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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000006.1:124430..125497- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_39350-T1 ID=ATCC64974_39350-T1|Name=ATCC64974_39350-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1068bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000006.1:124430..125497- (Aspergillus niger N402)
ATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTA
CGCTGGTTAGTAGTTGCTTTGGGAAGGAAACGCCTTGGCCCATCCTGGAA
TTTACTAACGGGCTGAGGTAGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGC
TACAACTGTGAGTAGACCCTGTTCATTGGCAGCTTATTCGTTGCGTATCA
TTTGCTGATATAATTACGCTGTTCAACAGGCAAGCAGCCTGGTAGGTCCC
TTCTGTGTGTCACGTCGCTCGAACAATATCTCTGATCGATCAATCGACAG
GCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGAGTAAGGTT
TTCGGTCCTCGTGGCTGCAACGCACCGGAATGCTGATATATCTCCGATCC
AGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATT
GTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGC
CAGCCCGGTCACCTTGCCGTACGTTTTCTCGTCGATCCCAGCTTATTGCT
TTCCGGGCAAAATCGTTGTTGACCTTCTCCTAGCGCAACTGCCCCGCTCC
TGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCG
GTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGC
GGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTG
CTACGCCTGTGGCAAGCTGGTAGGTGTTCTTGTCATACTTGATCCGATAC
GAACGTTGAGGCTTATCTGAATCTATAGGGTCACATCTCCCGCGAATGCA
CTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAG
TGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGT
CGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCG
CCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCT
ACTACCGCTGTCGCATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000006.1:124430..125497- >ATCC64974_39350-T1 ID=ATCC64974_39350-T1|Name=ATCC64974_39350-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=4809bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000006.1:124430..125497- (Aspergillus niger N402)
GGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTC
CGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCG
ACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCT
GCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGC
TCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGCGCAACTGCC
CCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTC
AACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTA
CAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTA
TGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGG
GACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCC
AACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCGCCATGAG
TCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGAGCAAGCAGCCTGAGGT
CTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTATGTTGTTGTCTCGTCGT
GCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGGGTCACATCTCCC
GCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTC
TGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAA
CGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCC
CTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCT
GCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTC
CGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCC
GTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGC
CCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGC
CTGTGGCAAGCTGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGT
TCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCT
ACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCGCCATGAGTCCAGCAGCTGCC
CGCGTCCTCGTACGACTGAGAGCAAGCAGCCTGAGGTCTGCTCTTCCTCG
GAGCGTCTCTGCTACAACTATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGT
GTGGCAACATTGGCCACTACGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGC
CCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCT
CCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCT
CAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGC
TGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTA
CCGCTGTCGCATAGCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGG
GCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGG
ATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTG
CCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTG
CCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGT
CCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCA
GCCCGGTCACCTTGCCGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTAC
GACTGAGAGCAAGCAGCCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCT
ACAACTATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGG
CCACTACGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGT
CCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACA
CATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTG
ATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGC
GCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATA
GCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCC
GCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCT
GCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCA
GGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGCCAAGCAATGCTA
CAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCC
TTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTT
GCCGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGAGCAAG
CAGCCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTATGTTGT
TGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGGG
TCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCG
CCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGAC
TGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGC
CCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTC
CCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGCGCAACTGCCCC
GCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAA
CAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACA
AGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATG
AAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGA
CTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAA
CGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCGCCATGAGTC
CAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGACTGAGAGCAAGCAGCCTGAGGTCT
GCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTACAACTATGTTGTTGTCTCGTCGTGC
CTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCCACTACGCTGGGTCACATCTCCCGC
GAATGCACTGCCCCCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTG
CTACAAGTGCTCCCAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACG
AGGCCGTCGCTCAGCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCT
GCCGCCGCCGCTGCCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGC
GGCTCCTACTACCGCTGTCGCATAGCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCG
GTGCTCCCCGGGCCCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGT
GGTGGATACGGATACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCC
CAACCACTTTGCCCGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCT
GTGGCAAGCTGCCAAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTC
AGGCCGATTGTCCTACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTAC
AACTGCAGCCAGCCCGGTCACCTTGCCGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCG
CGTCCTCGTACGACTGAGAGCAAGCAGCCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGA
GCGTCTCTGCTACAACTATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGT
GGCAACATTGGCCACTACGCTGGGTCACATCTCCCGCGAATGCACTGCCC
CCAACGGCGGTCCCCTGAGCTCCGCCGGCAAGGTCTGCTACAAGTGCTCC
CAGGCCGGACACATCTCCCGCGACTGCCCCAGCAACGAGGCCGTCGCTCA
GCAGCCCGTTGATGCCACTGCTGCCCCTGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCTG
CCGAGGTCAGCGCGGAGGCTGCTCCCGTTGCTGCTGCGGCTCCTACTACC
GCTGTCGCATAGCGCAACTGCCCCGCTCCTGCTTCCGGTGCTCCCCGGGC
CCCTGCTCCCCGCGGCGGATTCAACAGCGGTTTCCGTGGTGGATACGGAT
ACCCCCGTGCTGCTACTTGCTACAAGTGCGGTGGCCCCAACCACTTTGCC
CGTGATTGCCAGGCTCAGGCTATGAAGTGCTACGCCTGTGGCAAGCTGCC
AAGCAATGCTACAACTGCCAGGGACTAGGCCACGTTCAGGCCGATTGTCC
TACGTTGCGCCTTAACGGTGCCAACGGCCGCTGCTACAACTGCAGCCAGC
CCGGTCACCTTGCCGCCATGAGTCCAGCAGCTGCCCGCGTCCTCGTACGA
CTGAGAGCAAGCAGCCTGAGGTCTGCTCTTCCTCGGAGCGTCTCTGCTAC
AACTATGTTGTTGTCTCGTCGTGCCTGCTACAAGTGTGGCAACATTGGCC
ACTACGCTG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0008270 | zinc ion binding |
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| ATCC64974_39350-T1 | ATCC64974_39350-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR036875 |
| DBxref | InterPro:IPR001878 |
| DBxref | PFAM:PF13917 |
| DBxref | PFAM:PF00098 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| OGUI01000006.1 | supercontig | OGUI01000006.1:124430..125497 - |
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