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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at OGUI01000017.1:728973..730947+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC64974_98160-T1 ID=ATCC64974_98160-T1|Name=ATCC64974_98160-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=mRNA|length=1975bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:728973..730947+ (Aspergillus niger N402) ATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGT
CTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGG
ACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACA
GAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGG
CACCGCGATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCA
TTCTGCCGACAGGTATAGCTCCATTTTATCTAACCCTCACAAAGACACAG
AAAACTAACACTTTGCAATAACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCA
CGTTTCGCATTGCCGTCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGG
ATTGCTTATTGGAATCATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGA
ACAACGCTCATCACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCG
CAGGTCATCATGTCGTTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGA
GTCGACTTCGTATGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGA
TGGAGAGCCCCCAGATGTACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGG
TCGCGCGACAGTGGACAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAG
TCGTCCTGGGTCGCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTT
TCGAAAAGCCCGAGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGG
TGGTTCCGCATCCCCTTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCG
TCTGGTCTCCACCAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTA
TCGACAGAATCATCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGT
GTGACTTATGGTGGTCTCATGGTAAGTTTCTAGGCAATAGACCGTTCTAA
TGAATTCTGCTAACGCGCATTGGCAGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGC
CTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGAC
TCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACG
TGAAGCCATCCAGTCCCATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACG
GGTGAATTCACTGAATCATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGT
CTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACC
TTGAGCATGTGTCCATCTCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGT
ATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCT
TCAATACCCCTCCCACATGAGCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGC
AGCTCCCTGACACCCAGGGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTC
ATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGT
ATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCAC
TGGCTCGTGGCATGACCTATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCC
TACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGAT
TTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTTAGTGTAAGTCCAGCAAAGGAACCGC
GATTCATCCACAGGACATCTTAGCTGACTCATAGGACAGACCCGGAGCGT
GATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCGATGTTTGTGTTCACAG
TCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTGCGAAATTCTCGCCATT
GCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCCCTGCGCTGCCGCC
TTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at OGUI01000017.1:728973..730947+ >ATCC64974_98160-T1 ID=ATCC64974_98160-T1|Name=ATCC64974_98160-T1|organism=Aspergillus niger N402|type=CDS|length=7188bp|location=Sequence derived from alignment at OGUI01000017.1:728973..730947+ (Aspergillus niger N402) ATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGT CTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGG ACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACA GAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGG CACCGCGATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCA TTCTGCCGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTG CCGTCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGG AATCATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATC ACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATG TCGTTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTA TGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCC AGATGTACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGT GGACAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTC GCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCG AGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATC CCCTTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCAC CAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCA TCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGT GGTCTCATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAA AGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTG GCTGCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCC ATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATC ATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCA CCGGTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATC TCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAA GCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACA TGAGCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAG GGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTAT GATGATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACA AGCAGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACC TATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCC GCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCT TCATGCTTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTC GACGCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCAT GTCGTGCGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGG AGTCGCGCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGAATG TGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTC CGTTGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACA TGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACAGAG GCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCAC CGCGATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTC TGCCGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCG TCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAAT CATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACA AGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCG TTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGA ACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGA TGTACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGA CAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCC ATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGG ATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCC TTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAG AGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCT TGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGT CTCATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGG AGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCT GCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATT GTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATT CGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCG GTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCC ATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCG CGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGA GCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGT GTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGAT GATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGC AGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTAT GTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCC AACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCA TGCTTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGAC GCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTC GTGCGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGT CGCGCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGAATGTGG CAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGT TGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGG GTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACAGAGGCA AATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGC GATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGC CGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCGTCG CAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCAT CTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACAAGA TTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCGTTG ATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACG GGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGATGT ACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGACAG GGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATC TTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGGATC CGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCCTTC GCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGC GCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCTTGC CGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGTCTC ATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGG TATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCT GGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATTGTC GGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATTCGT GATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTT GGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCCATC ATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGT CAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCG CACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGTGTA TCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGATGAT GGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGT GGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTATGTC ATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAAC CGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGC TTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCG ATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTG CGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGC GCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGAATGTGGCAG CGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGTTGC GAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGGGTA TGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACAGAGGCAAAT GACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGCGAT TGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGCCGA CAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCGTCGCAA TTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCATCTA CAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACAAGATTG GCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCGTTGATC TTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACGGGC AGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGATGTACT CTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGACAGGGC ACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATCTTG TGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGGATCCGC TCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCCTTCGCC GACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGCGCT TCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCTTGCCGT TTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGTCTCATG AGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTAT CTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGGG CCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATTGTCGGT AAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATTCGTGAT CTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGGG GTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCCATCATG TTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAA AGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCGCAC ACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGTGTATCA CTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGG TTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGGG GTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTATGTCATC ATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGA GATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTTA GTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCGATG TTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTGCGA AATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCC CTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
ATCC64974_98160-T1 | ATCC64974_98160-T1-protein | Aspergillus niger N402 | polypeptide |
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
Note | SECRETED:SignalP(1-22) |
DBxref | InterPro:IPR018825 |
DBxref | InterPro:IPR018827 |
DBxref | PFAM:PF10355 |
DBxref | PFAM:PF10348 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
OGUI01000017.1 | supercontig | OGUI01000017.1:728973..730947 + |
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