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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000001.1:681837..684718- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_56936-T1 ID=ASPNIDRAFT_56936-T1|Name=ASPNIDRAFT_56936-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2882bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000001.1:681837..684718- (Aspergillus niger ATCC 1015) CCTGTAGGTTAGTAAGTAGATAGACGTAGGGAGATTCTGACCTGTGCTGT
ACTTTGTTAGTACTGAAAGGGCTGAATGGCCAATAACAAAATACAGGGGC
CGACCCGAATGTTAGGCTATCTGTGTACAATCCGTGGATGAATGAGACCA
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TTGTGTCACATCACAACTCCTCCTCCTTTCGACCAAGACAACAACAAAAG
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TTAAGTGTTCGATCGCTCCCCAGATTCATTGACCATTGTCCTCATCCATT
GGTCATCTTATATATCAACAATACTCTTTTCTATTTCAGCCTACCGTCTC
GGTATAGCATCTTTTCACAATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCA
GGAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTG
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CCCTCCTGAGTTACAATGCGCGCCCCCCCATTCTAACGCGAAAGCCTCGT
CGCATAGGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAA
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GTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAG
TTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTC
GACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTC
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TACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCG
TTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCA
TGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTC
CAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGA
CCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGACTCCATTAGAGCGT
AAGTTTGCCGGAAATTACCTGGATAACGCGTGGCACCAGATGCTAACAGT
TCTGTGCAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCTTC
TCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCC
TCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTATCT
CCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCTCTGG
TCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCC
TGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCTTTTCCTGGGTGGATC
TTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTG
GTGACCAGGAGACTGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATG
GCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGA
GCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCA
GCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGGTC
TCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCT
GTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTC
TGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCAGC
TACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGAGGAAGTCGA
GCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGG
TCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAA
ATGGTGAAGCATGGAAATTTTTTTTTTTTTTTGCATGGTCATGAATATAA
AATGTTGGAAGCATTTTCACGCTTTTTGATACCTGCTACGCGATTTTAGA
GCATAGCCGGCCTCCCTGAGACCACGGTCTAGGGAGTTCTAATCGTTATT
ATTCCCCCCTGTCTGTTTTTTCTGTTACTTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000001.1:681837..684718- >ASPNIDRAFT_56936-T1 ID=ASPNIDRAFT_56936-T1|Name=ASPNIDRAFT_56936-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=8010bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000001.1:681837..684718- (Aspergillus niger ATCC 1015) GTCTGTTTTTTCTGTTACTTAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGA TACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATGGT TATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGCTG TCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTGAG AACTTCTCTCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTATCTT TGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCTTT TCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTGCC TGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACTGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCT GTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGT TGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACGCT GTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATCAC CCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGCCG TCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGACC GCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTACAC CGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCACCG ACGAGGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGC GACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCG CGAGTCGGAGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGAC AAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTAT TGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGC AGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACC TCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGG TCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTG CCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGG CGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGG CATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCG TCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCAT GACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGACTCCATTAGAGC AGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTC ACCGCGACCAAGAACAATCCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTA TGAGTTAGATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCC CTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGA TCGTCTGTTTTTTCTGTTACTTAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCG GATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATG GTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGC TGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTG AGAACTTCTCTCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTATC TTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCT TTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTG CCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACTGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGT CTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTG GTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACG CTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATC ACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGC CGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGA CCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTAC ACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCAC CGACGAGGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCA GCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCC CGCGAGTCGGAGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTG ACAAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATT ATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCT GCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACA CCTCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGT GGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGAT TGCCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGT GGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTC GGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCG CGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCC ATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGACTCCATTAGA GCAGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCT TCACCGCGACCAAGAACAATCCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTT TATGAGTTAGATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGT CCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTAT GATCGTCTGTTTTTTCTGTTACTTAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGT CGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTA TGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAAC GCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGAC TGAGAACTTCTCTCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTA TCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAG CTTTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTT TGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACTGCCAAGGGTGCTGTCTTCG GTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCC TGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAA CGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGA TCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTC GCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGA GACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTT ACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTC ACCGACGAGGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGC CAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCG CCCGCGAGTCGGAGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGG TGACAAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGA TTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTT CTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAA CACCTCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACC GTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCG ATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGT GTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCG TCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGAC CGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGAT CCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGACTCCATTA GAGCAGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCT CTTCACCGCGACCAAGAACAATCCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCG TTTATGAGTTAGATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACT GTCCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTT ATGATCGTCTGTTTTTTCTGTTACTTAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGGAT GTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCG TATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCA ACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAG ACTGAGAACTTCTCTCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGC TATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCA AGCTTTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACC TTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACTGCCAAGGGTGCTGTCTT CGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGC CCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCC AACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCAT GATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCT TCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCC GAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGG TTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGC TCACCGACGAGGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGT GCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAG CGCCCGCGAGTCGGAGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTC GGTGACAAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCAT GATTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGC TTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATG AACACCTCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAA CCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTG CGATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTG GTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCAT CGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGG ACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAG ATCCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGACTCCAT TAGAGCAGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGAC CTCTTCACCGCGACCAAGAACAATCCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATC CGTTTATGAGTTAGATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAA CTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGG TTATGATCGTCTGTTTTTTCTGTTACTTAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGG ATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGT CGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTG CAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACG AGACTGAGAACTTCTCTCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTAC GCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCG CAAGCTTTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCA CCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACTGCCAAGGGTGCTGTC TTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCT GCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGG CCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTC ATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTT CTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACC CCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAG GGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAA GCTCACCGACGAGGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAG GTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAAC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016021 | integral component of membrane |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR036259 |
DBxref | InterPro:IPR020846 |
DBxref | InterPro:IPR005829 |
DBxref | InterPro:IPR005828 |
DBxref | InterPro:IPR003663 |
DBxref | PFAM:PF00083 |
DBxref | PFAM:PF07690 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000001.1 | supercontig | ACJE01000001.1:681837..684718 - |
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