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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:3652718..3655296- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_011223-T1 ID=KYF_011223-T1|Name=KYF_011223-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=2579bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:3652718..3655296- (Aspergillus niger KYF3) ATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACCATCCGCACTCT
CGCGGTATGCAACTCTTGCTCCCATTCTCTTTGCTTCTATTCCACTCCCA
TCCGATTCCGGTGTGACGGAGAGCTTCTCTAGAGCTCCGGCACCGGAAGG
CCATCCCTGGTATCACGGGGACTCCGCGGAGCACAGTCTCCCACACTGAG
GATCGGCTTTTTGTAGCTGCTATCTCCTCGGAGCTCCTTGTTTTACTAGC
TACGGATTGCGGAGTGGTCATATCTATCAGAACTATCACTCTTAGTCAAC
TTTGAAGCTAATCCTCCTCTAGGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCG
GTCACCCCGGTGCCCCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTC
AACAAGTTCATGAGCTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGA
CCGCTTCGTTCTCTCGTAAGCTTCAACTGGCAATCTTTGTGTCCAGGTGA
TCGTTTCACTAACTTTCCTCCCCAGCAACGGCCACGGCTGCATGCTCCAA
TATGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGATGACCTGAA
GTCCTTCAGAGTATGTATCCGCTGAGGGTTTCTGCGAGAGCCATTGTAGA
CATGTCCTAACTATCATGCTCGTGTAGCAACTCGACAGCATCACCCCCGG
TCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCACCACTGGTCCCC
TGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTGCCGAGCGTCAC
TCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAACTACAC
ATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCATGGAGGGTATTGCCAGCGAGG
CCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCATTGCTATCTAC
GACGACAACGGAATCTCCATCGGTAAGCTTCATTCATCACCCCTTTTTCC
TCATTATCACAGCCATACTAACGAGGGCTTGTTTTGCAGACGGTGACACC
AAGTGCGCCTTCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTG
GCACACCGAGTACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGG
CTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGT
CTGACTACTACCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGT
CCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCT
TCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGAC
CTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAA
CCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGC
TCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTG
CCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGA
GGCTGTCCTCGAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCT
CTGCCGACTTGACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGAC
TTCCAGCCCCCCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCG
CTACGGTGTCCGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCG
CCTACGGCACCGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCC
TACGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCAT
CTACGTTGCCACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTC
ACCAGCCCATTGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATG
GTTTGGCGCCCTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGC
TCTGACCTCCAAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACC
TGCCCCAGCTCGAGGCTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTAC
GTTGCCCTCGAGGCCCCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTC
CGAGGTCAGCATCTGTATCGAGGCTGCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACG
GCATCGCTGCCCGCGTTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCC
CAGGACAAGGCCTACAAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCT
CTCCGTCGAGGCTCTCACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGC
AGTTCGGTCTCAACCGCTTCGGTGCCTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTAC
AAGGTAAGCTACAAAATATGTCCACCTCTTTCAATAGCCGCATATGCTAA
TTCACTTCACTGCAGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCG
CGCTGTCGCCACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCA
TCAACCGTGCTTTCCAGCAGATTCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:3652718..3655296- >KYF_011223-T1 ID=KYF_011223-T1|Name=KYF_011223-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=12330bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:3652718..3655296- (Aspergillus niger KYF3) AAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTCGCCACCAT TGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCGTGCTTTCC AGCAGATTCTGTAAACGGTGACACCAAGTGCGCCTTCACTGAGGATGTTA TGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACCGAGTACGTCAAGGACGGT GACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGT CACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGTCTGACTACTACCATCGGTTTCGGTT CCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGAC GACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTT CGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGG GTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCT GAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCT TGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTG CCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTCCTCGAGAAGATCCACGAT GTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGACTTGACTGGCTCCAACAA CACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGCCCCCCGAGTACAACATCG GTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTCCGTGAGCACGCCATG GCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCACCGTCATCCCCGCTGG TGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTGT CGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCCACCCACGACTCCATC GGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCATTGAGACTCTGGCTCA CTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCCCTGCTGACGGCAACG AGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCCAAGCACACCCCCAGC ATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCAGCTCGAGGCTTCCACCAT CGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGCCCTCGAGGCCCCCGACGCTG CCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGGTCAGCATCTGTATCGAGGCT GCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACGGCATCGCTGCCCGCGTTGTCTCCGT TCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCCCAGGACAAGGCCTACAAGCTCCAGG TCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCTCTCCGTCGAGGCTCTCACCACCATG GGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGCAGTTCGGTCTCAACCGCTTCGGTGC CTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTACAAGCAACTCGACAGCATCACCCCCG GTCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCACCACTGGTCCC CTGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTGCCGAGCGTCA CTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAACTACA CATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCATGGAGGGTATTGCCAGCGAG GCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCATTGCTATCTA CGACGACAACGGAATCTCCATCGCAACGGCCACGGCTGCATGCTCCAATA TGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGATGACCTGAAGT CCTTCAGAGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCGGTCACCCCGGTGCC CCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTCAACAAGTTCATGAG CTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGACCGCTTCGTTCTCT CATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACCATCCGCACTC TCGCGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTCGCC ACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCGTGC TTTCCAGCAGATTCTGTAAACGGTGACACCAAGTGCGCCTTCACTGAGGA TGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACCGAGTACGTCAAGG ACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTATCAAGAAGTGCCAG GCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGTCTGACTACTACCATCGGTTT CGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAACCCCCTGAAGG CTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGACCCCAAGCAG ACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACAAGCACGCCGC TGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTCCAGAAGTACG 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GAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGACCCCA AGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACAAGCAC GCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTCCAGAA GTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCGCCGTCTCT CCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCTACAAGCCC ACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTCCTCGAGAA GATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGACTTGACTG GCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGCCCCCCGAG TACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTCCGTGA GCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCACCGTCA TCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCGGTGCT GTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCCACCCA CGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCATTGAGA CTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCCCTGCT GACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCCAAGCA CACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCAGCTCGAGG CTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGCCCTCGAGGCC CCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGGTCAGCATCTG TATCGAGGCTGCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACGGCATCGCTGCCCGCG TTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCCCAGGACAAGGCCTAC AAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCTCTCCGTCGAGGCTCT CACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGCAGTTCGGTCTCAACC GCTTCGGTGCCTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTACAAGCAACTCGACAGC ATCACCCCCGGTCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCAC CACTGGTCCCCTGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTG CCGAGCGTCACTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTC AACAACTACACATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCATGGAGGGTAT TGCCAGCGAGGCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCA TTGCTATCTACGACGACAACGGAATCTCCATCGCAACGGCCACGGCTGCA TGCTCCAATATGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGAT GACCTGAAGTCCTTCAGAGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCGGTCA CCCCGGTGCCCCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTCAACA AGTTCATGAGCTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGACCGC TTCGTTCTCTCATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACC ATCCGCACTCTCGCGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCG CGCTGTCGCCACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCA TCAACCGTGCTTTCCAGCAGATTCTGTAAACGGTGACACCAAGTGCGCCT TCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACCGAG TACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTATCAA GAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGTCTGACTACTA CCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGTCCACGGTAAC CCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTTCGA CCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACCACA AGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTCCTC CAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCGCCG TCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCTACA AGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTCCTC GAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGACTT GACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGCCCC CCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTC CGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCAC CGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCG GTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCC ACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCAT TGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCC CTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCC AAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCAGCT 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CCCATTGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTG GCGCCCTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGA CCTCCAAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCC CAGCTCGAGGCTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGC CCTCGAGGCCCCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGG TCAGCATCTGTATCGAGGCTGCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACGGCATC GCTGCCCGCGTTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCCCAGGA CAAGGCCTACAAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCTCTCCG TCGAGGCTCTCACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGCAGTTC GGTCTCAACCGCTTCGGTGCCTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTACAAGCA ACTCGACAGCATCACCCCCGGTCACCCCGAGGCTCACGACACCCCCGGTG TTGAGGTCACCACTGGTCCCCTGGGCCAGGGTTTCGCCAACGCCGTTGGT CTTGCTATTGCCGAGCGTCACTCCGCTGCTGTCTTCAACAAGCCCGGCTA CACCCTCTTCAACAACTACACATACTGCTTCTTCGGTGATGGCTGCGCCA TGGAGGGTATTGCCAGCGAGGCCGCCTCCATGGCTGGTCACCTGAAGCTC GGTAACCTCATTGCTATCTACGACGACAACGGAATCTCCATCGCAACGGC CACGGCTGCATGCTCCAATATGCTCTCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGT CTCCATGGATGACCTGAAGTCCTTCAGAGTTGATGCCACCTTCAAGGCCA ACTCCGGTCACCCCGGTGCCCCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTC CTTTTCAACAAGTTCATGAGCTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAA CCGTGACCGCTTCGTTCTCTCATGGGTTACAACGACGTGGACCAATTGGC CATCAACACCATCCGCACTCTCGCGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCA TTAGCAAGCGCGCTGTCGCCACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTG CGCTCCCCCATCAACCGTGCTTTCCAGCAGATTCTGTAAACGGTGACACC AAGTGCGCCTTCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTG GCACACCGAGTACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGG CTGCTATCAAGAAGTGCCAGGCTGTCACTGACAAGCCCTCCGTCATTCGT CTGACTACTACCATCGGTTTCGGTTCCAAGCTCCAGGGTACTGGCGGTGT CCACGGTAACCCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCT TCGGCTTCGACCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGAC CTCTACCACAAGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAA CCAGCTCCTCCAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGC TCACCCGCCGTCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTG CCCGTCTACAAGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGA GGCTGTCCTCGAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCT CTGCCGACTTGACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGAC TTCCAGCCCCCCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCG CTACGGTGTCCGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003824 | catalytic activity |
GO:0004802 | transketolase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR029061 |
DBxref | InterPro:IPR020826 |
DBxref | InterPro:IPR033248 |
DBxref | InterPro:IPR005474 |
DBxref | InterPro:IPR009014 |
DBxref | InterPro:IPR005478 |
DBxref | InterPro:IPR005475 |
DBxref | PFAM:PF02779 |
DBxref | PFAM:PF00456 |
DBxref | PFAM:PF02780 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch8 | supercontig | ch8:3652718..3655296 - |
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