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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch8:5162628..5164391+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_011720-T1 ID=KYF_011720-T1|Name=KYF_011720-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1764bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:5162628..5164391+ (Aspergillus niger KYF3) ATGGCCGGCGGTAAGGTAGGCGTTAGATCCCGCTGTCATCAAGAGTTATT
GCCCATTAGCTAGGCGTTGACTAACGTCGAGTTATTAGCGACCCGACGTG
CACCCTGTGATAGACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGA
TGACCCAACAAACCCGAGGTGAGAGAATAACCGGTCACATCTGCCACCAC
GTAAGATCGAGCATCTGACACGAAATAGAAATTTTCCTGTGTCCCAGAAG
TGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCATCACATTCATCAGGTATGCTGA
GAGTTCTTCAATATAATCAGGTAACGGGCTCTTGCTCACGACCTCTACAG
TCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGTGTGGTATATGCGGAAGAGG
AATTTGATGTCACGTCGACGATATTGGGAACTCTCTCCGTCACAGGTTAT
CTCATCGGTTATGTGGTATGTGTGGTTTCCGTGTTGTGCAAGAATATGAC
TTGAGCTTACCGAACTTGCCATGTAGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCG
CTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAATACGTT
CTTTGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGC
TGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGATCGGCTTGTTTGACT
ACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAAT
CGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCCTCATCGGACCCGTGCTAGGAC
CACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTATGT
CAATTCCACCTGTCTTTTCATCCCCATGACTGATATTGATACCCCTGTAG
GTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCAT
GGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCG
AGCGTCTTCGCAAAGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAA
CCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCG
GTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCAATCGTGTTTCCCG
TTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACC
ACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAG
TGGCCTCGCGTATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCG
TCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCTTGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAAC
AACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGC
CTTCTTTATCCCCGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGA
AAACCCACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCGCCCTTTGCGTTCGGC
ATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATCGACTGCTATCC
TCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGA
TGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACTCGACTTTGGGC
TACGGATGGGGTAATTCCTTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCC
AGTGCCAATGCTCTTTTACAAGTATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCATCTC
AATTGGAATTGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch8:5162628..5164391+ >KYF_011720-T1 ID=KYF_011720-T1|Name=KYF_011720-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=8730bp|location=Sequence derived from alignment at ch8:5162628..5164391+ (Aspergillus niger KYF3) ATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTGGAGAA GGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAGAAATT TTCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCATCACA TTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGTGTGGTATATGC GGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATATTGGGAACTCTCTCCGTCA CAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGCTG AGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAATACGTTCTT TGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGCTGA TCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGATCGGCTTGTTTGACTACA GGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATCGC AATGGCAGTTTATACTACGGGTATCCTCATCGGACCCGTGCTAGGACCAC TTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTGTTCTGG GTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCATGGTTTTCAA CCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCGAGCGTCTTC GCAAAGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAACCTGATGGA GCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCGGTTGATCAT GCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCAATCGTGTTTCCCGTTGCGACCT ATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACCACCGTCACC GATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAGTGGCCTCGC GTATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCGTCTTCGCCT TGGTCAGTGATCGCTTGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAACAACAACGTC TTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGCCTTCTTTAT CCCCGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGAAAACCCACT GGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCGCCCTTTGCGTTCGGCATGGTGGGT ATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATCGACTGCTATCCTCGGTACGC TGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGATGGGTGCTC TGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACTCGACTTTGGGCTACGGATGG GGTAATTCCTTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCCAGTGCCAAT GCTCTTTTACAAGTATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCATCTCAATTGGAAT TGTGAATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTG GAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAG AAATTTTCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCA TCACATTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGTGTGGTA TATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATATTGGGAACTCTCTC CGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTC CGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAATACG TTCTTTGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGC GCTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGATCGGCTTGTTTGA CTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGA ATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCCTCATCGGACCCGTGCTAGG ACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTGT TCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCATGGTT TTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCGAGCG TCTTCGCAAAGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAACCTG ATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCGGTTG ATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCAATCGTGTTTCCCGTTGC GACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACCACCG TCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAGTGGC CTCGCGTATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCGTCTT CGCCTTGGTCAGTGATCGCTTGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAACAACA ACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGCCTTC TTTATCCCCGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGAAAAC CCACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCGCCCTTTGCGTTCGGCATGG TGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATCGACTGCTATCCTCGG TACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGATGGG TGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACTCGACTTTGGGCTACG GATGGGGTAATTCCTTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCCAGTG CCAATGCTCTTTTACAAGTATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCATCTCAATT GGAATTGTGAATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAG ACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAAC CCGAGAAATTTTCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAG TACCATCACATTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGTG TGGTATATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATATTGGGAACT CTCTCCGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTCCTCTCTTTTT CTCTCCGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCA ATACGTTCTTTGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATA TCTGCGCTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGATCGGCTTG TTTGACTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGC GTGGAATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCCTCATCGGACCCGTG CTAGGACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTG GGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCA 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CTTTGCCTTCTTTATCCCCGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGC AGGAGAAAACCCACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCGCCCTTTGCG TTCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATCGACTG CTATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGT CGCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACTCGACT TTGGGCTACGGATGGGGTAATTCCTTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCAT GATCCCAGTGCCAATGCTCTTTTACAAGTATGGTGGCAGCGTCAGAAAGT CATCTCAATTGGAATTGTGAATGGCCGGCGGTAAGCGACCCGACGTGCAC CCTGTGATAGACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGA CCCAACAAACCCGAGAAATTTTCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGA TACTGGTCAGTACCATCACATTCATCAGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTC TCTCCGGGTGTGGTATATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGAT ATTGGGAACTCTCTCCGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATGTGACTGGTC CTCTCTTTTTCTCTCCGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTC AGTGCGGCCAATACGTTCTTTGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGC CCCCAATATATCTGCGCTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTG GATCGGCTTGTTTGACTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTG GCTGAACAGCGTGGAATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCCTCAT CGGACCCGTGCTAGGACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005887 | integral component of plasma membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR036259 |
DBxref | InterPro:IPR020846 |
DBxref | InterPro:IPR011701 |
DBxref | PFAM:PF07690 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch8 | supercontig | ch8:5162628..5164391 + |
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