGCTCC TGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCG GTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGC GGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTG CTACGCCTGTGGCAAGCTGGTAGGTGTTCTTGTCATACTTGATCCGATAC GAACGTTGAGGCTTATCTGAATCTATAGGGTCACATCTCCCGCGAATGCA CTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAG TGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGT CGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCG CCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCT ACTACCGCTGTCGCATAG
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at ch7:1119635..1120702+

>KYF_009092-T1 ID=KYF_009092-T1|Name=KYF_009092-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=4809bp|location=Sequence derived from alignment at ch7:1119635..1120702+ (Aspergillus niger KYF3)
ATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTA
CGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGC
CTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAG
CAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTAC
GTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCG
GTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCC
CCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATA
CCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCC
GTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGT
CACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGC
CGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACT
GCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCC
CCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCC
CGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTC
GTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGC
TCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTC
CAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACT
GCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAAC
GGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCG
CAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCG
GCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCT
ACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGC
TCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCG
AATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGC
TACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGA
GGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTG
CCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCG
GCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTA
CAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGC
GTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCG
CGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGG
CCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCC
GCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCT
CCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAG
CGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGT
GCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAG
TGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCC
CAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCC
AGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAG
CAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGC
CGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCG
CTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAAC
ATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAA
CTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGA
CTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCC
GATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTG
CAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTG
CTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGT
GGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAA
CCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTG
GCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCC
CTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACAT
CTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATG
CCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCG
GAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGAT
GTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACG
CTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCT
GGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCA
ATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGT
TGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGT
CACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCC
TGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACC
CCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGT
GATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCA
CATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCG
GCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGC
CCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCC
TGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCG
TTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGT
CGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTC
TTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCA
GCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGC
CAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGG
TGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCA
ACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGC
GGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTAC
TTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTC
AGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAA
TGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTA
CAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGG
CCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCC
GCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGC
TCCTACTACCGCTGTCGCATAGATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACA
AGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGT
CTCTGCTACAACTGCAAGCAGCCTGGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCG
TCCTCGTACGACTGAGACCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCC
ACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGC
TGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCCGCAACTGCCCCGCTCC
TGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCG
GTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGC
GGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTG
CTACGCCTGTGGCAAGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCA
ACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAG
GCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCA
GCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCG
AGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCT
GTCGCATAG
back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0003676nucleic acid binding
GO:0008270zinc ion binding
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_009092KYF_009092Aspergillus niger KYF3gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_009092-T1KYF_009092-T1-proteinAspergillus niger KYF3polypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_009092-T1.exon1KYF_009092-T1.exon1Aspergillus niger KYF3exon
KYF_009092-T1.exon2KYF_009092-T1.exon2Aspergillus niger KYF3exon
KYF_009092-T1.exon3KYF_009092-T1.exon3Aspergillus niger KYF3exon
KYF_009092-T1.exon4KYF_009092-T1.exon4Aspergillus niger KYF3exon
KYF_009092-T1.exon5KYF_009092-T1.exon5Aspergillus niger KYF3exon
KYF_009092-T1.exon6KYF_009092-T1.exon6Aspergillus niger KYF3exon
KYF_009092-T1.exon7KYF_009092-T1.exon7Aspergillus niger KYF3exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
KYF_009092-T1.cdsKYF_009092-T1.cdsAspergillus niger KYF3CDS


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR036875
DBxrefInterPro:IPR001878
DBxrefPFAM:PF13917
DBxrefPFAM:PF00098
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Whole Genome Assembly and Annotation of Aspergillus Aspergillus niger KYF32020-10-09
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ch7supercontigch7:1119635..1120702 +