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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ch4:5618335..5621787- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >KJC3_006417-T2 ID=KJC3_006417-T2|Name=KJC3_006417-T2|organism=Aspergillus niger KJC3|type=mRNA|length=3453bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:5618335..5621787- (Aspergillus niger KJC3)
TTCTGCTTCATCCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCTTTTTCTCTCCTTCC
TCTCTTTCTCCCTCCTCCATCTCCTCGTCTTTGAAGGTTGTGTTACTACC
TTCAGACTTCTCTTTGTTGATTCCCTCGCTCCAGTCCCGTCTCCTCGTGG
TCTTGTTGGACGCCCCCGGTTTCTTCTAACCTCATAAAAAAAAACTTGTT
TTTTTCTTCCTTCACATAACATCATTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGC
GGCTACCAGCGCGACTCCTACCGGTAAGCTATCCCTTTGCAATCAGAGCA
CTGGTCTAGATGGATTGCTGGAGCGCAAACCAGCCTTGTGGCTGTGCGAC
ATGAATCGCGACTCTGATCGCTTCCTGGCTATTCCAGCCTGCCTTGCGGT
CCGGTCTGTCACGCGATCCGGTCAACCTTCAACCCATCTAGTCCTATCGG
CTCTTCTCAACACTGCGTCGTGAATCTGTACCTCTCAAACGAACATGCTT
GCTAACTTGCCATATAGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGG
TAACGGTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTG
GTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGC
GGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCAT
GTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCC
TGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAG
CGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGT
TCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTT
TCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCT
ACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGT
TGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTC
CTGCCATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGC
CCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCA
AGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTG
TCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGT
GTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGC
TGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCG
ATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCC
CAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAA
GGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTA
ACATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTC
GAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGA
GAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCA
AGCGCATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCG
GCACTTTGTAAGCTTCCTTGGATCCCAATACTGAAACAGCTATTTGCTAA
CCTGCGTTCCAGCTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGG
GTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGA
TGTGGCTTCCCGTGGTATCGGTATGAATAAATCGCAAACTCCCCCCTCCC
CTTCCCCCCCTTCCTCCCTTCCTTTCTTGCCTCCCGAGTCACCCTCACCC
ATATTGAGGTTGTGTGACCATGGCACGGTGCTTAACTCTCTTCCACCAAT
TGTTGGTGTGTATGACTCTTCCAGGCTTTGTCGGGTCTCCTGAAATGGTT
CTCAAGCCAGGAGAGCCTTGGACTCACAGTGCAGTGTAGCAGACGTATTA
CTCTTCTGTTTTGATTCACCATATCTACCTTTTGAAACTTGGCCGGTAGA
GGGAGGGAAAGCTCCTCTCTTACCGACTTGTTGAAGCTGCATTCCAAGGT
TGCTCTAGGACCACGATATCTGCCACCCTCGGACTCGTCTGTCACGGATC
TTTTGATGATTTAAGTCCGAGCGAGAGAGAGAGATGCATCAAGTCTCACG
ACTGAGAAAGGGCTCCTAAGCCACGTTGCTCATTTGACTAATGCTCTGTA
TGCTAACGTTACATATGTTTGAAGATGTGCGCGACATCACACACGTTCTC
AACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAG
AACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTG
ACAGTAAGTCGTTTCTTCCCTTATGAAACGCCTCTTCAGTACTAACATGT
CCATCTTGCAGACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTG
AGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGT
GGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGG
TGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTC
TTGGTGGCAACCGTCGCTGGTAACCTGACCTCGCTGCTCAGTTCACTCAC
TGAGCTTGTATTCCATTCTCACATCGGTAGACGTTCTTTTTCCTTCGCAT
GATTCCTTTTTCGTAACCACGGTACGGGCGGCGTTCGTCGATATCACGAT
AGACTATTCGCGTGTTTTGCTCAGTTTACAACAACAGGCTCCCCCGACAT
AGGGTGACCTCGAAACCTACACGATTGTGCACTGATATTTCTCATGGATA
CACGTTAATTATCTCATTCTTTGTTGTGGTTTATCAAACAAAAAAGTTAT
GTATCACTTGGCTTGTTCCCGGAACGGATGGGACTAGATAGTGTGTAGCT
TCACTTGCATGCTGATAATTGGAGAGAAACTGTACCTATCTGCTTCTGGT
TTTTTTAGCTTTATGAAATGGTCAATCGTTTTACCTCTTGACAAAATTGC
TGGGAGCACACCTTTACACCATCACAAGTTACCCTCTCAAGTCACCTACA
TGAAGTCCATGCACTTAGATAGTAATCTACAGGCTTGATCCCTGCTATCC
AGCCTCGATCTGCAACACCCCCTCCATCCACCAAGAAAAAGCAAAGGGAA
TACAACAGCAGCAGCAGCAGCACAAAGCACGCCCGAATGAAACAGGCGGT
AGCTGCATAACACCGCAGCAGCCACGCAGGAAGCAGAGACACCGGGTGAG
CGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ch4:5618335..5621787- >KJC3_006417-T2 ID=KJC3_006417-T2|Name=KJC3_006417-T2|organism=Aspergillus niger KJC3|type=CDS|length=10098bp|location=Sequence derived from alignment at ch4:5618335..5621787- (Aspergillus niger KJC3)
AACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCA
GCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTG
GTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGT
GGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAA
CCGTCGCTGATGTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCC
AACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGG
TGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACGGTG
ATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGC
AAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCC
AGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAA
CGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTG
GCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGT
GGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCT
GAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCT
TCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGAC
GAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCG
CCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCG
AGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGT
TGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGG
TTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCAACG
CCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCC
CCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGG
AAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGG
GTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACT
CCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCG
TGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTT
TCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAG
ACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTC
TGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATCTGT
CGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAG
AAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGC
CAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCA
CTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGG
CGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGAACTCCAAGCAGGCTCG
TGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTC
TCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGC
TATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTT
CACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGATGTGCGC
GACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTA
CGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCA
TCACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAA
AGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGT
GGCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGG
CGGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTG
GTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGC
TACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGG
CGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGG
ATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCC
GATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCA
CGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCG
ACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGC
TTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTC
TGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGA
CCTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCC
CCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGC
CGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCC
GCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGAC
CTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGA
CATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTC
TGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGC
AAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGC
TACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACT
ACATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATC
ACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGAT
CAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCT
TCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAG
GACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACC
AGCGCGACTCCTACCGAACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTC
TCACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGC
TACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGG
CCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTG
CTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGATGTGCGCGACATCACACACGTTCT
CAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTA
GAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACT
GACACTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAA
CGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTT
CCCGTGGTATCGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACG
GTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGT
GGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTA
TGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCA
ACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCC
AAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTC
TCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGG
GAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCT
CAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGC
TATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCG
GTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCC
ATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCAT
TGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCG
AAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTAC
GGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGA
AGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTC
GCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGC
ATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGAT
TCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGG
TCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATT
GGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGT
CGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGA
TCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGC
ATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACT
TTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGA
ACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAG
CAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGG
TCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTG
GCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAAC
CGTCGCTGATGTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCA
ACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGT
GCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACGGTGA
TAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCA
AGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCCA
GAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAAC
GGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGG
CTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTG
GTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTG
AAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTT
CTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACG
AGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGC
CCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGA
GGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTT
GGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGT
TCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCAACGC
CCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCC
CCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGA
AAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGG
TCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTC
CCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGT
GTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTT
CGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGA
CCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCT
GACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATCTGTC
GGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGA
AGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCC
AACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCAC
TCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGGC
GGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGAACTCCAAGCAGGCTCGT
GACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCT
CGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCT
ATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTC
ACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGATGTGCGCG
ACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTAC
GTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCAT
CACCTTCTTTACCACTGACACTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAA
GAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTG
GCTACTGATGTGGCTTCCCGTGGTATCGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGC
GGCGGCTACGGTAACGGTAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGG
TGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCT
ACGGCGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGC
GGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGA
TCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCG
ATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCAC
GAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGA
CGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCT
TCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCT
GGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGAC
CTACTGTCTTCCTGCCATTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCC
CCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCC
GTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCG
CAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACC
TGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGAC
ATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCT
GGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCA
AGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCT
ACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTA
CATCCAGGTTAACATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCA
CTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATC
AAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTT
CACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGG
ACGGATGGCCGGCACTTTATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCA
GCGCGACTCCTACCGAACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCT
CACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCT
ACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGC
CGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGC
TCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGATGTGCGCGACATCACACACGTTCTC
AACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAG
AACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTG
ACACTATTCACGGTGATAAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAAC
GAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTGGCTTC
CCGTGGTATCGCTCCAGAAACGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGG
TAACGGTTACTCCAACGGCGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTG
GTTACGGCGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCGGCTAT
GGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAA
CCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCA
AGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCT
CAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGG
AAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTC
AATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCT
ATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGG
TATCGCTGAGACGGGTTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCA
TTGTTCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATT
GTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGA
AATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACG
GTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAGATCCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAA
GTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCG
CACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCA
TGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATT
CGCCCTGACCGTCAGACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGT
CCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAACATTG
GTTCCATGGATCTGTCGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTC
GTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGAT
CATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCA
TCGCTGACGAAATCACTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTT
TATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
| GO:0005524 | ATP binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_006417-T2.utr3p1 | KJC3_006417-T2.utr3p1 | Aspergillus niger KJC3 | three_prime_UTR |
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| KJC3_006417-T2.utr5p1 | KJC3_006417-T2.utr5p1 | Aspergillus niger KJC3 | five_prime_UTR |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR027417 |
| DBxref | InterPro:IPR014014 |
| DBxref | InterPro:IPR000629 |
| DBxref | InterPro:IPR011545 |
| DBxref | InterPro:IPR014001 |
| DBxref | InterPro:IPR001650 |
| DBxref | PFAM:PF00271 |
| DBxref | PFAM:PF00270 |
| Product | variant 2 |
| Product | ATP-dependent RNA helicase dbp2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| ch4 | supercontig | ch4:5618335..5621787 - |
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