|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851944.1:11..2039- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_125726-T1 ID=M747DRAFT_125726-T1|Name=M747DRAFT_125726-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2029bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851944.1:11..2039- (Aspergillus niger ATCC 13496) CTGGTGCCACCCGTTCCCGGGTTTCGCTTTCCTTAAATCCCCCGTCTTTT
CCCCGGCTTCTCCTGCGTCCTTCTCTTGCTCTCTCCGGTGGTTCCCCGAG
GTTTCTTTTTTCTTTCCCCCAGAATCTCCTGCCGTGAGCGGAACCAGCTG
GCATCATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTC
GGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGA
GACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATG
ATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGT
ATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGG
TTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCA
TCATCTGGTATGTATCTGACACCGCTGCACCGTTATCTCTGCTAACAATG
CATGGCTGTACAGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAAC
ATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTAT
CTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGTATGTCGGTCCC
ATAATGCCTGCTGCTGCATGCGGTGCTAATCATTTAGGCTCCTCCAACCA
AGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATC
CTGATCATGTTCTAGTAAGTCCTTATCCATCATCAGCTACCATGTCACAT
CTCACACGTGATGTAGCGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACG
GCGGCCTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATT
GTTCCTGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCA
AGGACCGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAG
GGAGACCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAG
CATGTGCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGT
TCAAGCCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATC
TGGTCTCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGAGTAAGTTTCTTTCGAGCCT
GTATAGGTAGTCAGCAATGCTAACCGGTTCACTTCTAGTGTACTACATCA
CCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCC
TCCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGT
GTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCGCTCT
TCATGATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGT
CATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGT
CATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCG
TAGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCG
GAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTC
AGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCAT
TTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACT
GCCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGAC
CCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACA
TCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACAC
ATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGAC
TATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGAGGTGGAT
GATTAGTGATCGGTAATGATGGAGGGGGG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851944.1:11..2039- >M747DRAFT_125726-T1 ID=M747DRAFT_125726-T1|Name=M747DRAFT_125726-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=8115bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851944.1:11..2039- (Aspergillus niger ATCC 13496) TGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAAC AACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGT GCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGA TCGGTTCGCTCTTCATGATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATG GCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGC CGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTA CCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGG GTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGC CCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTG TCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGT GTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGAC CACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATG GTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCG CGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGC TGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTG CTTGACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCG GATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTA TGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGG GAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAG CTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGT TTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAAC ATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTT GACTGGAATGAACGTCATGAGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTC GGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTAGTG CATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCG TCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTG CCAGTGTATATTTCGGAGATTATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGC GGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGA TGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCT CCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGC GAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGG GCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCC ATTCAGATCGGTTCCATCATCTGTGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCA TGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTAC GTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTG GGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCGCTCTTCATGATGATCTGGA TGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCC GGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCC CAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCA TCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTG CGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTT CAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGT GGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCAC ATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGA GGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCT GGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGC TTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGT CACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGACGTCTCCTATGGATGCAGCTTC ATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCC TGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCT GGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTC GTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGA AGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCT ACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTT TTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGAGCTCCTC CAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGG GGTATCCTGATCATGTTCTAGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTC CCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTG TGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTATGGCT ATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCT GTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCT ATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAG AGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTC CATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGG ACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGTGTA CTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACT TGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCG GCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGG TTCGCTCTTCATGATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCA GCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAG TCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTA CCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGT ACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTC TGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCC CCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCT TCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACG GGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTAT TCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCG GTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGT GGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTG ACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATT CCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGAT GCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGG AGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCT CCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGA GCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGC TTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACT GGAATGAACGTCATGAGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTC TGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTAGTGCATT GGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGG TCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAG TGTATATTTCGGAGATTATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCC ATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTC GGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTG TCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGT GTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTC GTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTC AGATCGGTTCCATCATCTGTGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGC CGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGA TCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGC CGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCGCTCTTCATGATGATCTGGATGTA CATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCG GTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGC AAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTC CTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTG TGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAAC TTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAA GGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTT TCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCC ATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAA GACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTG AAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACG GCTACTCCGGATAAGATTGCTTGACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCA AGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCC GTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCT GGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCC ACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAG ATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCT CGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCG TTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGAGCTCCTCCAAC CAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTA TCCTGATCATGTTCTAGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAG AACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGG TATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTATGGCTATCG GCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTC GGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCT CTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGG TCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATG GCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAG GCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGTGTACTAC ATCACCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGAT CTCCTCCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTC TGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCG CTCTTCATGATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTA CGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCT GGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTC TTCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCC GCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCA CTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCG GCATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTG TACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTA AGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCG TACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGC ACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGC AGACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGACGT CTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCT GGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTC CTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTG CCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCT TTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGC CAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAA CCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAA TGAACGTCATGAGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCA ACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTAGTGCATTGGAT CCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGT ATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTA TATTTCGGAGATTATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCG CCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCC ATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCAC TTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGC AGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTG ATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGAT CGGTTCCATCATCTG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016021 | integral component of membrane |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR036259 |
DBxref | InterPro:IPR020846 |
DBxref | InterPro:IPR005829 |
DBxref | InterPro:IPR005828 |
DBxref | InterPro:IPR003663 |
DBxref | PFAM:PF00083 |
DBxref | PFAM:PF07690 |
Product | sugar transporter |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851944.1 | supercontig | KZ851944.1:11..2039 - |
|