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ASPNIDRAFT_55637-T1, ASPNIDRAFT_55637-T1 (mRNA) Aspergillus niger ATCC 1015

Overview
NameASPNIDRAFT_55637-T1
Unique NameASPNIDRAFT_55637-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger ATCC 1015
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ACJE01000010.1:3214156..3216497+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ASPNIDRAFT_55637-T1 ID=ASPNIDRAFT_55637-T1|Name=ASPNIDRAFT_55637-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2342bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000010.1:3214156..3216497+ (Aspergillus niger ATCC 1015)
GCTGGTTTCCCTTCCTCCACCACATCTCCCCTCCTTCGGACTCATTGGAA AAGTGTTTCTTTTCTCTTGATCCGTCATCATGAGCTCCTTGGGCTTGCGG AGCCTAGCTCCCGCATCGAAGGTCTGTATCCGACTTCTTTTGCCGTGATG CCGAATTCTGGCTCACCATATTCTCCTCTATCCTCAATGGTCTTACTGAC TCCTCTTGTTGGCGCAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTC TCCTCTTCCCGCCCGGCTGGTACGCATTGAACTCGCACATCCGCCCCTGC CTACGTTTGCTAACTGGTCCCTCCGCTAGCCCGGATATTTGGCAACGGCC CTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATC ATTGTAAGCTACTATGTGGATATATCTTGTGGGAACGATGGTCGCTAATG CAATTGCAGGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGC CGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCT GTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGT GGTATCAACGCCGCTCTTGGAAAGTGAGTTGCCCTGTATTGACTCCATTG CGAGTGGCGCTAATGGTCTGGCTTGCAGCATGCACGAGGATGACTGGAGA TGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGA TGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTG AGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAG CGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTA CCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCC TCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTC GCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTA CAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCC TGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCAC ACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAA CCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTG GTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAAC TCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCT GGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGG GCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCAC CTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGC CTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGC CCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAG GTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTA CGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGG GTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCAC CGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTC CGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCG AGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATG CAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGT TGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGG ACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGT AACCTGTTGACCTGCGCGTATGTATTCCTGCAGAGTTTTGTAATGTTGGA TGTTGGCTAACTCGAGTTATAGTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAAC CGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGA CGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACG GTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAG AACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000010.1:3214156..3216497+

>ASPNIDRAFT_55637-T1 ID=ASPNIDRAFT_55637-T1|Name=ASPNIDRAFT_55637-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=11646bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000010.1:3214156..3216497+ (Aspergillus niger ATCC 1015)
ATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATTTCCCG
CGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGA
TATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCT
CAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGC
TGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCA
ACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCC
GCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGATGACTG
GAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACC
AGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAG
CTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTA
CCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGG
CCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCAC
ACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATA
CTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCG
CCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACC
GTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGC
TCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCC
CCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGT
GCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCT
CAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGG
ATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGT
GAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAG
CCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGA
CCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTC
CTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGG
TGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTC
TGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGT
CTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTC
TCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGA
GCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACC
GCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGC
CATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGG
GTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACC
AAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCT
TCGTAACCTGTTGACCTGCGCTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACC
GTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGAC
GACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGG
TGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGA
ACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGATGAGCTCC
TTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATTTCCCGCGCTTTGGG
CCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGATATTTGGCA
ACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTAC
CCTATCATTGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGC
CGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCT
GTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGT
GGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCA
CATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCA
TTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGC
TACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGC
GTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTT
GCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTAC
GGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCT
CGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACC
AGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCC
ACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTG
CACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGG
ATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGC
CTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGA
GGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCT
CCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGT
GGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCC
CGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTA
TCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACC
GTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCT
GACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTT
GCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCC
AACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGT
CCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACG
CTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGT
CCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTC
TGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGA
AGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGC
AGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCT
GTTGACCTGCGCTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGT
CCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAAC
TGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAA
GCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCA
AGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGATGAGCTCCTTGGGCTTG
CGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACG
TCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCTC
TGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATT
GACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCG
TGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTA
AGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAAC
GCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGA
CACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACA
TGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGC
CCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGG
TCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTG
CCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCT
CTCCGCCACAACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCT
GATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACG
GAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGT
TACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGA
CGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGT
TCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACC
GAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCG
TTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACG
TTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGT
CCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCT
CCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCG
GTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTAC
AACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGA
TGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGG
CCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTT
CTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACAT
TGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTC
AGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCC
ACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTC
CGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCG
CTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATC
TGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTG
CGCTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTG
CCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAG
CACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTA
CCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGC
CTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAGATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTA
GCTCCCGCATCGAAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTC
CTCTTCCCGCCCGGCTGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCA
AGGAGGCCGAAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAG
TACGATGCCGTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTT
CGGTCTGGCGGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCC
CCACGAGATCTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTT
GGAAACATGCACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAA
GGGTTCTGACTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAG
AAGCTCCCGCTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCC
CGTACCGAGGACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAA
GGAGTTTGGAAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACC
GTACCGGTCACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCAC
AACACCAACTACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGA
CGGCGAGTGCCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCC
ACCGTTTCAAGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGT
GCCTACTTCAGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGC
CATGGTCGCCCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGT
TCCACCCCACTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCC
CGTGGTGAGGGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGA
GCGTTACGCCCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCC
GTTCCATGACCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAG
GACCACATCTACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGA
GCGTCTGCCCGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATG
TCACCAAGCAGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGT
GGTATCCCCACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGG
CAACGACCAGGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTG
TCTCCGTCCACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTG
GTTGTCTTCGGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCC
TGGCAAGCCCCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTG
CCGACCTGGACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGAC
ATCCGCAGCGCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCG
TACCCAGGAGAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACC
AGATGTTCGACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCG
GATCTTGTTGAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCTTCCCA
AACCGCCATTGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCC
GTGAGGACTACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTC
ACCTGGCAGAAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGT
CGAGCACAACACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCA
AGCGTGTTTACTAGATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCA
TCGAAGATTTCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCG
CCCGGCTGCCCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCG
AAGGCTTCATTGCTCAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAGTACGATGCC
GTCGTCGTCGGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGC
GGAAGCTGGCTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGAT
CTCACACTGTCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATG
CACGAGGATGACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGA
CTGGCTGGGTGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCG
CTAGTGTTCGTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAG
GACGGCCGTATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGG
AAAGGGTGGCCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTC
ACGCCCTTCTCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAAC
TACTTCATCGAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTG
CCGCGGTATCATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCA
AGGCCCACCACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTC
AGTTGCACTTCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGC
CCGTGCCGGTCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCA
CTGGTATCTACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAG
GGTGGTTACCTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGC
CCCTACCGCCAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGA
CCCTGGAAATCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATC
TACCTCCAGCTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCC
CGGTATCTCCGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGC
AGCCCATCCCCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCC
ACCAAGTACACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCA
GGTTGTCCCTGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCC
ACGGTGCCAACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTC
GGCCGTGCCGTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCC
CCACAAGGAGCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGG
ACTTCGTCCGTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGC
GCCATGCAGAAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGA
GAGTTTGGATGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCG
ACCAGGTCGGTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTT
GAGACCCTTGAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCTTCCCAAACCGCCAT
TGCCGCCGCCAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACT
ACCCCGACCGTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAG
AAGAAGCCTCACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAA
CACTCTCGATGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTT
ACTAGATGAGCTCCTTGGGCTTGCGGAGCCTAGCTCCCGCATCGAAGATT
TCCCGCGCTTTGGGCCAGAGACGTCTCTTCTCCTCTTCCCGCCCGGCTGC
CCGGATATTTGGCAACGGCCCTCTGCGCGCCAAGGAGGCCGAAGGCTTCA
TTGCTCAGAAGTACCCTATCATTGACCACGAGTACGATGCCGTCGTCGTC
GGTGCTGGTGGTGCCGGTCTGCGTGCCGCTTTCGGTCTGGCGGAAGCTGG
CTTCAACACTGCCTGTGTTTCTAAGCTTTTCCCCACGAGATCTCACACTG
TCGCCGCTCAGGGTGGTATCAACGCCGCTCTTGGAAACATGCACGAGGAT
GACTGGAGATGGCACATGTACGACACCGTGAAGGGTTCTGACTGGCTGGG
TGACCAGGATGCCATTCACTACATGACCAGAGAAGCTCCCGCTAGTGTTC
GTGAGCTTGAGGGCTACGGTTGCCCCTTCTCCCGTACCGAGGACGGCCGT
ATCTACCAGCGTGCGTTCGGTGGTCAGTCGAAGGAGTTTGGAAAGGGTGG
CCAGGCCTACCGTTGCTGCGCTGCCGCTGACCGTACCGGTCACGCCCTTC
TCCACACCCTCTACGGACAGTCTCTCCGCCACAACACCAACTACTTCATC
GAATACTTCGCCCTCGACCTTCTGATGGAGGACGGCGAGTGCCGCGGTAT
CATCGCCTACAACCAGGAGGACGGAACCCTCCACCGTTTCAAGGCCCACC
ACACCGTCCTGGCCACCGGTGGTTACGGACGTGCCTACTTCAGTTGCACT
TCTGCTCACACTTGCACTGGTGACGGTATGGCCATGGTCGCCCGTGCCGG
TCTCCCCAACCAGGATCTGGAGTTCGTCCAGTTCCACCCCACTGGTATCT
ACGGTGCTGGTTGCCTGATCACCGAGGGTTCCCGTGGTGAGGGTGGTTAC
CTGCTCAACTCCGAGGGTGAGCGTTTCATGGAGCGTTACGCCCCTACCGC
CAAGGATCTGGCCTCCCGTGACGTTGTCTCCCGTTCCATGACCCTGGAAA
TCCGTGAGGGCCGTGGTGTCGGTCCCGAGAAGGACCACATCTACCTCCAG
CTGAGCCACCTGCCCGCTAAGCTCCTGCACGAGCGTCTGCCCGGTATCTC
CGAGACCGCCTCTATCTTCGCCGGTGTCGATGTCACCAAGCAGCCCATCC
CCGTCCTGCCCACCGTCCACTACAACATGGGTGGTATCCCCACCAAGTAC
ACCGGTGAGGTCCTGACCCAGGATGAGAACGGCAACGACCAGGTTGTCCC
TGGTCTGTACGCTTGCGGTGAGGCCGCTTGTGTCTCCGTCCACGGTGCCA
ACCGTCTGGGTGCCAACTCTCTTCTGGATCTGGTTGTCTTCGGCCGTGCC
GTCTCTCACCGTGTCCGTGACATTGCCACCCCTGGCAAGCCCCACAAGGA
GCTGAGCTCCGACGCTGGTGCTCAGTCCATTGCCGACCTGGACTTCGTCC
GTACCGCCGAGGGTCCCAAGTCCACCAACGACATCCGCAGCGCCATGCAG
AAGGCCATGCAGTCTGATGTTTCCGTCTTCCGTACCCAGGAGAGTTTGGA
TGAGGGTGTTGAGAAGGTCACCGCTATCGACCAGATGTTCGACCAGGTCG
GTACCAAGGACCGCAGCATGATCTGGAACTCGGATCTTGTTGAGACCCTT
GAGCTTCGTAACCTGTTGACCTGCGCTTCCCAAACCGCCATTGCCGCCGC
CAACCGTAAGGAGTCCCGTGGTGCCCACGCCCGTGAGGACTACCCCGACC
GTGACGACGAGAACTGGATGAAGCACACCCTCACCTGGCAGAAGAAGCCT
CACGGTGAGGTCAAGCTTGGCTACCGCGCCGTCGAGCACAACACTCTCGA
TGAGAACGAGTGCAAGTCGGTGCCTCCCTTCAAGCGTGTTTACTAG
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0016491oxidoreductase activity
GO:0050660flavin adenine dinucleotide binding
GO:0016627oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006099tricarboxylic acid cycle
GO:0055114oxidation-reduction process
GO:0022900electron transport chain
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
SDH1_1ASPNIDRAFT_55637Aspergillus niger ATCC 1015gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_55637-T1ASPNIDRAFT_55637-T1-proteinAspergillus niger ATCC 1015polypeptide


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_55637-T1.utr5p1ASPNIDRAFT_55637-T1.utr5p1Aspergillus niger ATCC 1015five_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_55637-T1.exon1ASPNIDRAFT_55637-T1.exon1Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_55637-T1.exon2ASPNIDRAFT_55637-T1.exon2Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_55637-T1.exon3ASPNIDRAFT_55637-T1.exon3Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_55637-T1.exon4ASPNIDRAFT_55637-T1.exon4Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_55637-T1.exon5ASPNIDRAFT_55637-T1.exon5Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_55637-T1.exon6ASPNIDRAFT_55637-T1.exon6Aspergillus niger ATCC 1015exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_55637-T1.cdsASPNIDRAFT_55637-T1.cdsAspergillus niger ATCC 1015CDS


Properties
Property NameValue
DBxrefInterPro:IPR037099
DBxrefInterPro:IPR003952
DBxrefInterPro:IPR027477
DBxrefInterPro:IPR011281
DBxrefInterPro:IPR015939
DBxrefInterPro:IPR014006
DBxrefInterPro:IPR036188
DBxrefInterPro:IPR003953
DBxrefPFAM:PF02910
DBxrefPFAM:PF00890
Productsuccinate dehydrogenase flavoprotein subunit
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger ATCC 1015 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ACJE01000010.1supercontigACJE01000010.1:3214156..3216497 +