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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch1:2778003..2779359- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KYF_001070-T1 ID=KYF_001070-T1|Name=KYF_001070-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=mRNA|length=1357bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:2778003..2779359- (Aspergillus niger KYF3) ATGAAGTACTCTACTATCTTCAGCGCTGCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTC
CGCCGCTGCAGTCGGCGTGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCAAGGGCG
TCACCGGTGGCGGTGATGCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATTGATGAG
CTGGTCTCTTACCTTGGAGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGACCAA
GACCTTCGACTTCACCGACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTTGCG
CTCCCTGGGGTACCGCTTCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGACGAC
TGGTGCGAGAACTACGAACCCGATGCTCCCTCTGTCAGCGTTGAATAGTA
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CGGTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCGTATTGTCA
GCGGTGCTGAGAACATCATCATCCAGTAGGTTATGCTCGGTGTCATTAGG
AATTTGCTCTCTAACGAAATCAGGAACATCGCCGTTACCGACATCAACCC
CAAGTACGTCTGGGGTGGTGATGCTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGG
TCTGGATCGACCATGTTACTGTACGTCTTCATCTTATTCAACTCTACATT
ATATTTCAAGAGCATTGAGTTAACATATGACAGACCGCCCGCATCGGTCG
CCAGCACTACGTCCTTGGAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCACCA
ACAACTACATTGACGGTGTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGCTAC
CACTACTGGGGCATCTACCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCATGAA
GGGCAACTACATCTACCACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACA
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CCTGACTAATCATGGTTGCAGGTCAACAACTACTTCTACGACATCTCCGG
CCACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTACGTCCTGGCTGAGGGCAACG
TTTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGACCTACGAGGGCGCGGCCTTC
ACCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCTGCTCCACCTACCTTGGCCG
TGACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCCGGCACTTTCTCCGAGGACA
GCACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAAGAACATTGCCTCTGCTTCC
GCTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTGCTAACGCCGGTCAGGGCAA
CCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch1:2778003..2779359- >KYF_001070-T1 ID=KYF_001070-T1|Name=KYF_001070-T1|organism=Aspergillus niger KYF3|type=CDS|length=5700bp|location=Sequence derived from alignment at ch1:2778003..2779359- (Aspergillus niger KYF3) GTCAACAACTACTTCTACGACATCTCCGGCCACGCTTTTGAGATCGGTGA GGGTGGCTACGTCCTGGCTGAGGGCAACGTTTTCCAGAACGTCGACACCG TCCTTGAGACCTACGAGGGCGCGGCCTTCACCGTCCCCTCCACCACCGCC GGTGAAGTCTGCTCCACCTACCTTGGCCGTGACTGTGTCATCAACGGCTT CGGCTCCTCCGGCACTTTCTCCGAGGACAGCACCTCTTTCCTCTCCGACT TCGAGGGCAAGAACATTGCCTCTGCTTCCGCTTACACCTCTGTTGCCTCT AGCGTTGTTGCTAACGCCGGTCAGGGCAACCTGTAAACCGCCCGCATCGG TCGCCAGCACTACGTCCTTGGAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCA CCAACAACTACATTGACGGTGTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGC TACCACTACTGGGGCATCTACCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCAT GAAGGGCAACTACATCTACCACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGG ACAACACTCTCCTCCACTGTGAACATCGCCGTTACCGACATCAACCCCAA GTACGTCTGGGGTGGTGATGCTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGGTCT GGATCGACCATGTTACTCTACAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCAC CTCCAACAAGTCCCTCATCGGTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCA AGGGTCTCCGTATTGTCAGCGGTGCTGAGAACATCATCATCCAATGAAGT ACTCTACTATCTTCAGCGCTGCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTCCGCCGCT GCAGTCGGCGTGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCAAGGGCGTCACCGG TGGCGGTGATGCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATTGATGAGCTGGTCT CTTACCTTGGAGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGACCAAGACCTTC GACTTCACCGACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTTGCGCTCCCTG GGGTACCGCTTCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGACGACTGGTGCG