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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000003.1:749419..750665+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_13570-T1 ID=ATCC64974_13570-T1|Name=ATCC64974_13570-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1247bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000003.1:749419..750665+ (Aspergillus niger N402)
ATGGCATTCGGTGGTCCTCGTGGTGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGTGC
TCCTCGTGGAGGTGGTGGCGGCCGTGGTGGTAGAGGTTTGTTCACCATCG
ATTGATTTCATCTTGGGAGAAACGTGGCAGGCAGGCATATGTGATCTTTT
CGCATTGTTGTTGTCGATCATGTTGGAACTTGCTTCTTGTGACGGAGAAC
CTTGTTCTTGTCCCAGAGCATATCAGGTTTTCCAATATGAGCGACTCGAC
TCGCGTGCCGGAACTGCGGTTATCCCTTCACGGAAAAAAGGAACATGTCG
CTAATCTTTGCACGTTCTATAGGCGGTCTTGGTGCCGGTGGTCGTGGTCG
CGGCGGTGGCCGTGGTGCTCCCCGCGGTGGTCGTGGTGCCCCCCGTGGCC
GTGGTGGTCCTCGCGGCGGTGGTCGCGGCGGTGCTAAGGGTGCCAAGGGT
GGTGCTAAGGTCATCATTGTAGGTGTTTCCTGTTAAATCGATCGAGAAGA
GAGACGTTGTATGGAGTCTAACCGGGATTCGTCTAGGAACCCCACCGTCA
CGCTGGTGTCTTCGTCGCCCGTGGTGGTAAGGAAGATTTGCTCGTCACCA
AGAACCTTACTCCCGGAGAGGCCGTCTACGGTGAGAAGCGCATCTCTGTT
GAGTCCCCCGCTGAGGAGGATGGCACTGTGACCAAGACCGAATACCGTGT
CTGGAACCCCTTCCGTTCCAAGTTGGCTGCCGGTATCCTGGGTGGTCTGG
ATGACATCTACATGCGCCCTGGCTCCAAGGTCCTGTATCTCGGTTCCGCC
AGCGGTACCTCCGTCAGTCACGTTGCCGATATCGTCGGACCTACTGGTAA
CGTCTACGCTGTTGAGTTCTCCCACCGTTCCGGCCGTGACTTGATCGGCA
TGGCTACCCACCGCACCAACGTTATCCCCATCGTCGAGGACGCCAGACAC
CCTCTTCGTTACCGTATGCTCGTCCCCATGGTCGATGTCATCTTCGCCGA
TGTTGCCCAGCCCGACCAGGCCCGTATTGTCGGCCTGAACGCCCACATGT
TCCTCAAGGAGGGCGGTGGTGTCATTGTCTCCGTCAAGGCCAACTGTATC
GACAGTACCGCTAAGCCCGAGGTTGTGTTCGCTCGTGAAGTCCAGAAGAT
GAGAGAGGAGCGGATCAAGCCCAGGGAACAGCTGACCCTGGAGCCTTTCG
AACGTGACCACTGTATAGTGTCTGGTATCTACAAGCGCTCTGCATGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000003.1:749419..750665+ >ATCC64974_13570-T1 ID=ATCC64974_13570-T1|Name=ATCC64974_13570-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=2826bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000003.1:749419..750665+ (Aspergillus niger N402)
ATGGCATTCGGTGGTCCTCGTGGTGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGTGC
TCCTCGTGGAGGTGGTGGCGGCCGTGGTGGTAGAGGCGGTCTTGGTGCCG
GTGGTCGTGGTCGCGGCGGTGGCCGTGGTGCTCCCCGCGGTGGTCGTGGT
GCCCCCCGTGGCCGTGGTGGTCCTCGCGGCGGTGGTCGCGGCGGTGCTAA
GGGTGCCAAGGGTGGTGCTAAGGTCATCATTGAACCCCACCGTCACGCTG
GTGTCTTCGTCGCCCGTGGTGGTAAGGAAGATTTGCTCGTCACCAAGAAC
CTTACTCCCGGAGAGGCCGTCTACGGTGAGAAGCGCATCTCTGTTGAGTC
CCCCGCTGAGGAGGATGGCACTGTGACCAAGACCGAATACCGTGTCTGGA
ACCCCTTCCGTTCCAAGTTGGCTGCCGGTATCCTGGGTGGTCTGGATGAC
ATCTACATGCGCCCTGGCTCCAAGGTCCTGTATCTCGGTTCCGCCAGCGG
TACCTCCGTCAGTCACGTTGCCGATATCGTCGGACCTACTGGTAACGTCT
ACGCTGTTGAGTTCTCCCACCGTTCCGGCCGTGACTTGATCGGCATGGCT
ACCCACCGCACCAACGTTATCCCCATCGTCGAGGACGCCAGACACCCTCT
TCGTTACCGTATGCTCGTCCCCATGGTCGATGTCATCTTCGCCGATGTTG
CCCAGCCCGACCAGGCCCGTATTGTCGGCCTGAACGCCCACATGTTCCTC
AAGGAGGGCGGTGGTGTCATTGTCTCCGTCAAGGCCAACTGTATCGACAG
