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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000005.1:1695286..1697656- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_38510-T1 ID=ATCC64974_38510-T1|Name=ATCC64974_38510-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=2371bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000005.1:1695286..1697656- (Aspergillus niger N402) ATGCGGTGGGTTCTTACTCAGGGGGGTTCAATGCGACTAGCCCACGAAAT
ACATAAAATCAGACTGCCACCAGTCGTCTCCTCGCCTCAATTGATCCTCT
CCTCCACTGCCATCACCTCTGCTGCCTCCTTCAATCTCCCCTCTTCTCCT
GATATCGTTGTTGGTGTTCGTTCCAAGAGTATCCTGGCCGTGACTCAGCC
TTCCACCATGGCTCGATTTCCCGCTCAGCAAAGCCGTCCCGTCCACGCGA
CCTCCTTGGTGAACCATGCGGCACCGGTGTAAGTACCGTCTTTTGCCTCC
CCCCGTCTTTTGACGGAAACATCTACCCTCGACTCCAAGTCACACATCAT
CAGCTTGTGCCTGCTGCTGTCACGGTTACTGACAATGCCTTCCGCTACGT
CTAGTGACGCCAACTATGACACTGCCAACCCTGCCTACATTCGCAAGTAT
CTCCGCACCTACGGCTTGACTCCCCCGCGTGCGGAGTCGTACGAGACCCA
GAAGACTCGCTGTGCGTACACCCGTAGATGAGGAATGATGGTTGAAAGGG
GGCTGGAAGCTAATGGAGTTGCAGGCCTCGCTCAATTGGCTCTCAAGCAG
ACCCCTATCGACAAGTTCCTCTACCTCAGCACTCTCCGTAAGAACAATGT
TCACCTGTTCTACCGTCTGGTCACGGACCACCTGAGGGTAAGCATGCAGC
TGCAGAACCACATTATCGTAAGCCAATGAGCTAACTCGGCACTAAGGAAT
TGACCCCCCTCATCTACACTCCCGTCGTTGGAGAAGCCTGCCAGAGATGG
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TCCTTGTCACGGGCTGAATCGGCCGCTAACCATGCACGTCTAGGTATGTA
CCTGAGCTGGGAGGATCGCGGCAACCTGGCCGCTGTCATTGCCAACTGGC
CCCAGCCCAACGTGGAGATCACATGTATCACCGATGGTTCCCGTATTCTC
GGCCTGGGTGACCTTGGCATCAACGGTATGGGCATTCCCATTGGCAAGCT
GGCTCTTTACACTGCCTGTGCGGGTATTCGCCCCGAGGCCACCCTGCCCT
TGACTCTCGATCTGGGTACCAGCAACAAGGCTTTCCGGGAAGACCCGTTG
TACATGGGTAGCCGCCGTGACAAGGTGACCCCCGAGGAGGAGCGTGAATT
CTTGGATGAGCTGATGGCTGCTCTGACCGAGCGCTGGCCTGGGTAAGTAA
ATCCCCATGCATGATCGACCCGACTGCATCGTTGCTTACGCGTTTACAGT
ATTGTGATCCAATTTGAGGACTTCAAGAACCCCTTCCCTGCTTTGGAGCG
TTACCGTGATAACTACACCTGCTTCAACGATGACATCCAGGGTACTGGTG
CTGTCATTCTTGGAGGTGTGATCAACGCCGTGAAGCGCTCTGGCCTTCCT
TGCAAGGACCACCGCGCCGTCTTCTTCGGTGCTGGCAGCGCCGGTGTTGG
TGTTGCTAAGCAGATTGTTGACTTCTTCGTCCGCGAGGGCATGACCGAGG
ATGAGGCCCGCGCGTGCTTCTACCTGGTTGACACCAAGGGTCTTGTCACT
GCTGATCGTGGTGACAAGCTCGCTGATCACAAGGTCTACTTTGCCCGTAC
GGACAACAACGGCCTGCAGCTGAAGACCCTGGAAGATGTTGTTGACCATG
TGAAGCCCACCATCCTGATGGGTCTTTCCACCATCGGCGGTGTCTTCACC