AGAACTACGAACCCGATGCTCCCTCTGTCAGCGTTGAATAGTCAACAACT ACTTCTACGACATCTCCGGCCACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTAC GTCCTGGCTGAGGGCAACGTTTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGAC CTACGAGGGCGCGGCCTTCACCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCT GCTCCACCTACCTTGGCCGTGACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCC GGCACTTTCTCCGAGGACAGCACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAA GAACATTGCCTCTGCTTCCGCTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTG CTAACGCCGGTCAGGGCAACCTGTAAACCGCCCGCATCGGTCGCCAGCAC TACGTCCTTGGAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCACCAACAACTA CATTGACGGTGTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGCTACCACTACT GGGGCATCTACCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCATGAAGGGCAAC TACATCTACCACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACAACACTCT CCTCCACTGTGAACATCGCCGTTACCGACATCAACCCCAAGTACGTCTGG GGTGGTGATGCTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGGTCTGGATCGACCA TGTTACTCTACAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCACCTCCAACAAG TCCCTCATCGGTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCG TATTGTCAGCGGTGCTGAGAACATCATCATCCAATGAAGTACTCTACTAT CTTCAGCGCTGCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTCCGCCGCTGCAGTCGGCG TGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCAAGGGCGTCACCGGTGGCGGTGAT GCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATTGATGAGCTGGTCTCTTACCTTGG AGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGACCAAGACCTTCGACTTCACCG ACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTTGCGCTCCCTGGGGTACCGCT TCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGACGACTGGTGCGAGAACTACGA ACCCGATGCTCCCTCTGTCAGCGTTGAATAGTCAACAACTACTTCTACGA CATCTCCGGCCACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTACGTCCTGGCTG AGGGCAACGTTTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGACCTACGAGGGC GCGGCCTTCACCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCTGCTCCACCTA CCTTGGCCGTGACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCCGGCACTTTCT CCGAGGACAGCACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAAGAACATTGCC TCTGCTTCCGCTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTGCTAACGCCGG TCAGGGCAACCTGTAAACCGCCCGCATCGGTCGCCAGCACTACGTCCTTG GAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCACCAACAACTACATTGACGGT GTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGCTACCACTACTGGGGCATCTA CCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCATGAAGGGCAACTACATCTACC ACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACAACACTCTCCTCCACTGT GAACATCGCCGTTACCGACATCAACCCCAAGTACGTCTGGGGTGGTGATG CTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGGTCTGGATCGACCATGTTACTCTA CAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCACCTCCAACAAGTCCCTCATCG GTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCGTATTGTCAGC GGTGCTGAGAACATCATCATCCAATGAAGTACTCTACTATCTTCAGCGCT GCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTCCGCCGCTGCAGTCGGCGTGTCCGGCTC TGCTGAGGGTTTCGCCAAGGGCGTCACCGGTGGCGGTGATGCCACCCCCG TCTACCCCGACACTATTGATGAGCTGGTCTCTTACCTTGGAGACGATGAG GCCCGCGTCATTGTCCTGACCAAGACCTTCGACTTCACCGACAGCGAAGG TACCACCACTGGCACTGGTTGCGCTCCCTGGGGTACCGCTTCCGCCTGCC AGGTTGCTATTGACCAGGACGACTGGTGCGAGAACTACGAACCCGATGCT CCCTCTGTCAGCGTTGAATAGTCAACAACTACTTCTACGACATCTCCGGC CACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTACGTCCTGGCTGAGGGCAACGT TTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGACCTACGAGGGCGCGGCCTTCA 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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | SECRETED:SignalP(1-20) |
Note | CAZy:PL1 |
Note | CAZy:PL1_4 |
DBxref | InterPro:IPR011050 |
DBxref | InterPro:IPR012334 |
DBxref | InterPro:IPR002022 |
DBxref | PFAM:PF00544 |
DBxref | PFAM:PF13229 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ch1 | supercontig | ch1:2778003..2779359 - |
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