TACCGCTAAGCCCGAGGTTGTGTTCGCTCGTGAAGTCCAGAAGATGAGAG
AGGAGCGGATCAAGCCCAGGGAACAGCTGACCCTGGAGCCTTTCGAACGT
GACCACTGTATAGTGTCTGGTATCTACAAGCGCTCTGCATGAATGGCATT
CGGTGGTCCTCGTGGTGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGTGCTCCTCGTG
GAGGTGGTGGCGGCCGTGGTGGTAGAGGCGGTCTTGGTGCCGGTGGTCGT
GGTCGCGGCGGTGGCCGTGGTGCTCCCCGCGGTGGTCGTGGTGCCCCCCG
TGGCCGTGGTGGTCCTCGCGGCGGTGGTCGCGGCGGTGCTAAGGGTGCCA
AGGGTGGTGCTAAGGTCATCATTGAACCCCACCGTCACGCTGGTGTCTTC
GTCGCCCGTGGTGGTAAGGAAGATTTGCTCGTCACCAAGAACCTTACTCC
CGGAGAGGCCGTCTACGGTGAGAAGCGCATCTCTGTTGAGTCCCCCGCTG
AGGAGGATGGCACTGTGACCAAGACCGAATACCGTGTCTGGAACCCCTTC
CGTTCCAAGTTGGCTGCCGGTATCCTGGGTGGTCTGGATGACATCTACAT
GCGCCCTGGCTCCAAGGTCCTGTATCTCGGTTCCGCCAGCGGTACCTCCG
TCAGTCACGTTGCCGATATCGTCGGACCTACTGGTAACGTCTACGCTGTT
GAGTTCTCCCACCGTTCCGGCCGTGACTTGATCGGCATGGCTACCCACCG
CACCAACGTTATCCCCATCGTCGAGGACGCCAGACACCCTCTTCGTTACC
GTATGCTCGTCCCCATGGTCGATGTCATCTTCGCCGATGTTGCCCAGCCC
GACCAGGCCCGTATTGTCGGCCTGAACGCCCACATGTTCCTCAAGGAGGG
CGGTGGTGTCATTGTCTCCGTCAAGGCCAACTGTATCGACAGTACCGCTA
AGCCCGAGGTTGTGTTCGCTCGTGAAGTCCAGAAGATGAGAGAGGAGCGG
ATCAAGCCCAGGGAACAGCTGACCCTGGAGCCTTTCGAACGTGACCACTG
TATAGTGTCTGGTATCTACAAGCGCTCTGCATGAATGGCATTCGGTGGTC
CTCGTGGTGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGTGCTCCTCGTGGAGGTGGT
GGCGGCCGTGGTGGTAGAGGCGGTCTTGGTGCCGGTGGTCGTGGTCGCGG
CGGTGGCCGTGGTGCTCCCCGCGGTGGTCGTGGTGCCCCCCGTGGCCGTG
GTGGTCCTCGCGGCGGTGGTCGCGGCGGTGCTAAGGGTGCCAAGGGTGGT
GCTAAGGTCATCATTGAACCCCACCGTCACGCTGGTGTCTTCGTCGCCCG
TGGTGGTAAGGAAGATTTGCTCGTCACCAAGAACCTTACTCCCGGAGAGG
CCGTCTACGGTGAGAAGCGCATCTCTGTTGAGTCCCCCGCTGAGGAGGAT
GGCACTGTGACCAAGACCGAATACCGTGTCTGGAACCCCTTCCGTTCCAA
GTTGGCTGCCGGTATCCTGGGTGGTCTGGATGACATCTACATGCGCCCTG
GCTCCAAGGTCCTGTATCTCGGTTCCGCCAGCGGTACCTCCGTCAGTCAC
GTTGCCGATATCGTCGGACCTACTGGTAACGTCTACGCTGTTGAGTTCTC
CCACCGTTCCGGCCGTGACTTGATCGGCATGGCTACCCACCGCACCAACG
TTATCCCCATCGTCGAGGACGCCAGACACCCTCTTCGTTACCGTATGCTC
GTCCCCATGGTCGATGTCATCTTCGCCGATGTTGCCCAGCCCGACCAGGC
CCGTATTGTCGGCCTGAACGCCCACATGTTCCTCAAGGAGGGCGGTGGTG
TCATTGTCTCCGTCAAGGCCAACTGTATCGACAGTACCGCTAAGCCCGAG
GTTGTGTTCGCTCGTGAAGTCCAGAAGATGAGAGAGGAGCGGATCAAGCC
CAGGGAACAGCTGACCCTGGAGCCTTTCGAACGTGACCACTGTATAGTGT
CTGGTATCTACAAGCGCTCTGCATGA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0006364 | rRNA processing |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0008168 | methyltransferase activity |
| GO:0003723 | RNA binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| ATCC64974_13570-T1 | ATCC64974_13570-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG092648VW |
| DBxref | InterPro:IPR029063 |
| DBxref | InterPro:IPR000692 |
| DBxref | PFAM:PF01269 |
| Product | Small subunit processome complex component |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| OGUI01000003.1 | supercontig | OGUI01000003.1:749419..750665 + |
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