CCCGAGCTCCTGCGCAAGATGGCTGAGTGGAACACCGCCCCCATTGTCTT
CCCCCTGTCCAACCCCTCTCACAAGTCCGAATGTGACTACGAGAGCGCCG
TCACCAACACCGATGGCCGGGTGCTGTTCGCCTCCGGTTCTCCCTTTCCC
CCCATGTCCTACACCAACTCTGCTGGCGAGACCCGCACCTACTACCCCGG
CCAAGGCAACAACATGTATGTCTTCCCCGGTATTGGTCTGGGTACCATCC
TCTCCAAGTCTGTCAAGGTCACCGACAGCATGATCTACGCCTCGGGTGAG
GCCCTTTCCAAGGCTCTCCTTCCTGAGGAGATTGAGCGTGGTCTTCTCTA
CCCCGACCTGACCCGCATCCGTGAGGTCAGTGTTGTTGTGGCCCGCAATG
TCATCCGGGCGGCACAAGAGGCCAAGGTCGACCGTGAAACCGCTCTGCGC
ACCATGAGCGACGAGAACTTGGATGCCTGGATCAAGGCCCGCATGTACAA
CCCCCACACTGAGGTCTTGGCCTTGGAGCGGGAGGTCGGCTCTATCCTGG
CTAGCCTGGGACCCAGCGCCTTCTCCCTGGAGGCTCTGACTGAGGAGGCT
GAGAAGAACTCTAAGCTGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000005.1:1695286..1697656- >ATCC64974_38510-T1 ID=ATCC64974_38510-T1|Name=ATCC64974_38510-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=11988bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000005.1:1695286..1697656- (Aspergillus niger N402) TATTGTGATCCAATTTGAGGACTTCAAGAACCCCTTCCCTGCTTTGGAGC GTTACCGTGATAACTACACCTGCTTCAACGATGACATCCAGGGTACTGGT GCTGTCATTCTTGGAGGTGTGATCAACGCCGTGAAGCGCTCTGGCCTTCC TTGCAAGGACCACCGCGCCGTCTTCTTCGGTGCTGGCAGCGCCGGTGTTG GTGTTGCTAAGCAGATTGTTGACTTCTTCGTCCGCGAGGGCATGACCGAG GATGAGGCCCGCGCGTGCTTCTACCTGGTTGACACCAAGGGTCTTGTCAC TGCTGATCGTGGTGACAAGCTCGCTGATCACAAGGTCTACTTTGCCCGTA CGGACAACAACGGCCTGCAGCTGAAGACCCTGGAAGATGTTGTTGACCAT GTGAAGCCCACCATCCTGATGGGTCTTTCCACCATCGGCGGTGTCTTCAC CCCCGAGCTCCTGCGCAAGATGGCTGAGTGGAACACCGCCCCCATTGTCT TCCCCCTGTCCAACCCCTCTCACAAGTCCGAATGTGACTACGAGAGCGCC GTCACCAACACCGATGGCCGGGTGCTGTTCGCCTCCGGTTCTCCCTTTCC CCCCATGTCCTACACCAACTCTGCTGGCGAGACCCGCACCTACTACCCCG 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AGGCTTTCCGGGAAGACCCGTTGTACATGGGTAGCCGCCGTGACAAGGTG ACCCCCGAGGAGGAGCGTGAATTCTTGGATGAGCTGATGGCTGCTCTGAC CGAGCGCTGGCCTGGGAATTGACCCCCCTCATCTACACTCCCGTCGTTGG AGAAGCCTGCCAGAGATGGTCTGAGATCTACCAGCAGCCCGAAGGCCTCG CTCAATTGGCTCTCAAGCAGACCCCTATCGACAAGTTCCTCTACCTCAGC ACTCTCCGTAAGAACAATGTTCACCTGTTCTACCGTCTGGTCACGGACCA CCTGAGGTGACGCCAACTATGACACTGCCAACCCTGCCTACATTCGCAAG TATCTCCGCACCTACGGCTTGACTCCCCCGCGTGCGGAGTCGTACGAGAC CCAGAAGACTCGCTATGCGGTGGGTTCTTACTCAGGGGGGTTCAATGCGA CTAGCCCACGAAATACATAAAATCAGACTGCCACCAGTCGTCTCCTCGCC TCAATTGATCCTCTCCTCCACTGCCATCACCTCTGCTGCCTCCTTCAATC TCCCCTCTTCTCCTGATATCGTTGTTGGTGTTCGTTCCAAGAGTATCCTG GCCGTGACTCAGCCTTCCACCATGGCTCGATTTCCCGCTCAGCAAAGCCG TCCCGTCCACGCGACCTCCTTGGTGAACCATGCGGCACCGGTTATTGTGA TCCAATTTGAGGACTTCAAGAACCCCTTCCCTGCTTTGGAGCGTTACCGT GATAACTACACCTGCTTCAACGATGACATCCAGGGTACTGGTGCTGTCAT TCTTGGAGGTGTGATCAACGCCGTGAAGCGCTCTGGCCTTCCTTGCAAGG ACCACCGCGCCGTCTTCTTCGGTGCTGGCAGCGCCGGTGTTGGTGTTGCT AAGCAGATTGTTGACTTCTTCGTCCGCGAGGGCATGACCGAGGATGAGGC 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GGGCATTCCCATTGGCAAGCTGGCTCTTTACACTGCCTGTGCGGGTATTC GCCCCGAGGCCACCCTGCCCTTGACTCTCGATCTGGGTACCAGCAACAAG GCTTTCCGGGAAGACCCGTTGTACATGGGTAGCCGCCGTGACAAGGTGAC CCCCGAGGAGGAGCGTGAATTCTTGGATGAGCTGATGGCTGCTCTGACCG AGCGCTGGCCTGGGAATTGACCCCCCTCATCTACACTCCCGTCGTTGGAG AAGCCTGCCAGAGATGGTCTGAGATCTACCAGCAGCCCGAAGGCCTCGCT CAATTGGCTCTCAAGCAGACCCCTATCGACAAGTTCCTCTACCTCAGCAC TCTCCGTAAGAACAATGTTCACCTGTTCTACCGTCTGGTCACGGACCACC TGAGGTGACGCCAACTATGACACTGCCAACCCTGCCTACATTCGCAAGTA TCTCCGCACCTACGGCTTGACTCCCCCGCGTGCGGAGTCGTACGAGACCC AGAAGACTCGCTATGCGGTGGGTTCTTACTCAGGGGGGTTCAATGCGACT AGCCCACGAAATACATAAAATCAGACTGCCACCAGTCGTCTCCTCGCCTC AATTGATCCTCTCCTCCACTGCCATCACCTCTGCTGCCTCCTTCAATCTC CCCTCTTCTCCTGATATCGTTGTTGGTGTTCGTTCCAAGAGTATCCTGGC CGTGACTCAGCCTTCCACCATGGCTCGATTTCCCGCTCAGCAAAGCCGTC CCGTCCACGCGACCTCCTTGGTGAACCATGCGGCACCGGTTATTGTGATC CAATTTGAGGACTTCAAGAACCCCTTCCCTGCTTTGGAGCGTTACCGTGA TAACTACACCTGCTTCAACGATGACATCCAGGGTACTGGTGCTGTCATTC TTGGAGGTGTGATCAACGCCGTGAAGCGCTCTGGCCTTCCTTGCAAGGAC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055114 | oxidation-reduction process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0051287 | NAD binding |
GO:0004471 | malate dehydrogenase (decarboxylating) (NAD+) activity |
GO:0004470 | malic enzyme activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_38510-T1 | ATCC64974_38510-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036291 |
DBxref | InterPro:IPR015884 |
DBxref | InterPro:IPR037062 |
DBxref | InterPro:IPR012301 |
DBxref | InterPro:IPR012302 |
DBxref | InterPro:IPR001891 |
DBxref | PFAM:PF03949 |
DBxref | PFAM:PF00390 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000005.1 | supercontig | OGUI01000005.1:1695286..1697656 - |
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